RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579814.1

LIMD2-208, Transcript of LIM domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene LIMD2, Length 709 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD2-208ENST00000579814 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.97■■■■■ 7.83
LIMD2-208ENST00000579814 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa56.85■■■■■ 6.69
LIMD2-208ENST00000579814 ABCC9O60706 1549 aa56.22■■■■■ 6.59
LIMD2-208ENST00000579814 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.88■■■■■ 6.22
LIMD2-208ENST00000579814 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.83■■■■■ 6.21
LIMD2-208ENST00000579814 NACADO15069 1562 aa53.7■■■■■ 6.19
LIMD2-208ENST00000579814 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.27■■■■■ 6.12
LIMD2-208ENST00000579814 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.16■■■■■ 6.1
LIMD2-208ENST00000579814 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.87■■■■■ 6.05
LIMD2-208ENST00000579814 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP52.61■■■■■ 6.01
LIMD2-208ENST00000579814 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.33■■■■■ 5.97
LIMD2-208ENST00000579814 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.15■■■■■ 5.94
LIMD2-208ENST00000579814 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52.03■■■■■ 5.92
LIMD2-208ENST00000579814 SCRIBQ14160 1630 aa51.93■■■■■ 5.9
LIMD2-208ENST00000579814 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.64■■■■■ 5.86
LIMD2-208ENST00000579814 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.85■■■■■ 5.73
LIMD2-208ENST00000579814 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.73■■■■■ 5.71
LIMD2-208ENST00000579814 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.58■■■■■ 5.69
LIMD2-208ENST00000579814 NCAPD3P42695 1498 aa49.63■■■■■ 5.54
LIMD2-208ENST00000579814 SMARCA4P51532 1647 aa49.63■■■■■ 5.53
LIMD2-208ENST00000579814 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.58■■■■■ 5.53
LIMD2-208ENST00000579814 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.58■■■■■ 5.53
LIMD2-208ENST00000579814 SMARCA2P51531 1590 aa49.46■■■■■ 5.51
LIMD2-208ENST00000579814 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.28■■■■■ 5.48
LIMD2-208ENST00000579814 HMGXB3Q12766 1538 aa49.24■■■■■ 5.47
LIMD2-208ENST00000579814 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.15■■■■■ 5.46
LIMD2-208ENST00000579814 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.15■■■■■ 5.46
LIMD2-208ENST00000579814 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.66■■■■■ 5.38
LIMD2-208ENST00000579814 WIZO95785 1651 aa48.64■■■■■ 5.38
LIMD2-208ENST00000579814 ERCC6Q03468 1493 aa48.53■■■■■ 5.36
LIMD2-208ENST00000579814 NESP48681 1621 aa48.49■■■■■ 5.35
LIMD2-208ENST00000579814 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.28■■■■■ 5.32
LIMD2-208ENST00000579814 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.22■■■■■ 5.31
LIMD2-208ENST00000579814 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.16■■■■■ 5.3
LIMD2-208ENST00000579814 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.13■■■■■ 5.3
LIMD2-208ENST00000579814 CUX2O14529 1486 aa48.1■■■■■ 5.29
LIMD2-208ENST00000579814 CFTRP13569 1480 aa47.78■■■■■ 5.24
LIMD2-208ENST00000579814 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.72■■■■■ 5.23
LIMD2-208ENST00000579814 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.71■■■■■ 5.23
LIMD2-208ENST00000579814 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.68■■■■■ 5.22
LIMD2-208ENST00000579814 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.6■■■■■ 5.21
LIMD2-208ENST00000579814 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.57■■■■■ 5.21
LIMD2-208ENST00000579814 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.56■■■■■ 5.2
LIMD2-208ENST00000579814 WDR62O43379 1518 aa47.35■■■■■ 5.17
LIMD2-208ENST00000579814 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.29■■■■■ 5.16
LIMD2-208ENST00000579814 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.21■■■■■ 5.15
LIMD2-208ENST00000579814 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.09■■■■■ 5.13
