RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575573.1

GGT6-206, Transcript of gamma-glutamyltransferase 6, humanhuman

TSL 4

Gene GGT6, Length 556 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGT6-206ENST00000575573 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.76■■■■■ 5.72
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GGT6-206ENST00000575573 ABCC9O60706 1549 aa44.77■■■■■ 4.76
GGT6-206ENST00000575573 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.83■■■■■ 4.45
GGT6-206ENST00000575573 NACADO15069 1562 aa42.67■■■■■ 4.42
GGT6-206ENST00000575573 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.57■■■■■ 4.41
GGT6-206ENST00000575573 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.25■■■■■ 4.35
GGT6-206ENST00000575573 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.23■■■■■ 4.35
GGT6-206ENST00000575573 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.95■■■■■ 4.31
GGT6-206ENST00000575573 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.89■■■■■ 4.3
GGT6-206ENST00000575573 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.76■■■■■ 4.28
GGT6-206ENST00000575573 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.59■■■■■ 4.25
GGT6-206ENST00000575573 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.43■■■■■ 4.22
GGT6-206ENST00000575573 SCRIBQ14160 1630 aa41.38■■■■■ 4.21
GGT6-206ENST00000575573 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.06■■■■■ 4.16
GGT6-206ENST00000575573 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.52■■■■■ 4.08
GGT6-206ENST00000575573 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.46■■■■■ 4.07
GGT6-206ENST00000575573 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.26■■■■■ 4.03
GGT6-206ENST00000575573 SMARCA4P51532 1647 aa39.5■■■■□ 3.91
GGT6-206ENST00000575573 NCAPD3P42695 1498 aa39.37■■■■□ 3.89
GGT6-206ENST00000575573 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.37■■■■□ 3.89
GGT6-206ENST00000575573 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.37■■■■□ 3.89
GGT6-206ENST00000575573 SMARCA2P51531 1590 aa39.29■■■■□ 3.88
GGT6-206ENST00000575573 HMGXB3Q12766 1538 aa39.18■■■■□ 3.86
GGT6-206ENST00000575573 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.14■■■■□ 3.86
GGT6-206ENST00000575573 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.08■■■■□ 3.85
GGT6-206ENST00000575573 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.04■■■■□ 3.84
GGT6-206ENST00000575573 WIZO95785 1651 aa38.71■■■■□ 3.79
GGT6-206ENST00000575573 NESP48681 1621 aa38.63■■■■□ 3.78
GGT6-206ENST00000575573 ERCC6Q03468 1493 aa38.61■■■■□ 3.77
GGT6-206ENST00000575573 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.53■■■■□ 3.76
GGT6-206ENST00000575573 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.41■■■■□ 3.74
GGT6-206ENST00000575573 CUX2O14529 1486 aa38.32■■■■□ 3.72
GGT6-206ENST00000575573 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.27■■■■□ 3.72
GGT6-206ENST00000575573 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.22■■■■□ 3.71
GGT6-206ENST00000575573 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.16■■■■□ 3.7
GGT6-206ENST00000575573 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.15■■■■□ 3.7
GGT6-206ENST00000575573 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.13■■■■□ 3.69
GGT6-206ENST00000575573 CFTRP13569 1480 aa37.91■■■■□ 3.66
GGT6-206ENST00000575573 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.84■■■■□ 3.65
GGT6-206ENST00000575573 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.82■■■■□ 3.64
GGT6-206ENST00000575573 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.81■■■■□ 3.64
GGT6-206ENST00000575573 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.8■■■■□ 3.64
GGT6-206ENST00000575573 WDR62O43379 1518 aa37.73■■■■□ 3.63
GGT6-206ENST00000575573 PRDM2Q13029 1718 aa37.6■■■■□ 3.61
GGT6-206ENST00000575573 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.58■■■■□ 3.61
GGT6-206ENST00000575573 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.47■■■■□ 3.59
