RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576635.6

SPNS2-208, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

TSL 3

Gene SPNS2, Length 901 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-208ENST00000576635 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.21■■■■□ 3.87
SPNS2-208ENST00000576635 ABCC9O60706 1549 aa35.48■■■■□ 3.27
SPNS2-208ENST00000576635 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.33■■■■□ 3.25
SPNS2-208ENST00000576635 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.68■■■□□ 2.98
SPNS2-208ENST00000576635 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.43■■■□□ 2.94
SPNS2-208ENST00000576635 NACADO15069 1562 aa33.39■■■□□ 2.94
SPNS2-208ENST00000576635 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.12■■■□□ 2.89
SPNS2-208ENST00000576635 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.05■■■□□ 2.88
SPNS2-208ENST00000576635 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.96■■■□□ 2.87
SPNS2-208ENST00000576635 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.85■■■□□ 2.85
SPNS2-208ENST00000576635 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.75■■■□□ 2.83
SPNS2-208ENST00000576635 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.48■■■□□ 2.79
SPNS2-208ENST00000576635 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.36■■■□□ 2.77
SPNS2-208ENST00000576635 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.22■■■□□ 2.75
SPNS2-208ENST00000576635 SCRIBQ14160 1630 aa32.18■■■□□ 2.74
SPNS2-208ENST00000576635 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.08■■■□□ 2.73
SPNS2-208ENST00000576635 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.97■■■□□ 2.71
SPNS2-208ENST00000576635 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.94■■■□□ 2.7
SPNS2-208ENST00000576635 NCAPD3P42695 1498 aa30.81■■■□□ 2.52
SPNS2-208ENST00000576635 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.8■■■□□ 2.52
SPNS2-208ENST00000576635 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.7■■■□□ 2.51
SPNS2-208ENST00000576635 SMARCA4P51532 1647 aa30.68■■■□□ 2.5
SPNS2-208ENST00000576635 CUX2O14529 1486 aa30.63■■■□□ 2.49
SPNS2-208ENST00000576635 ERCC6Q03468 1493 aa30.63■■■□□ 2.49
SPNS2-208ENST00000576635 SMARCA2P51531 1590 aa30.62■■■□□ 2.49
SPNS2-208ENST00000576635 HMGXB3Q12766 1538 aa30.6■■■□□ 2.49
SPNS2-208ENST00000576635 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.45■■■□□ 2.47
SPNS2-208ENST00000576635 NESP48681 1621 aa30.44■■■□□ 2.46
SPNS2-208ENST00000576635 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
SPNS2-208ENST00000576635 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.36■■■□□ 2.45
SPNS2-208ENST00000576635 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.24■■■□□ 2.43
SPNS2-208ENST00000576635 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
SPNS2-208ENST00000576635 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.18■■■□□ 2.42
SPNS2-208ENST00000576635 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.11■■■□□ 2.41
SPNS2-208ENST00000576635 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.96■■■□□ 2.39
SPNS2-208ENST00000576635 WIZO95785 1651 aa29.9■■■□□ 2.38
SPNS2-208ENST00000576635 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.84■■■□□ 2.37
SPNS2-208ENST00000576635 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.75■■■□□ 2.35
SPNS2-208ENST00000576635 WDR62O43379 1518 aa29.71■■■□□ 2.35
SPNS2-208ENST00000576635 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.6■■■□□ 2.33
SPNS2-208ENST00000576635 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.55■■■□□ 2.32
SPNS2-208ENST00000576635 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
SPNS2-208ENST00000576635 CFTRP13569 1480 aa29.48■■■□□ 2.31
SPNS2-208ENST00000576635 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
SPNS2-208ENST00000576635 TRIM41Q8WV44 630 aa29.39■■■□□ 2.3
SPNS2-208ENST00000576635 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
SPNS2-208ENST00000576635 PRDM2Q13029 1718 aa29.31■■■□□ 2.28
SPNS2-208ENST00000576635 OSCARQ8IYS5 282 aa29.15■■■□□ 2.26