LIMD2-208ENST00000579814 PRDM2Q13029 1718 aa47.05■■■■■ 5.12
LIMD2-208ENST00000579814 ABCC8Q09428 1581 aa46.8■■■■■ 5.08
LIMD2-208ENST00000579814 TOPBP1Q92547 1522 aa46.76■■■■■ 5.08
LIMD2-208ENST00000579814 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.62■■■■■ 5.05
LIMD2-208ENST00000579814 IFT140Q96RY7 1462 aa46.61■■■■■ 5.05
LIMD2-208ENST00000579814 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.38■■■■■ 5.02
LIMD2-208ENST00000579814 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.34■■■■■ 5.01
LIMD2-208ENST00000579814 SOGA1O94964 1423 aa46.26■■■■■ 5
LIMD2-208ENST00000579814 CUX1P39880 1505 aa46.23■■■■■ 4.99
LIMD2-208ENST00000579814 OSCARQ8IYS5 282 aa46.23■■■■■ 4.99
LIMD2-208ENST00000579814 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.19■■■■■ 4.98
LIMD2-208ENST00000579814 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.18■■■■■ 4.98
LIMD2-208ENST00000579814 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.18■■■■■ 4.98
LIMD2-208ENST00000579814 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.15■■■■■ 4.98
LIMD2-208ENST00000579814 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.06■■■■■ 4.96
LIMD2-208ENST00000579814 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.05■■■■■ 4.96
LIMD2-208ENST00000579814 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.9■■■■■ 4.94
LIMD2-208ENST00000579814 FBLN2P98095 1184 aa45.81■■■■■ 4.92
LIMD2-208ENST00000579814 WDR97A6NE52 1622 aa45.81■■■■■ 4.92
LIMD2-208ENST00000579814 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.72■■■■■ 4.91
LIMD2-208ENST00000579814 TOP2BQ02880 1626 aa45.7■■■■■ 4.91
LIMD2-208ENST00000579814 GRIN2BQ13224 1484 aa45.7■■■■■ 4.91
LIMD2-208ENST00000579814 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.66■■■■■ 4.9
LIMD2-208ENST00000579814 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.65■■■■■ 4.9
LIMD2-208ENST00000579814 SYNJ1O43426 1573 aa45.65■■■■■ 4.9
LIMD2-208ENST00000579814 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.63■■■■■ 4.89
LIMD2-208ENST00000579814 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.62■■■■■ 4.89
LIMD2-208ENST00000579814 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.59■■■■■ 4.89
LIMD2-208ENST00000579814 TRIM41Q8WV44 630 aa45.53■■■■■ 4.88
LIMD2-208ENST00000579814 CHD1O14646 1710 aa45.47■■■■■ 4.87
LIMD2-208ENST00000579814 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.44■■■■■ 4.86
LIMD2-208ENST00000579814 SYNJ2O15056 1496 aa45.43■■■■■ 4.86
LIMD2-208ENST00000579814 PBRM1Q86U86 1689 aa45.32■■■■■ 4.85
LIMD2-208ENST00000579814 ARHGEF11O15085 1522 aa45.26■■■■■ 4.84
LIMD2-208ENST00000579814 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.23■■■■■ 4.83
LIMD2-208ENST00000579814 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.23■■■■■ 4.83
LIMD2-208ENST00000579814 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.23■■■■■ 4.83
LIMD2-208ENST00000579814 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.14■■■■■ 4.82
LIMD2-208ENST00000579814 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.14■■■■■ 4.82
LIMD2-208ENST00000579814 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.1■■■■■ 4.81
LIMD2-208ENST00000579814 GRIN2AQ12879 1464 aa45.07■■■■■ 4.81
LIMD2-208ENST00000579814 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.07■■■■■ 4.81
LIMD2-208ENST00000579814 ADAMTS12P58397 1594 aa45.06■■■■■ 4.8
LIMD2-208ENST00000579814 KIF27Q86VH2 1401 aa45.01■■■■■ 4.8
LIMD2-208ENST00000579814 NUP160Q12769 1436 aa44.91■■■■■ 4.78
LIMD2-208ENST00000579814 IGF1RP08069 1367 aa44.9■■■■■ 4.78
LIMD2-208ENST00000579814 ARAP1Q96P48 1450 aa44.87■■■■■ 4.77
LIMD2-208ENST00000579814 CEP170Q5SW79 1584 aa44.78■■■■■ 4.76
LIMD2-208ENST00000579814 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.63■■■■■ 4.73
LIMD2-208ENST00000579814 JPH4Q96JJ6 628 aa44.6■■■■■ 4.73
LIMD2-208ENST00000579814 CUL7Q14999 1698 aa44.57■■■■■ 4.73
LIMD2-208ENST00000579814 SHROOM2Q13796 1616 aa44.46■■■■■ 4.71
LIMD2-208ENST00000579814 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP44.46■■■■■ 4.71
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