RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577211.1

LLGL2-206, Transcript of LLGL2, scribble cell polarity complex component, humanhuman

TSL 3

Gene LLGL2, Length 543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LLGL2-206ENST00000577211 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.67■■■■□ 3.46
LLGL2-206ENST00000577211 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.75■■■□□ 2.83
LLGL2-206ENST00000577211 ABCC9O60706 1549 aa32.41■■■□□ 2.78
LLGL2-206ENST00000577211 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.99■■■□□ 2.55
LLGL2-206ENST00000577211 NACADO15069 1562 aa30.86■■■□□ 2.53
LLGL2-206ENST00000577211 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.76■■■□□ 2.51
LLGL2-206ENST00000577211 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.56■■■□□ 2.48
LLGL2-206ENST00000577211 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.49■■■□□ 2.47
LLGL2-206ENST00000577211 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.31■■■□□ 2.44
LLGL2-206ENST00000577211 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.3■■■□□ 2.44
LLGL2-206ENST00000577211 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.21■■■□□ 2.431e-7■■■□□ 16.6
LLGL2-206ENST00000577211 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.1■■■□□ 2.41
LLGL2-206ENST00000577211 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.06■■■□□ 2.4
LLGL2-206ENST00000577211 SCRIBQ14160 1630 aa29.89■■■□□ 2.38
LLGL2-206ENST00000577211 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.71■■■□□ 2.35
LLGL2-206ENST00000577211 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
LLGL2-206ENST00000577211 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.29■■■□□ 2.28
LLGL2-206ENST00000577211 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.15■■■□□ 2.26
LLGL2-206ENST00000577211 SMARCA4P51532 1647 aa28.54■■■□□ 2.16
LLGL2-206ENST00000577211 NCAPD3P42695 1498 aa28.48■■■□□ 2.15
LLGL2-206ENST00000577211 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.46■■■□□ 2.15
LLGL2-206ENST00000577211 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
LLGL2-206ENST00000577211 SMARCA2P51531 1590 aa28.4■■■□□ 2.14
LLGL2-206ENST00000577211 HMGXB3Q12766 1538 aa28.33■■■□□ 2.13
LLGL2-206ENST00000577211 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.28■■■□□ 2.12
LLGL2-206ENST00000577211 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.25■■■□□ 2.11
LLGL2-206ENST00000577211 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
LLGL2-206ENST00000577211 NESP48681 1621 aa27.96■■■□□ 2.07
LLGL2-206ENST00000577211 WIZO95785 1651 aa27.95■■■□□ 2.07
LLGL2-206ENST00000577211 ERCC6Q03468 1493 aa27.95■■■□□ 2.06
LLGL2-206ENST00000577211 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
LLGL2-206ENST00000577211 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.79■■■□□ 2.04
LLGL2-206ENST00000577211 CUX2O14529 1486 aa27.76■■■□□ 2.04
LLGL2-206ENST00000577211 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.63■■■□□ 2.01
LLGL2-206ENST00000577211 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
LLGL2-206ENST00000577211 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
LLGL2-206ENST00000577211 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.6■■■□□ 2.01
LLGL2-206ENST00000577211 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.6■■■□□ 2.01
LLGL2-206ENST00000577211 CFTRP13569 1480 aa27.41■■□□□ 1.98
LLGL2-206ENST00000577211 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.38■■□□□ 1.97
LLGL2-206ENST00000577211 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.34■■□□□ 1.97
LLGL2-206ENST00000577211 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.33■■□□□ 1.97
LLGL2-206ENST00000577211 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.31■■□□□ 1.96
LLGL2-206ENST00000577211 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.3■■□□□ 1.96
LLGL2-206ENST00000577211 WDR62O43379 1518 aa27.3■■□□□ 1.96
LLGL2-206ENST00000577211 PRDM2Q13029 1718 aa27.16■■□□□ 1.94
LLGL2-206ENST00000577211 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
