RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577435.5

GGA3-203, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 547 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-203ENST00000577435 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.15■■■■□ 3.06
GGA3-203ENST00000577435 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.4■■■□□ 2.46
GGA3-203ENST00000577435 ABCC9O60706 1549 aa29.82■■■□□ 2.36
GGA3-203ENST00000577435 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.67■■■□□ 2.18
GGA3-203ENST00000577435 NACADO15069 1562 aa28.64■■■□□ 2.18
GGA3-203ENST00000577435 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.54■■■□□ 2.16
GGA3-203ENST00000577435 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.48■■■□□ 2.15
GGA3-203ENST00000577435 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
GGA3-203ENST00000577435 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.29■■■□□ 2.12
GGA3-203ENST00000577435 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.01■■■□□ 2.07
GGA3-203ENST00000577435 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.86■■■□□ 2.05
GGA3-203ENST00000577435 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.81■■■□□ 2.04
GGA3-203ENST00000577435 SCRIBQ14160 1630 aa27.66■■■□□ 2.02
GGA3-203ENST00000577435 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.55■■■□□ 2
GGA3-203ENST00000577435 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.55■■■□□ 2
GGA3-203ENST00000577435 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
GGA3-203ENST00000577435 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.99■■□□□ 1.91
GGA3-203ENST00000577435 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.83■■□□□ 1.89
GGA3-203ENST00000577435 SMARCA4P51532 1647 aa26.5■■□□□ 1.83
GGA3-203ENST00000577435 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
GGA3-203ENST00000577435 NCAPD3P42695 1498 aa26.45■■□□□ 1.82
GGA3-203ENST00000577435 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.42■■□□□ 1.82
GGA3-203ENST00000577435 SMARCA2P51531 1590 aa26.37■■□□□ 1.81
GGA3-203ENST00000577435 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.29■■□□□ 1.8
GGA3-203ENST00000577435 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.29■■□□□ 1.8
GGA3-203ENST00000577435 HMGXB3Q12766 1538 aa26.27■■□□□ 1.8
GGA3-203ENST00000577435 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
GGA3-203ENST00000577435 WIZO95785 1651 aa25.98■■□□□ 1.75
GGA3-203ENST00000577435 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
GGA3-203ENST00000577435 NESP48681 1621 aa25.77■■□□□ 1.72
GGA3-203ENST00000577435 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.73■■□□□ 1.71
GGA3-203ENST00000577435 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
GGA3-203ENST00000577435 ERCC6Q03468 1493 aa25.7■■□□□ 1.7
GGA3-203ENST00000577435 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.66■■□□□ 1.7
GGA3-203ENST00000577435 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.58■■□□□ 1.69
GGA3-203ENST00000577435 CUX2O14529 1486 aa25.53■■□□□ 1.68
GGA3-203ENST00000577435 CFTRP13569 1480 aa25.47■■□□□ 1.67
GGA3-203ENST00000577435 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.45■■□□□ 1.67
GGA3-203ENST00000577435 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.44■■□□□ 1.66
GGA3-203ENST00000577435 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
GGA3-203ENST00000577435 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.33■■□□□ 1.65
GGA3-203ENST00000577435 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.29■■□□□ 1.64
GGA3-203ENST00000577435 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.28■■□□□ 1.64
GGA3-203ENST00000577435 PRDM2Q13029 1718 aa25.24■■□□□ 1.63
GGA3-203ENST00000577435 WDR62O43379 1518 aa25.22■■□□□ 1.63
GGA3-203ENST00000577435 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
GGA3-203ENST00000577435 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
GGA3-203ENST00000577435 ABCC8Q09428 1581 aa24.96■■□□□ 1.59
