RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580515.5

TSPOAP1-AS1-206, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 980 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.7■■■■■ 7.15
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.52■■■■■ 5.68
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 NACADO15069 1562 aa50.32■■■■■ 5.65
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.11■■■■■ 5.61
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.85■■■■■ 5.57
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.59■■■■■ 5.53
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.31■■■■■ 5.48
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.24■■■■■ 5.47
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.1■■■■■ 5.45
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.03■■■■■ 5.44
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SCRIBQ14160 1630 aa48.58■■■■■ 5.37
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.48■■■■■ 5.35
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.78■■■■■ 5.24
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.74■■■■■ 5.23
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.53■■■■■ 5.2
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SMARCA4P51532 1647 aa46.44■■■■■ 5.03
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.38■■■■■ 5.01
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 HMGXB3Q12766 1538 aa46.15■■■■■ 4.98
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.03■■■■■ 4.96
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.99■■■■■ 4.95
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.93■■■■■ 4.94
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ERCC6Q03468 1493 aa45.55■■■■■ 4.88
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 NESP48681 1621 aa45.52■■■■■ 4.88
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 WIZO95785 1651 aa45.44■■■■■ 4.86
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CUX2O14529 1486 aa45.34■■■■■ 4.85
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.31■■■■■ 4.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.26■■■■■ 4.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.07■■■■■ 4.81
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.04■■■■■ 4.8
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.95■■■■■ 4.79
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.91■■■■■ 4.78
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.73■■■■■ 4.75
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CFTRP13569 1480 aa44.67■■■■■ 4.74
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.6■■■■■ 4.73
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.53■■■■■ 4.72
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.53■■■■■ 4.72
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 WDR62O43379 1518 aa44.49■■■■■ 4.71
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.42■■■■■ 4.7
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PRDM2Q13029 1718 aa44.18■■■■■ 4.66
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.13■■■■■ 4.65
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TOPBP1Q92547 1522 aa43.74■■■■■ 4.59
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ABCC8Q09428 1581 aa43.72■■■■■ 4.59
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 IFT140Q96RY7 1462 aa43.64■■■■■ 4.58
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.63■■■■■ 4.58
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.48■■■■■ 4.55
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 OSCARQ8IYS5 282 aa43.36■■■■■ 4.53
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.34■■■■■ 4.53
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.32■■■■■ 4.53
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.27■■■■■ 4.52
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CUX1P39880 1505 aa43.17■■■■■ 4.5
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.17■■■■■ 4.5
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SOGA1O94964 1423 aa43.15■■■■■ 4.5
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.15■■■■■ 4.5
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.13■■■■■ 4.5
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 WDR97A6NE52 1622 aa42.95■■■■■ 4.47
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TRIM41Q8WV44 630 aa42.91■■■■■ 4.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CHD1O14646 1710 aa42.81■■■■■ 4.44
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 FBLN2P98095 1184 aa42.75■■■■■ 4.43
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.74■■■■■ 4.43
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 GRIN2BQ13224 1484 aa42.73■■■■■ 4.43
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.7■■■■■ 4.43
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.69■■■■■ 4.42
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.69■■■■■ 4.42
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.68■■■■■ 4.42
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.67■■■■■ 4.42
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.64■■■■■ 4.42
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TOP2BQ02880 1626 aa42.64■■■■■ 4.42
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ARHGEF11O15085 1522 aa42.63■■■■■ 4.42
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.63■■■■■ 4.41
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SYNJ1O43426 1573 aa42.58■■■■■ 4.41
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.57■■■■■ 4.4
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.56■■■■■ 4.4
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SYNJ2O15056 1496 aa42.53■■■■■ 4.4
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PBRM1Q86U86 1689 aa42.53■■■■■ 4.4
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.4■■■■■ 4.38
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.28■■■■■ 4.36
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ARAP1Q96P48 1450 aa42.24■■■■■ 4.35
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ADAMTS12P58397 1594 aa42.2■■■■■ 4.35
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.17■■■■■ 4.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.13■■■■■ 4.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 NUP160Q12769 1436 aa42.03■■■■■ 4.32
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CEP170Q5SW79 1584 aa41.97■■■■■ 4.31
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 KIF27Q86VH2 1401 aa41.83■■■■■ 4.29
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SHROOM2Q13796 1616 aa41.77■■■■■ 4.28
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 IGF1RP08069 1367 aa41.76■■■■■ 4.28
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.75■■■■■ 4.27
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CUL7Q14999 1698 aa41.64■■■■■ 4.26
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.62■■■■■ 4.25
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.59■■■■■ 4.25
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