SPNS2-208ENST00000576635 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.12■■■□□ 2.25
SPNS2-208ENST00000576635 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
SPNS2-208ENST00000576635 IFT140Q96RY7 1462 aa28.99■■■□□ 2.23
SPNS2-208ENST00000576635 TOPBP1Q92547 1522 aa28.98■■■□□ 2.23
SPNS2-208ENST00000576635 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.91■■■□□ 2.22
SPNS2-208ENST00000576635 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.91■■■□□ 2.22
SPNS2-208ENST00000576635 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.91■■■□□ 2.22
SPNS2-208ENST00000576635 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
SPNS2-208ENST00000576635 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.87■■■□□ 2.21
SPNS2-208ENST00000576635 ABCC8Q09428 1581 aa28.85■■■□□ 2.21
SPNS2-208ENST00000576635 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
SPNS2-208ENST00000576635 ARHGEF11O15085 1522 aa28.77■■■□□ 2.2
SPNS2-208ENST00000576635 CHD1O14646 1710 aa28.74■■■□□ 2.19
SPNS2-208ENST00000576635 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.69■■■□□ 2.18
SPNS2-208ENST00000576635 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
SPNS2-208ENST00000576635 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.57■■■□□ 2.16
SPNS2-208ENST00000576635 FBLN2P98095 1184 aa28.5■■■□□ 2.15
SPNS2-208ENST00000576635 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.5■■■□□ 2.15
SPNS2-208ENST00000576635 SOGA1O94964 1423 aa28.5■■■□□ 2.15
SPNS2-208ENST00000576635 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
SPNS2-208ENST00000576635 ARAP1Q96P48 1450 aa28.47■■■□□ 2.15
SPNS2-208ENST00000576635 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.46■■■□□ 2.15
SPNS2-208ENST00000576635 WDR97A6NE52 1622 aa28.43■■■□□ 2.14
SPNS2-208ENST00000576635 CUX1P39880 1505 aa28.42■■■□□ 2.14
SPNS2-208ENST00000576635 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.41■■■□□ 2.14
SPNS2-208ENST00000576635 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.34■■■□□ 2.13
SPNS2-208ENST00000576635 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
SPNS2-208ENST00000576635 SYNJ1O43426 1573 aa28.28■■■□□ 2.12
SPNS2-208ENST00000576635 GRIN2BQ13224 1484 aa28.28■■■□□ 2.12
SPNS2-208ENST00000576635 PBRM1Q86U86 1689 aa28.26■■■□□ 2.12
SPNS2-208ENST00000576635 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
SPNS2-208ENST00000576635 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
SPNS2-208ENST00000576635 SYNJ2O15056 1496 aa28.21■■■□□ 2.11
SPNS2-208ENST00000576635 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.16■■■□□ 2.1
SPNS2-208ENST00000576635 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.14■■■□□ 2.1
SPNS2-208ENST00000576635 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.12■■■□□ 2.09
SPNS2-208ENST00000576635 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
SPNS2-208ENST00000576635 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.95■■■□□ 2.06
SPNS2-208ENST00000576635 ADAMTS12P58397 1594 aa27.94■■■□□ 2.06
SPNS2-208ENST00000576635 GRIN2AQ12879 1464 aa27.94■■■□□ 2.06
SPNS2-208ENST00000576635 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.92■■■□□ 2.06
SPNS2-208ENST00000576635 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.91■■■□□ 2.06
SPNS2-208ENST00000576635 TOP2BQ02880 1626 aa27.91■■■□□ 2.06
SPNS2-208ENST00000576635 CEP170Q5SW79 1584 aa27.89■■■□□ 2.05
SPNS2-208ENST00000576635 NUP160Q12769 1436 aa27.84■■■□□ 2.05
SPNS2-208ENST00000576635 SHROOM2Q13796 1616 aa27.8■■■□□ 2.04
SPNS2-208ENST00000576635 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.78■■■□□ 2.04
SPNS2-208ENST00000576635 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.77■■■□□ 2.04
SPNS2-208ENST00000576635 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2
SPNS2-208ENST00000576635 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.57■■■□□ 2
SPNS2-208ENST00000576635 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.57■■■□□ 2
SPNS2-208ENST00000576635 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
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