RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577315.5

MKS1-205, Transcript of Meckel syndrome, type 1, humanhuman

TSL 3

Gene MKS1, Length 495 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1-205ENST00000577315 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.09■■■■□ 3.53
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MKS1-205ENST00000577315 ABCC9O60706 1549 aa32.92■■■□□ 2.86
MKS1-205ENST00000577315 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.56■■■□□ 2.64
MKS1-205ENST00000577315 NACADO15069 1562 aa31.39■■■□□ 2.62
MKS1-205ENST00000577315 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.14■■■□□ 2.58
MKS1-205ENST00000577315 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.06■■■□□ 2.56
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MKS1-205ENST00000577315 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.77■■■□□ 2.52
MKS1-205ENST00000577315 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.72■■■□□ 2.51
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MKS1-205ENST00000577315 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.54■■■□□ 2.48
MKS1-205ENST00000577315 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.28■■■□□ 2.44
MKS1-205ENST00000577315 SCRIBQ14160 1630 aa30.22■■■□□ 2.43
MKS1-205ENST00000577315 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.81■■■□□ 2.36
MKS1-205ENST00000577315 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
MKS1-205ENST00000577315 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.68■■■□□ 2.34
MKS1-205ENST00000577315 NCAPD3P42695 1498 aa28.93■■■□□ 2.22
MKS1-205ENST00000577315 SMARCA4P51532 1647 aa28.9■■■□□ 2.22
MKS1-205ENST00000577315 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.85■■■□□ 2.21
MKS1-205ENST00000577315 SMARCA2P51531 1590 aa28.84■■■□□ 2.21
MKS1-205ENST00000577315 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
MKS1-205ENST00000577315 HMGXB3Q12766 1538 aa28.77■■■□□ 2.2
MKS1-205ENST00000577315 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.66■■■□□ 2.18
MKS1-205ENST00000577315 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
MKS1-205ENST00000577315 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.53■■■□□ 2.16
MKS1-205ENST00000577315 ERCC6Q03468 1493 aa28.46■■■□□ 2.15
MKS1-205ENST00000577315 CUX2O14529 1486 aa28.39■■■□□ 2.13
MKS1-205ENST00000577315 NESP48681 1621 aa28.32■■■□□ 2.12
MKS1-205ENST00000577315 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.29■■■□□ 2.12
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MKS1-205ENST00000577315 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.09■■■□□ 2.09
MKS1-205ENST00000577315 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
MKS1-205ENST00000577315 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.06■■■□□ 2.08
MKS1-205ENST00000577315 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.06■■■□□ 2.08
MKS1-205ENST00000577315 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.05■■■□□ 2.08
MKS1-205ENST00000577315 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
MKS1-205ENST00000577315 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
MKS1-205ENST00000577315 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.82■■■□□ 2.04
MKS1-205ENST00000577315 CFTRP13569 1480 aa27.77■■■□□ 2.04
MKS1-205ENST00000577315 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.76■■■□□ 2.03
MKS1-205ENST00000577315 WDR62O43379 1518 aa27.74■■■□□ 2.03
MKS1-205ENST00000577315 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.72■■■□□ 2.03
MKS1-205ENST00000577315 PRDM2Q13029 1718 aa27.65■■■□□ 2.02
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MKS1-205ENST00000577315 ABCC8Q09428 1581 aa27.28■■□□□ 1.96
MKS1-205ENST00000577315 TOPBP1Q92547 1522 aa27.22■■□□□ 1.95
MKS1-205ENST00000577315 IFT140Q96RY7 1462 aa27.2■■□□□ 1.95
MKS1-205ENST00000577315 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.18■■□□□ 1.94
MKS1-205ENST00000577315 OSCARQ8IYS5 282 aa27.1■■□□□ 1.93
MKS1-205ENST00000577315 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
MKS1-205ENST00000577315 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
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MKS1-205ENST00000577315 SOGA1O94964 1423 aa26.84■■□□□ 1.89
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MKS1-205ENST00000577315 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.81■■□□□ 1.88
MKS1-205ENST00000577315 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.81■■□□□ 1.88
MKS1-205ENST00000577315 CUX1P39880 1505 aa26.8■■□□□ 1.88
MKS1-205ENST00000577315 CHD1O14646 1710 aa26.77■■□□□ 1.88
MKS1-205ENST00000577315 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.71■■□□□ 1.87
MKS1-205ENST00000577315 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.71■■□□□ 1.87
MKS1-205ENST00000577315 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.71■■□□□ 1.87
MKS1-205ENST00000577315 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
MKS1-205ENST00000577315 ARHGEF11O15085 1522 aa26.64■■□□□ 1.85
MKS1-205ENST00000577315 FBLN2P98095 1184 aa26.63■■□□□ 1.85
MKS1-205ENST00000577315 GRIN2BQ13224 1484 aa26.61■■□□□ 1.85
MKS1-205ENST00000577315 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
MKS1-205ENST00000577315 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.6■■□□□ 1.85
MKS1-205ENST00000577315 PBRM1Q86U86 1689 aa26.56■■□□□ 1.84
MKS1-205ENST00000577315 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.55■■□□□ 1.84
MKS1-205ENST00000577315 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.53■■□□□ 1.84
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MKS1-205ENST00000577315 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.51■■□□□ 1.83
MKS1-205ENST00000577315 SYNJ1O43426 1573 aa26.5■■□□□ 1.83
MKS1-205ENST00000577315 TOP2BQ02880 1626 aa26.49■■□□□ 1.83
MKS1-205ENST00000577315 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.49■■□□□ 1.83
MKS1-205ENST00000577315 SYNJ2O15056 1496 aa26.49■■□□□ 1.83
MKS1-205ENST00000577315 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.48■■□□□ 1.83
MKS1-205ENST00000577315 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.44■■□□□ 1.82
MKS1-205ENST00000577315 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.39■■□□□ 1.82
MKS1-205ENST00000577315 ARAP1Q96P48 1450 aa26.36■■□□□ 1.81
MKS1-205ENST00000577315 ADAMTS12P58397 1594 aa26.27■■□□□ 1.8
MKS1-205ENST00000577315 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.25■■□□□ 1.79
MKS1-205ENST00000577315 GRIN2AQ12879 1464 aa26.24■■□□□ 1.79
MKS1-205ENST00000577315 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.22■■□□□ 1.79
MKS1-205ENST00000577315 NUP160Q12769 1436 aa26.15■■□□□ 1.78
MKS1-205ENST00000577315 CEP170Q5SW79 1584 aa26.12■■□□□ 1.77
MKS1-205ENST00000577315 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
MKS1-205ENST00000577315 SHROOM2Q13796 1616 aa26.04■■□□□ 1.76
MKS1-205ENST00000577315 KIF27Q86VH2 1401 aa25.97■■□□□ 1.75
MKS1-205ENST00000577315 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.96■■□□□ 1.75
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MKS1-205ENST00000577315 IGF1RP08069 1367 aa25.89■■□□□ 1.74
MKS1-205ENST00000577315 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.88■■□□□ 1.73
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