RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578334.5

TSPOAP1-AS1-202, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 956 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NISCHQ9Y2I1 1504 aa70.36■■■■■ 8.85
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa63.04■■■■■ 7.68
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ABCC9O60706 1549 aa62.86■■■■■ 7.65
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa59.93■■■■■ 7.18
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NACADO15069 1562 aa59.55■■■■■ 7.12
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DCAF8L2P0C7V8 631 aa59.37■■■■■ 7.09
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MYO15BQ96JP2 1530 aa58.77■■■■■ 7
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DNAJC5BQ9UF47 199 aa58.71■■■■■ 6.99
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 UNC13AQ9UPW8 1703 aa58.58■■■■■ 6.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP58.57■■■■■ 6.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP58.36■■■■■ 6.93
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 BICRAQ9NZM4 1560 aa58.14■■■■■ 6.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa58.11■■■■■ 6.89
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SCRIBQ14160 1630 aa57.51■■■■■ 6.8
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa57.38■■■■■ 6.78
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa56.78■■■■■ 6.68
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP56.72■■■■■ 6.67
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CECR2Q9BXF3 1484 aa56.6■■■■■ 6.65
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NCAPD3P42695 1498 aa54.95■■■■■ 6.39
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SMARCA4P51532 1647 aa54.85■■■■■ 6.37
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa54.84■■■■■ 6.37
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SMARCA2P51531 1590 aa54.71■■■■■ 6.35
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP54.62■■■■■ 6.33
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HMGXB3Q12766 1538 aa54.59■■■■■ 6.33
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP54.35■■■■■ 6.29
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ERCC6Q03468 1493 aa54.29■■■■■ 6.28
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PEG3Q9GZU2 1588 aa54.29■■■■■ 6.28
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MROH2BQ7Z745 1585 aa54.23■■■■■ 6.27
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CUX2O14529 1486 aa54.06■■■■■ 6.24
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NESP48681 1621 aa54.06■■■■■ 6.24
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa53.75■■■■■ 6.2
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa53.71■■■■■ 6.19
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 WIZO95785 1651 aa53.61■■■■■ 6.17
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP53.45■■■■■ 6.15
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PDS5BQ9NTI5 1447 aa53.4■■■■■ 6.14
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa53.38■■■■■ 6.14
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CADPSQ9ULU8 1353 aa53.32■■■■■ 6.13
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP53.18■■■■■ 6.1
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP52.94■■■■■ 6.07
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MRC2Q9UBG0 1479 aa52.93■■■■■ 6.06
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CEP164Q9UPV0 1460 aa52.78■■■■■ 6.04
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 WDR62O43379 1518 aa52.77■■■■■ 6.04
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CFTRP13569 1480 aa52.75■■■■■ 6.03
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FANCD2Q9BXW9 1451 aa52.74■■■■■ 6.03
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CCDC88BA6NC98 1476 aa52.33■■■■■ 5.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PRDM2Q13029 1718 aa52.27■■■■■ 5.96
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP52.27■■■■■ 5.96
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TOPBP1Q92547 1522 aa51.75■■■■■ 5.88
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 IFT140Q96RY7 1462 aa51.7■■■■■ 5.87
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ABCC8Q09428 1581 aa51.65■■■■■ 5.86
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OSCARQ8IYS5 282 aa51.64■■■■■ 5.86
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP51.59■■■■■ 5.85
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DNMBPQ6XZF7 1577 aa51.59■■■■■ 5.85
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TRIM41Q8WV44 630 aa51.58■■■■■ 5.85
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP51.34■■■■■ 5.81
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP51.26■■■■■ 5.8
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP51.24■■■■■ 5.79
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP51.16■■■■■ 5.78
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP51.07■■■■■ 5.77
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa51.06■■■■■ 5.76
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SOGA1O94964 1423 aa51.02■■■■■ 5.76
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FGD5Q6ZNL6 1462 aa50.97■■■■■ 5.75
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa50.96■■■■■ 5.75
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa50.96■■■■■ 5.75
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa50.96■■■■■ 5.75
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CUX1P39880 1505 aa50.94■■■■■ 5.75
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CHD1O14646 1710 aa50.93■■■■■ 5.74
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP50.9■■■■■ 5.74
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FBLN2P98095 1184 aa50.84■■■■■ 5.73
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ARHGEF11O15085 1522 aa50.82■■■■■ 5.73
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 WDR97A6NE52 1622 aa50.76■■■■■ 5.72
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa50.66■■■■■ 5.7
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 GRIN2BQ13224 1484 aa50.55■■■■■ 5.68
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP50.52■■■■■ 5.68
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP50.47■■■■■ 5.67
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CYB5RLQ6IPT4 315 aa50.45■■■■■ 5.67
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 GAPVD1Q14C86 1478 aa50.4■■■■■ 5.66
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PBRM1Q86U86 1689 aa50.39■■■■■ 5.66
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa50.37■■■■■ 5.65
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SYNJ2O15056 1496 aa50.35■■■■■ 5.65
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SYNJ1O43426 1573 aa50.34■■■■■ 5.65
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ARAP1Q96P48 1450 aa50.33■■■■■ 5.65
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CLASP1Q7Z460 1538 aa50.31■■■■■ 5.65
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa50.29■■■■■ 5.64
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP50.24■■■■■ 5.63
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TOP2BQ02880 1626 aa50.19■■■■■ 5.63
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa50.19■■■■■ 5.63
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ADAMTS12P58397 1594 aa49.91■■■■■ 5.58
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 GRIN2AQ12879 1464 aa49.9■■■■■ 5.58
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TRHP20396 242 aaPredicted RBP49.85■■■■■ 5.57
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FHAD1B1AJZ9 1412 aa49.77■■■■■ 5.56
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ERICH3Q5RHP9 1530 aa49.75■■■■■ 5.56
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CEP170Q5SW79 1584 aa49.71■■■■■ 5.55
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NUP160Q12769 1436 aa49.7■■■■■ 5.55
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ERCC6L2Q5T890 1561 aa49.56■■■■■ 5.52
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SHROOM2Q13796 1616 aa49.45■■■■■ 5.51
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP49.24■■■■■ 5.47
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KIF27Q86VH2 1401 aa49.23■■■■■ 5.47
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 JPH4Q96JJ6 628 aa49.21■■■■■ 5.47
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa49.2■■■■■ 5.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.3 ms