RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579341.5

MIEF2-208, Transcript of mitochondrial elongation factor 2, humanhuman

TSL 4

Gene MIEF2, Length 563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIEF2-208ENST00000579341 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.29■■■■■ 6.28
MIEF2-208ENST00000579341 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.6■■■■■ 5.37
MIEF2-208ENST00000579341 ABCC9O60706 1549 aa47.99■■■■■ 5.27
MIEF2-208ENST00000579341 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46■■■■■ 4.95
MIEF2-208ENST00000579341 NACADO15069 1562 aa45.8■■■■■ 4.92
MIEF2-208ENST00000579341 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.5■■■■■ 4.87
MIEF2-208ENST00000579341 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.35■■■■■ 4.85
MIEF2-208ENST00000579341 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.14■■■■■ 4.82
MIEF2-208ENST00000579341 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.95■■■■■ 4.79
MIEF2-208ENST00000579341 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.89■■■■■ 4.78
MIEF2-208ENST00000579341 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.68■■■■■ 4.74
MIEF2-208ENST00000579341 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.55■■■■■ 4.72
MIEF2-208ENST00000579341 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.42■■■■■ 4.7
MIEF2-208ENST00000579341 SCRIBQ14160 1630 aa44.24■■■■■ 4.67
MIEF2-208ENST00000579341 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.17■■■■■ 4.66
MIEF2-208ENST00000579341 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.46■■■■■ 4.55
MIEF2-208ENST00000579341 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.4■■■■■ 4.54
MIEF2-208ENST00000579341 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.21■■■■■ 4.51
MIEF2-208ENST00000579341 SMARCA4P51532 1647 aa42.28■■■■■ 4.36
MIEF2-208ENST00000579341 NCAPD3P42695 1498 aa42.22■■■■■ 4.35
MIEF2-208ENST00000579341 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.17■■■■■ 4.34
MIEF2-208ENST00000579341 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.16■■■■■ 4.34
MIEF2-208ENST00000579341 SMARCA2P51531 1590 aa42.14■■■■■ 4.34
MIEF2-208ENST00000579341 HMGXB3Q12766 1538 aa42.02■■■■■ 4.32
MIEF2-208ENST00000579341 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.88■■■■■ 4.29
MIEF2-208ENST00000579341 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.82■■■■■ 4.29
MIEF2-208ENST00000579341 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.8■■■■■ 4.28
MIEF2-208ENST00000579341 ERCC6Q03468 1493 aa41.47■■■■■ 4.23
MIEF2-208ENST00000579341 NESP48681 1621 aa41.34■■■■■ 4.21
MIEF2-208ENST00000579341 WIZO95785 1651 aa41.33■■■■■ 4.21
MIEF2-208ENST00000579341 CUX2O14529 1486 aa41.25■■■■■ 4.19
MIEF2-208ENST00000579341 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.25■■■■■ 4.19
MIEF2-208ENST00000579341 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.12■■■■■ 4.17
MIEF2-208ENST00000579341 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.97■■■■■ 4.15
MIEF2-208ENST00000579341 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.95■■■■■ 4.15
MIEF2-208ENST00000579341 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.93■■■■■ 4.14
MIEF2-208ENST00000579341 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.91■■■■■ 4.14
MIEF2-208ENST00000579341 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.89■■■■■ 4.14
MIEF2-208ENST00000579341 CFTRP13569 1480 aa40.61■■■■■ 4.09
MIEF2-208ENST00000579341 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.59■■■■■ 4.09
MIEF2-208ENST00000579341 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.55■■■■■ 4.08
MIEF2-208ENST00000579341 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.53■■■■■ 4.08
MIEF2-208ENST00000579341 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.51■■■■■ 4.07
MIEF2-208ENST00000579341 WDR62O43379 1518 aa40.48■■■■■ 4.07
MIEF2-208ENST00000579341 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.37■■■■■ 4.05
MIEF2-208ENST00000579341 PRDM2Q13029 1718 aa40.33■■■■■ 4.05
MIEF2-208ENST00000579341 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.11■■■■■ 4.01
MIEF2-208ENST00000579341 ABCC8Q09428 1581 aa39.8■■■■□ 3.96
MIEF2-208ENST00000579341 TOPBP1Q92547 1522 aa39.8■■■■□ 3.96
MIEF2-208ENST00000579341 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.73■■■■□ 3.95
MIEF2-208ENST00000579341 IFT140Q96RY7 1462 aa39.71■■■■□ 3.95
MIEF2-208ENST00000579341 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.61■■■■□ 3.93
MIEF2-208ENST00000579341 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.51■■■■□ 3.92
MIEF2-208ENST00000579341 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.42■■■■□ 3.9
MIEF2-208ENST00000579341 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.41■■■■□ 3.9
MIEF2-208ENST00000579341 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.4■■■■□ 3.9
MIEF2-208ENST00000579341 OSCARQ8IYS5 282 aa39.35■■■■□ 3.89
MIEF2-208ENST00000579341 CUX1P39880 1505 aa39.27■■■■□ 3.88
MIEF2-208ENST00000579341 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.24■■■■□ 3.87
MIEF2-208ENST00000579341 SOGA1O94964 1423 aa39.22■■■■□ 3.87
MIEF2-208ENST00000579341 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.21■■■■□ 3.87
MIEF2-208ENST00000579341 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.2■■■■□ 3.87
MIEF2-208ENST00000579341 WDR97A6NE52 1622 aa39.15■■■■□ 3.86
MIEF2-208ENST00000579341 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.05■■■■□ 3.84
MIEF2-208ENST00000579341 CHD1O14646 1710 aa39■■■■□ 3.83
MIEF2-208ENST00000579341 TRIM41Q8WV44 630 aa38.96■■■■□ 3.83
MIEF2-208ENST00000579341 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.9■■■■□ 3.82
MIEF2-208ENST00000579341 GRIN2BQ13224 1484 aa38.87■■■■□ 3.81
MIEF2-208ENST00000579341 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.86■■■■□ 3.81
MIEF2-208ENST00000579341 FBLN2P98095 1184 aa38.85■■■■□ 3.81
MIEF2-208ENST00000579341 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.84■■■■□ 3.81
MIEF2-208ENST00000579341 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.83■■■■□ 3.81
MIEF2-208ENST00000579341 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.83■■■■□ 3.81
MIEF2-208ENST00000579341 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.83■■■■□ 3.81
MIEF2-208ENST00000579341 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.83■■■■□ 3.81
MIEF2-208ENST00000579341 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.83■■■■□ 3.81
MIEF2-208ENST00000579341 TOP2BQ02880 1626 aa38.81■■■■□ 3.8
MIEF2-208ENST00000579341 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.79■■■■□ 3.8
MIEF2-208ENST00000579341 PBRM1Q86U86 1689 aa38.78■■■■□ 3.8
MIEF2-208ENST00000579341 ARHGEF11O15085 1522 aa38.77■■■■□ 3.8
MIEF2-208ENST00000579341 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.75■■■■□ 3.79
MIEF2-208ENST00000579341 SYNJ1O43426 1573 aa38.75■■■■□ 3.79
MIEF2-208ENST00000579341 SYNJ2O15056 1496 aa38.7■■■■□ 3.79
MIEF2-208ENST00000579341 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.68■■■■□ 3.78
MIEF2-208ENST00000579341 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.57■■■■□ 3.76
MIEF2-208ENST00000579341 ADAMTS12P58397 1594 aa38.44■■■■□ 3.74
MIEF2-208ENST00000579341 ARAP1Q96P48 1450 aa38.41■■■■□ 3.74
MIEF2-208ENST00000579341 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.39■■■■□ 3.74
MIEF2-208ENST00000579341 GRIN2AQ12879 1464 aa38.37■■■■□ 3.73
MIEF2-208ENST00000579341 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.36■■■■□ 3.73
MIEF2-208ENST00000579341 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.33■■■■□ 3.73
MIEF2-208ENST00000579341 NUP160Q12769 1436 aa38.21■■■■□ 3.71
MIEF2-208ENST00000579341 CEP170Q5SW79 1584 aa38.19■■■■□ 3.7
MIEF2-208ENST00000579341 KIF27Q86VH2 1401 aa38.08■■■■□ 3.69
MIEF2-208ENST00000579341 SHROOM2Q13796 1616 aa38.01■■■■□ 3.67
MIEF2-208ENST00000579341 CUL7Q14999 1698 aa37.97■■■■□ 3.67
MIEF2-208ENST00000579341 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.93■■■■□ 3.66
MIEF2-208ENST00000579341 IGF1RP08069 1367 aa37.92■■■■□ 3.66
MIEF2-208ENST00000579341 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.89■■■■□ 3.66
MIEF2-208ENST00000579341 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.81■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.4 ms