GGA3-203ENST00000577435 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.93■■□□□ 1.58
GGA3-203ENST00000577435 TOPBP1Q92547 1522 aa24.91■■□□□ 1.58
GGA3-203ENST00000577435 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.86■■□□□ 1.57
GGA3-203ENST00000577435 IFT140Q96RY7 1462 aa24.8■■□□□ 1.56
GGA3-203ENST00000577435 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
GGA3-203ENST00000577435 CUX1P39880 1505 aa24.66■■□□□ 1.54
GGA3-203ENST00000577435 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
GGA3-203ENST00000577435 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
GGA3-203ENST00000577435 SOGA1O94964 1423 aa24.61■■□□□ 1.53
GGA3-203ENST00000577435 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.6■■□□□ 1.53
GGA3-203ENST00000577435 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.57■■□□□ 1.52
GGA3-203ENST00000577435 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
GGA3-203ENST00000577435 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.53■■□□□ 1.522e-10■■■■□ 26.7
GGA3-203ENST00000577435 OSCARQ8IYS5 282 aa24.49■■□□□ 1.51
GGA3-203ENST00000577435 WDR97A6NE52 1622 aa24.48■■□□□ 1.51
GGA3-203ENST00000577435 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.48■■□□□ 1.51
GGA3-203ENST00000577435 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
GGA3-203ENST00000577435 TOP2BQ02880 1626 aa24.43■■□□□ 1.5
GGA3-203ENST00000577435 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.43■■□□□ 1.5
GGA3-203ENST00000577435 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.4■■□□□ 1.5
GGA3-203ENST00000577435 SYNJ1O43426 1573 aa24.39■■□□□ 1.5
GGA3-203ENST00000577435 GRIN2BQ13224 1484 aa24.32■■□□□ 1.48
GGA3-203ENST00000577435 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.31■■□□□ 1.48
GGA3-203ENST00000577435 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
GGA3-203ENST00000577435 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.27■■□□□ 1.48
GGA3-203ENST00000577435 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.26■■□□□ 1.47
GGA3-203ENST00000577435 CHD1O14646 1710 aa24.26■■□□□ 1.47
GGA3-203ENST00000577435 FBLN2P98095 1184 aa24.23■■□□□ 1.47
GGA3-203ENST00000577435 PBRM1Q86U86 1689 aa24.22■■□□□ 1.47
GGA3-203ENST00000577435 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
GGA3-203ENST00000577435 SYNJ2O15056 1496 aa24.18■■□□□ 1.46
GGA3-203ENST00000577435 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.1■■□□□ 1.45
GGA3-203ENST00000577435 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.04■■□□□ 1.44
GGA3-203ENST00000577435 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.03■■□□□ 1.44
GGA3-203ENST00000577435 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.03■■□□□ 1.44
GGA3-203ENST00000577435 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.03■■□□□ 1.44
GGA3-203ENST00000577435 ARHGEF11O15085 1522 aa24.03■■□□□ 1.44
GGA3-203ENST00000577435 ADAMTS12P58397 1594 aa24.03■■□□□ 1.44
GGA3-203ENST00000577435 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.02■■□□□ 1.44
GGA3-203ENST00000577435 GRIN2AQ12879 1464 aa24■■□□□ 1.43
GGA3-203ENST00000577435 KIF27Q86VH2 1401 aa23.99■■□□□ 1.43
GGA3-203ENST00000577435 TRIM41Q8WV44 630 aa23.96■■□□□ 1.43
GGA3-203ENST00000577435 IGF1RP08069 1367 aa23.94■■□□□ 1.42
GGA3-203ENST00000577435 NUP160Q12769 1436 aa23.93■■□□□ 1.42
GGA3-203ENST00000577435 CEP170Q5SW79 1584 aa23.86■■□□□ 1.41
GGA3-203ENST00000577435 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.83■■□□□ 1.41
GGA3-203ENST00000577435 CUL7Q14999 1698 aa23.83■■□□□ 1.4
GGA3-203ENST00000577435 ARAP1Q96P48 1450 aa23.82■■□□□ 1.4
GGA3-203ENST00000577435 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.78■■□□□ 1.4
GGA3-203ENST00000577435 SHROOM2Q13796 1616 aa23.74■■□□□ 1.39
GGA3-203ENST00000577435 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.71■■□□□ 1.39
GGA3-203ENST00000577435 JPH4Q96JJ6 628 aa23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms