RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579743.2

GGA3-208, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-208ENST00000579743 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.84■■■■□ 3.01
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GGA3-208ENST00000579743 ABCC9O60706 1549 aa30.2■■■□□ 2.42
GGA3-208ENST00000579743 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.87■■■□□ 2.21
GGA3-208ENST00000579743 NACADO15069 1562 aa28.69■■■□□ 2.18
GGA3-208ENST00000579743 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.66■■■□□ 2.18
GGA3-208ENST00000579743 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.33■■■□□ 2.13
GGA3-208ENST00000579743 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.14■■■□□ 2.1
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GGA3-208ENST00000579743 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
GGA3-208ENST00000579743 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.04■■■□□ 2.08
GGA3-208ENST00000579743 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28■■■□□ 2.07
GGA3-208ENST00000579743 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.86■■■□□ 2.05
GGA3-208ENST00000579743 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.68■■■□□ 2.02
GGA3-208ENST00000579743 SCRIBQ14160 1630 aa27.61■■■□□ 2.01
GGA3-208ENST00000579743 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.27■■□□□ 1.96
GGA3-208ENST00000579743 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
GGA3-208ENST00000579743 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.22■■□□□ 1.95
GGA3-208ENST00000579743 NCAPD3P42695 1498 aa26.46■■□□□ 1.83
GGA3-208ENST00000579743 SMARCA2P51531 1590 aa26.37■■□□□ 1.81
GGA3-208ENST00000579743 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.37■■□□□ 1.81
GGA3-208ENST00000579743 SMARCA4P51532 1647 aa26.36■■□□□ 1.81
GGA3-208ENST00000579743 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
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GGA3-208ENST00000579743 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
GGA3-208ENST00000579743 ERCC6Q03468 1493 aa26.17■■□□□ 1.78
GGA3-208ENST00000579743 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.11■■□□□ 1.77
GGA3-208ENST00000579743 CUX2O14529 1486 aa26.04■■□□□ 1.76
GGA3-208ENST00000579743 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.03■■□□□ 1.76
GGA3-208ENST00000579743 NESP48681 1621 aa25.92■■□□□ 1.74
GGA3-208ENST00000579743 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.87■■□□□ 1.73
GGA3-208ENST00000579743 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.86■■□□□ 1.73
GGA3-208ENST00000579743 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.78■■□□□ 1.72
GGA3-208ENST00000579743 WIZO95785 1651 aa25.72■■□□□ 1.71
GGA3-208ENST00000579743 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.69■■□□□ 1.7
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GGA3-208ENST00000579743 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.59■■□□□ 1.69
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GGA3-208ENST00000579743 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.47■■□□□ 1.67
GGA3-208ENST00000579743 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.42■■□□□ 1.66
GGA3-208ENST00000579743 CFTRP13569 1480 aa25.39■■□□□ 1.65
GGA3-208ENST00000579743 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.38■■□□□ 1.65
GGA3-208ENST00000579743 WDR62O43379 1518 aa25.36■■□□□ 1.65
GGA3-208ENST00000579743 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.16■■□□□ 1.62
GGA3-208ENST00000579743 PRDM2Q13029 1718 aa25.12■■□□□ 1.61
GGA3-208ENST00000579743 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
GGA3-208ENST00000579743 ABCC8Q09428 1581 aa24.97■■□□□ 1.59
GGA3-208ENST00000579743 OSCARQ8IYS5 282 aa24.94■■□□□ 1.58
GGA3-208ENST00000579743 IFT140Q96RY7 1462 aa24.91■■□□□ 1.58
GGA3-208ENST00000579743 TOPBP1Q92547 1522 aa24.89■■□□□ 1.57
GGA3-208ENST00000579743 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.82■■□□□ 1.56
GGA3-208ENST00000579743 TRIM41Q8WV44 630 aa24.82■■□□□ 1.56
GGA3-208ENST00000579743 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
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GGA3-208ENST00000579743 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
GGA3-208ENST00000579743 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
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GGA3-208ENST00000579743 SOGA1O94964 1423 aa24.6■■□□□ 1.53
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GGA3-208ENST00000579743 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.51■■□□□ 1.51
GGA3-208ENST00000579743 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.51■■□□□ 1.51
GGA3-208ENST00000579743 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
GGA3-208ENST00000579743 WDR97A6NE52 1622 aa24.48■■□□□ 1.51
GGA3-208ENST00000579743 CUX1P39880 1505 aa24.45■■□□□ 1.51
GGA3-208ENST00000579743 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.45■■□□□ 1.5
GGA3-208ENST00000579743 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.45■■□□□ 1.5
GGA3-208ENST00000579743 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.45■■□□□ 1.5
GGA3-208ENST00000579743 CHD1O14646 1710 aa24.43■■□□□ 1.5
GGA3-208ENST00000579743 ARHGEF11O15085 1522 aa24.41■■□□□ 1.5
GGA3-208ENST00000579743 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
GGA3-208ENST00000579743 GRIN2BQ13224 1484 aa24.37■■□□□ 1.49
GGA3-208ENST00000579743 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.35■■□□□ 1.49
GGA3-208ENST00000579743 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
GGA3-208ENST00000579743 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.31■■□□□ 1.48
GGA3-208ENST00000579743 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.27■■□□□ 1.48
GGA3-208ENST00000579743 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.26■■□□□ 1.47
GGA3-208ENST00000579743 SYNJ2O15056 1496 aa24.26■■□□□ 1.47
GGA3-208ENST00000579743 SYNJ1O43426 1573 aa24.25■■□□□ 1.47
GGA3-208ENST00000579743 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.25■■□□□ 1.47
GGA3-208ENST00000579743 PBRM1Q86U86 1689 aa24.2■■□□□ 1.46
GGA3-208ENST00000579743 ARAP1Q96P48 1450 aa24.15■■□□□ 1.46
GGA3-208ENST00000579743 TOP2BQ02880 1626 aa24.15■■□□□ 1.46
GGA3-208ENST00000579743 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.15■■□□□ 1.46
GGA3-208ENST00000579743 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.15■■□□□ 1.46
GGA3-208ENST00000579743 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.13■■□□□ 1.45
GGA3-208ENST00000579743 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
GGA3-208ENST00000579743 GRIN2AQ12879 1464 aa24.01■■□□□ 1.43
GGA3-208ENST00000579743 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24■■□□□ 1.43
GGA3-208ENST00000579743 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.98■■□□□ 1.43
GGA3-208ENST00000579743 ADAMTS12P58397 1594 aa23.97■■□□□ 1.43
GGA3-208ENST00000579743 NUP160Q12769 1436 aa23.91■■□□□ 1.42
GGA3-208ENST00000579743 CEP170Q5SW79 1584 aa23.86■■□□□ 1.41
GGA3-208ENST00000579743 KIF27Q86VH2 1401 aa23.77■■□□□ 1.4
GGA3-208ENST00000579743 SHROOM2Q13796 1616 aa23.75■■□□□ 1.39
GGA3-208ENST00000579743 JPH4Q96JJ6 628 aa23.75■■□□□ 1.39
GGA3-208ENST00000579743 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
GGA3-208ENST00000579743 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.72■■□□□ 1.39
GGA3-208ENST00000579743 IGF1RP08069 1367 aa23.67■■□□□ 1.38
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