GGT6-206ENST00000575573 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.25■■■■□ 3.55
GGT6-206ENST00000575573 TOPBP1Q92547 1522 aa37.16■■■■□ 3.54
GGT6-206ENST00000575573 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.08■■■■□ 3.53
GGT6-206ENST00000575573 ABCC8Q09428 1581 aa37.06■■■■□ 3.52
GGT6-206ENST00000575573 IFT140Q96RY7 1462 aa37.01■■■■□ 3.52
GGT6-206ENST00000575573 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.93■■■■□ 3.5
GGT6-206ENST00000575573 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.83■■■■□ 3.49
GGT6-206ENST00000575573 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.78■■■■□ 3.48
GGT6-206ENST00000575573 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.77■■■■□ 3.48
GGT6-206ENST00000575573 CUX1P39880 1505 aa36.75■■■■□ 3.47
GGT6-206ENST00000575573 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.69■■■■□ 3.46
GGT6-206ENST00000575573 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.69■■■■□ 3.46
GGT6-206ENST00000575573 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.64■■■■□ 3.46
GGT6-206ENST00000575573 SOGA1O94964 1423 aa36.63■■■■□ 3.45
GGT6-206ENST00000575573 OSCARQ8IYS5 282 aa36.61■■■■□ 3.45
GGT6-206ENST00000575573 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.51■■■■□ 3.43
GGT6-206ENST00000575573 WDR97A6NE52 1622 aa36.44■■■■□ 3.42
GGT6-206ENST00000575573 CHD1O14646 1710 aa36.37■■■■□ 3.41
GGT6-206ENST00000575573 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.34■■■■□ 3.41
GGT6-206ENST00000575573 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.33■■■■□ 3.41
GGT6-206ENST00000575573 SYNJ1O43426 1573 aa36.32■■■■□ 3.4
GGT6-206ENST00000575573 TOP2BQ02880 1626 aa36.3■■■■□ 3.4
GGT6-206ENST00000575573 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.3■■■■□ 3.4
GGT6-206ENST00000575573 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.29■■■■□ 3.4
GGT6-206ENST00000575573 FBLN2P98095 1184 aa36.27■■■■□ 3.4
GGT6-206ENST00000575573 GRIN2BQ13224 1484 aa36.26■■■■□ 3.4
GGT6-206ENST00000575573 TRIM41Q8WV44 630 aa36.24■■■■□ 3.39
GGT6-206ENST00000575573 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.23■■■■□ 3.39
GGT6-206ENST00000575573 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.22■■■■□ 3.39
GGT6-206ENST00000575573 PBRM1Q86U86 1689 aa36.2■■■■□ 3.39
GGT6-206ENST00000575573 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.2■■■■□ 3.39
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GGT6-206ENST00000575573 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.15■■■■□ 3.38
GGT6-206ENST00000575573 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.15■■■■□ 3.38
GGT6-206ENST00000575573 ARHGEF11O15085 1522 aa36.1■■■■□ 3.37
GGT6-206ENST00000575573 SYNJ2O15056 1496 aa36.09■■■■□ 3.37
GGT6-206ENST00000575573 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.08■■■■□ 3.37
GGT6-206ENST00000575573 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.97■■■■□ 3.35
GGT6-206ENST00000575573 ADAMTS12P58397 1594 aa35.91■■■■□ 3.34
GGT6-206ENST00000575573 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.83■■■■□ 3.33
GGT6-206ENST00000575573 GRIN2AQ12879 1464 aa35.82■■■■□ 3.32
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GGT6-206ENST00000575573 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.78■■■■□ 3.32
GGT6-206ENST00000575573 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.75■■■■□ 3.31
GGT6-206ENST00000575573 CEP170Q5SW79 1584 aa35.68■■■■□ 3.3
GGT6-206ENST00000575573 NUP160Q12769 1436 aa35.67■■■■□ 3.3
GGT6-206ENST00000575573 KIF27Q86VH2 1401 aa35.6■■■■□ 3.29
GGT6-206ENST00000575573 IGF1RP08069 1367 aa35.49■■■■□ 3.27
GGT6-206ENST00000575573 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.47■■■■□ 3.27
GGT6-206ENST00000575573 CUL7Q14999 1698 aa35.44■■■■□ 3.26
GGT6-206ENST00000575573 SHROOM2Q13796 1616 aa35.44■■■■□ 3.26
GGT6-206ENST00000575573 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.39■■■■□ 3.26
GGT6-206ENST00000575573 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.28■■■■□ 3.24
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