RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576269.1

NOMO3-214, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

TSL 3

Gene NOMO3, Length 394 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-214ENST00000576269 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.86■■■□□ 2.37
NOMO3-214ENST00000576269 ABCC9O60706 1549 aa27.24■■□□□ 1.95
NOMO3-214ENST00000576269 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.05■■□□□ 1.92
NOMO3-214ENST00000576269 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.82■■□□□ 1.72
NOMO3-214ENST00000576269 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.8■■□□□ 1.72
NOMO3-214ENST00000576269 NACADO15069 1562 aa25.53■■□□□ 1.68
NOMO3-214ENST00000576269 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.49■■□□□ 1.67
NOMO3-214ENST00000576269 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.21■■□□□ 1.63
NOMO3-214ENST00000576269 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.18■■□□□ 1.62
NOMO3-214ENST00000576269 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.11■■□□□ 1.61
NOMO3-214ENST00000576269 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.07■■□□□ 1.6
NOMO3-214ENST00000576269 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
NOMO3-214ENST00000576269 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.67■■□□□ 1.54
NOMO3-214ENST00000576269 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.66■■□□□ 1.54
NOMO3-214ENST00000576269 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.65■■□□□ 1.54
NOMO3-214ENST00000576269 SCRIBQ14160 1630 aa24.61■■□□□ 1.53
NOMO3-214ENST00000576269 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.54■■□□□ 1.52
NOMO3-214ENST00000576269 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
NOMO3-214ENST00000576269 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.83■■□□□ 1.41
NOMO3-214ENST00000576269 CUX2O14529 1486 aa23.58■■□□□ 1.37
NOMO3-214ENST00000576269 NCAPD3P42695 1498 aa23.53■■□□□ 1.36
NOMO3-214ENST00000576269 ERCC6Q03468 1493 aa23.47■■□□□ 1.35
NOMO3-214ENST00000576269 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.45■■□□□ 1.34
NOMO3-214ENST00000576269 SMARCA4P51532 1647 aa23.44■■□□□ 1.34
NOMO3-214ENST00000576269 HMGXB3Q12766 1538 aa23.42■■□□□ 1.34
NOMO3-214ENST00000576269 NESP48681 1621 aa23.37■■□□□ 1.33
NOMO3-214ENST00000576269 SMARCA2P51531 1590 aa23.36■■□□□ 1.33
NOMO3-214ENST00000576269 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
NOMO3-214ENST00000576269 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.2■■□□□ 1.3
NOMO3-214ENST00000576269 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
NOMO3-214ENST00000576269 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
NOMO3-214ENST00000576269 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.18■■□□□ 1.3
NOMO3-214ENST00000576269 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.11■■□□□ 1.29
NOMO3-214ENST00000576269 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.05■■□□□ 1.28
NOMO3-214ENST00000576269 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.86■■□□□ 1.25
NOMO3-214ENST00000576269 WIZO95785 1651 aa22.82■■□□□ 1.24
NOMO3-214ENST00000576269 WDR62O43379 1518 aa22.8■■□□□ 1.24
NOMO3-214ENST00000576269 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.78■■□□□ 1.24
NOMO3-214ENST00000576269 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.76■■□□□ 1.23
NOMO3-214ENST00000576269 TRIM41Q8WV44 630 aa22.64■■□□□ 1.21
NOMO3-214ENST00000576269 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.62■■□□□ 1.21
NOMO3-214ENST00000576269 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.57■■□□□ 1.2
NOMO3-214ENST00000576269 PRDM2Q13029 1718 aa22.5■■□□□ 1.19
NOMO3-214ENST00000576269 CFTRP13569 1480 aa22.49■■□□□ 1.19
NOMO3-214ENST00000576269 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
NOMO3-214ENST00000576269 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
NOMO3-214ENST00000576269 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
NOMO3-214ENST00000576269 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.31■■□□□ 1.16
NOMO3-214ENST00000576269 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.31■■□□□ 1.16
NOMO3-214ENST00000576269 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.31■■□□□ 1.16
NOMO3-214ENST00000576269 OSCARQ8IYS5 282 aa22.29■■□□□ 1.16
NOMO3-214ENST00000576269 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
NOMO3-214ENST00000576269 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
NOMO3-214ENST00000576269 IFT140Q96RY7 1462 aa22.15■■□□□ 1.14
NOMO3-214ENST00000576269 ARHGEF11O15085 1522 aa22.15■■□□□ 1.14
NOMO3-214ENST00000576269 TOPBP1Q92547 1522 aa22.15■■□□□ 1.14
NOMO3-214ENST00000576269 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.14■■□□□ 1.13
NOMO3-214ENST00000576269 CHD1O14646 1710 aa22.13■■□□□ 1.13
NOMO3-214ENST00000576269 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.05■■□□□ 1.12
NOMO3-214ENST00000576269 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
NOMO3-214ENST00000576269 ABCC8Q09428 1581 aa21.95■■□□□ 1.11
NOMO3-214ENST00000576269 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.92■■□□□ 1.1
NOMO3-214ENST00000576269 ARAP1Q96P48 1450 aa21.92■■□□□ 1.1
NOMO3-214ENST00000576269 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
NOMO3-214ENST00000576269 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.83■■□□□ 1.09
NOMO3-214ENST00000576269 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.81■■□□□ 1.08
NOMO3-214ENST00000576269 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.77■■□□□ 1.08
NOMO3-214ENST00000576269 WDR97A6NE52 1622 aa21.74■■□□□ 1.07
NOMO3-214ENST00000576269 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.73■■□□□ 1.07
NOMO3-214ENST00000576269 FBLN2P98095 1184 aa21.71■■□□□ 1.07
NOMO3-214ENST00000576269 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.71■■□□□ 1.07
NOMO3-214ENST00000576269 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
NOMO3-214ENST00000576269 SOGA1O94964 1423 aa21.68■■□□□ 1.06
NOMO3-214ENST00000576269 CUX1P39880 1505 aa21.68■■□□□ 1.06
NOMO3-214ENST00000576269 PBRM1Q86U86 1689 aa21.68■■□□□ 1.06
NOMO3-214ENST00000576269 SYNJ1O43426 1573 aa21.65■■□□□ 1.06
NOMO3-214ENST00000576269 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
NOMO3-214ENST00000576269 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
NOMO3-214ENST00000576269 GRIN2BQ13224 1484 aa21.57■■□□□ 1.04
NOMO3-214ENST00000576269 SYNJ2O15056 1496 aa21.55■■□□□ 1.04
NOMO3-214ENST00000576269 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.54■■□□□ 1.04
NOMO3-214ENST00000576269 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
NOMO3-214ENST00000576269 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.45■■□□□ 1.03
NOMO3-214ENST00000576269 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.44■■□□□ 1.02
NOMO3-214ENST00000576269 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.43■■□□□ 1.02
NOMO3-214ENST00000576269 ADAMTS12P58397 1594 aa21.38■■□□□ 1.01
NOMO3-214ENST00000576269 CEP170Q5SW79 1584 aa21.36■■□□□ 1.01
NOMO3-214ENST00000576269 GRIN2AQ12879 1464 aa21.34■■□□□ 1.01
NOMO3-214ENST00000576269 SHROOM2Q13796 1616 aa21.33■■□□□ 1.01
NOMO3-214ENST00000576269 KIF13AQ9H1H9 1805 aa21.32■■□□□ 1
NOMO3-214ENST00000576269 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.31■■□□□ 1
NOMO3-214ENST00000576269 NUP160Q12769 1436 aa21.28■■□□□ 1
NOMO3-214ENST00000576269 TOP2BQ02880 1626 aa21.25■□□□□ 0.99
NOMO3-214ENST00000576269 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
NOMO3-214ENST00000576269 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.18■□□□□ 0.98
NOMO3-214ENST00000576269 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.15■□□□□ 0.98
NOMO3-214ENST00000576269 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.15■□□□□ 0.98
NOMO3-214ENST00000576269 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.1■□□□□ 0.97
NOMO3-214ENST00000576269 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
NOMO3-214ENST00000576269 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
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