LLGL2-206ENST00000577211 TOPBP1Q92547 1522 aa26.86■■□□□ 1.89
LLGL2-206ENST00000577211 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
LLGL2-206ENST00000577211 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.8■■□□□ 1.88
LLGL2-206ENST00000577211 ABCC8Q09428 1581 aa26.8■■□□□ 1.88
LLGL2-206ENST00000577211 IFT140Q96RY7 1462 aa26.77■■□□□ 1.88
LLGL2-206ENST00000577211 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
LLGL2-206ENST00000577211 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
LLGL2-206ENST00000577211 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
LLGL2-206ENST00000577211 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
LLGL2-206ENST00000577211 CUX1P39880 1505 aa26.55■■□□□ 1.84
LLGL2-206ENST00000577211 OSCARQ8IYS5 282 aa26.52■■□□□ 1.84
LLGL2-206ENST00000577211 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.51■■□□□ 1.83
LLGL2-206ENST00000577211 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.51■■□□□ 1.83
LLGL2-206ENST00000577211 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.5■■□□□ 1.836e-7■■■■□ 23.6
LLGL2-206ENST00000577211 SOGA1O94964 1423 aa26.48■■□□□ 1.83
LLGL2-206ENST00000577211 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
LLGL2-206ENST00000577211 WDR97A6NE52 1622 aa26.34■■□□□ 1.81
LLGL2-206ENST00000577211 CHD1O14646 1710 aa26.31■■□□□ 1.8
LLGL2-206ENST00000577211 TRIM41Q8WV44 630 aa26.28■■□□□ 1.8
LLGL2-206ENST00000577211 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.26■■□□□ 1.79
LLGL2-206ENST00000577211 FBLN2P98095 1184 aa26.23■■□□□ 1.79
LLGL2-206ENST00000577211 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.22■■□□□ 1.79
LLGL2-206ENST00000577211 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.22■■□□□ 1.79
LLGL2-206ENST00000577211 GRIN2BQ13224 1484 aa26.22■■□□□ 1.79
LLGL2-206ENST00000577211 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.21■■□□□ 1.79
LLGL2-206ENST00000577211 SYNJ1O43426 1573 aa26.21■■□□□ 1.79
LLGL2-206ENST00000577211 TOP2BQ02880 1626 aa26.21■■□□□ 1.79
LLGL2-206ENST00000577211 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
LLGL2-206ENST00000577211 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.18■■□□□ 1.78
LLGL2-206ENST00000577211 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.18■■□□□ 1.78
LLGL2-206ENST00000577211 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.18■■□□□ 1.78
LLGL2-206ENST00000577211 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.17■■□□□ 1.78
LLGL2-206ENST00000577211 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.17■■□□□ 1.78
LLGL2-206ENST00000577211 PBRM1Q86U86 1689 aa26.15■■□□□ 1.78
LLGL2-206ENST00000577211 ARHGEF11O15085 1522 aa26.14■■□□□ 1.78
LLGL2-206ENST00000577211 SYNJ2O15056 1496 aa26.1■■□□□ 1.77
LLGL2-206ENST00000577211 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
LLGL2-206ENST00000577211 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.03■■□□□ 1.76
LLGL2-206ENST00000577211 ADAMTS12P58397 1594 aa25.95■■□□□ 1.74
LLGL2-206ENST00000577211 ARAP1Q96P48 1450 aa25.93■■□□□ 1.74
LLGL2-206ENST00000577211 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.89■■□□□ 1.74
LLGL2-206ENST00000577211 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.89■■□□□ 1.74
LLGL2-206ENST00000577211 GRIN2AQ12879 1464 aa25.89■■□□□ 1.73
LLGL2-206ENST00000577211 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.86■■□□□ 1.73
LLGL2-206ENST00000577211 CEP170Q5SW79 1584 aa25.8■■□□□ 1.72
LLGL2-206ENST00000577211 NUP160Q12769 1436 aa25.8■■□□□ 1.72
LLGL2-206ENST00000577211 KIF27Q86VH2 1401 aa25.69■■□□□ 1.7
LLGL2-206ENST00000577211 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.66■■□□□ 1.7
LLGL2-206ENST00000577211 SHROOM2Q13796 1616 aa25.64■■□□□ 1.7
LLGL2-206ENST00000577211 IGF1RP08069 1367 aa25.64■■□□□ 1.69
LLGL2-206ENST00000577211 CUL7Q14999 1698 aa25.59■■□□□ 1.69
LLGL2-206ENST00000577211 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.58■■□□□ 1.69
LLGL2-206ENST00000577211 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.1 ms