RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574958.1

GEMIN4-205, Transcript of gem nuclear organelle associated protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene GEMIN4, Length 673 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMIN4-205ENST00000574958 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.63■■■■■ 7.14
GEMIN4-205ENST00000574958 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.34■■■■■ 6.13
GEMIN4-205ENST00000574958 ABCC9O60706 1549 aa52.82■■■■■ 6.05
GEMIN4-205ENST00000574958 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.53■■■■■ 5.68
GEMIN4-205ENST00000574958 NACADO15069 1562 aa50.29■■■■■ 5.64
GEMIN4-205ENST00000574958 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.13■■■■■ 5.62
GEMIN4-205ENST00000574958 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.74■■■■■ 5.55
GEMIN4-205ENST00000574958 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.52■■■■■ 5.52
GEMIN4-205ENST00000574958 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.4■■■■■ 5.5
GEMIN4-205ENST00000574958 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.29■■■■■ 5.48
GEMIN4-205ENST00000574958 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.24■■■■■ 5.47
GEMIN4-205ENST00000574958 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.05■■■■■ 5.44
GEMIN4-205ENST00000574958 BICRAQ9NZM4 1560 aa49■■■■■ 5.43
GEMIN4-205ENST00000574958 SCRIBQ14160 1630 aa48.62■■■■■ 5.37
GEMIN4-205ENST00000574958 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.42■■■■■ 5.34
GEMIN4-205ENST00000574958 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.78■■■■■ 5.24
GEMIN4-205ENST00000574958 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.76■■■■■ 5.24
GEMIN4-205ENST00000574958 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.53■■■■■ 5.2
GEMIN4-205ENST00000574958 SMARCA4P51532 1647 aa46.43■■■■■ 5.02
GEMIN4-205ENST00000574958 NCAPD3P42695 1498 aa46.38■■■■■ 5.02
GEMIN4-205ENST00000574958 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.32■■■■■ 5.01
GEMIN4-205ENST00000574958 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.27■■■■■ 5
GEMIN4-205ENST00000574958 SMARCA2P51531 1590 aa46.26■■■■■ 5
GEMIN4-205ENST00000574958 HMGXB3Q12766 1538 aa46.12■■■■■ 4.97
GEMIN4-205ENST00000574958 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.96■■■■■ 4.95
GEMIN4-205ENST00000574958 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.95■■■■■ 4.95
GEMIN4-205ENST00000574958 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.93■■■■■ 4.94
GEMIN4-205ENST00000574958 ERCC6Q03468 1493 aa45.61■■■■■ 4.89
GEMIN4-205ENST00000574958 NESP48681 1621 aa45.51■■■■■ 4.88
GEMIN4-205ENST00000574958 WIZO95785 1651 aa45.44■■■■■ 4.87
GEMIN4-205ENST00000574958 CUX2O14529 1486 aa45.34■■■■■ 4.85
GEMIN4-205ENST00000574958 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.31■■■■■ 4.84
GEMIN4-205ENST00000574958 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.17■■■■■ 4.82
GEMIN4-205ENST00000574958 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.01■■■■■ 4.8
GEMIN4-205ENST00000574958 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.01■■■■■ 4.8
GEMIN4-205ENST00000574958 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.99■■■■■ 4.79
GEMIN4-205ENST00000574958 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.98■■■■■ 4.79
GEMIN4-205ENST00000574958 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.9■■■■■ 4.78
GEMIN4-205ENST00000574958 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.7■■■■■ 4.75
GEMIN4-205ENST00000574958 CFTRP13569 1480 aa44.6■■■■■ 4.73
GEMIN4-205ENST00000574958 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.59■■■■■ 4.73
GEMIN4-205ENST00000574958 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.53■■■■■ 4.72
GEMIN4-205ENST00000574958 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.52■■■■■ 4.72
GEMIN4-205ENST00000574958 WDR62O43379 1518 aa44.47■■■■■ 4.71
GEMIN4-205ENST00000574958 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.37■■■■■ 4.69
GEMIN4-205ENST00000574958 PRDM2Q13029 1718 aa44.27■■■■■ 4.68
GEMIN4-205ENST00000574958 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.1■■■■■ 4.65
GEMIN4-205ENST00000574958 TOPBP1Q92547 1522 aa43.72■■■■■ 4.59
GEMIN4-205ENST00000574958 ABCC8Q09428 1581 aa43.68■■■■■ 4.58
GEMIN4-205ENST00000574958 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.63■■■■■ 4.57
GEMIN4-205ENST00000574958 IFT140Q96RY7 1462 aa43.61■■■■■ 4.57
GEMIN4-205ENST00000574958 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.55■■■■■ 4.56
GEMIN4-205ENST00000574958 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.48■■■■■ 4.55
GEMIN4-205ENST00000574958 OSCARQ8IYS5 282 aa43.33■■■■■ 4.53
GEMIN4-205ENST00000574958 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.31■■■■■ 4.52
GEMIN4-205ENST00000574958 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.31■■■■■ 4.52
GEMIN4-205ENST00000574958 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.3■■■■■ 4.52
GEMIN4-205ENST00000574958 CUX1P39880 1505 aa43.15■■■■■ 4.5
GEMIN4-205ENST00000574958 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.14■■■■■ 4.5
GEMIN4-205ENST00000574958 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.13■■■■■ 4.49
GEMIN4-205ENST00000574958 SOGA1O94964 1423 aa43.12■■■■■ 4.49
GEMIN4-205ENST00000574958 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.12■■■■■ 4.49
GEMIN4-205ENST00000574958 TRIM41Q8WV44 630 aa42.99■■■■■ 4.47
GEMIN4-205ENST00000574958 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.95■■■■■ 4.47
GEMIN4-205ENST00000574958 WDR97A6NE52 1622 aa42.93■■■■■ 4.46
GEMIN4-205ENST00000574958 CHD1O14646 1710 aa42.9■■■■■ 4.46
GEMIN4-205ENST00000574958 FBLN2P98095 1184 aa42.79■■■■■ 4.44
GEMIN4-205ENST00000574958 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.74■■■■■ 4.43
GEMIN4-205ENST00000574958 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.74■■■■■ 4.43
GEMIN4-205ENST00000574958 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.74■■■■■ 4.43
GEMIN4-205ENST00000574958 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.74■■■■■ 4.43
GEMIN4-205ENST00000574958 GRIN2BQ13224 1484 aa42.7■■■■■ 4.43
GEMIN4-205ENST00000574958 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.66■■■■■ 4.42
GEMIN4-205ENST00000574958 ARHGEF11O15085 1522 aa42.65■■■■■ 4.42
GEMIN4-205ENST00000574958 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.65■■■■■ 4.42
GEMIN4-205ENST00000574958 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.63■■■■■ 4.41
GEMIN4-205ENST00000574958 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.62■■■■■ 4.41
GEMIN4-205ENST00000574958 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.62■■■■■ 4.41
GEMIN4-205ENST00000574958 TOP2BQ02880 1626 aa42.61■■■■■ 4.41
GEMIN4-205ENST00000574958 PBRM1Q86U86 1689 aa42.61■■■■■ 4.41
GEMIN4-205ENST00000574958 SYNJ1O43426 1573 aa42.56■■■■■ 4.4
GEMIN4-205ENST00000574958 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.56■■■■■ 4.4
GEMIN4-205ENST00000574958 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.55■■■■■ 4.4
GEMIN4-205ENST00000574958 SYNJ2O15056 1496 aa42.5■■■■■ 4.39
GEMIN4-205ENST00000574958 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.39■■■■■ 4.38
GEMIN4-205ENST00000574958 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.29■■■■■ 4.36
GEMIN4-205ENST00000574958 ARAP1Q96P48 1450 aa42.24■■■■■ 4.35
GEMIN4-205ENST00000574958 ADAMTS12P58397 1594 aa42.2■■■■■ 4.35
GEMIN4-205ENST00000574958 GRIN2AQ12879 1464 aa42.15■■■■■ 4.34
GEMIN4-205ENST00000574958 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.14■■■■■ 4.34
GEMIN4-205ENST00000574958 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.09■■■■■ 4.33
GEMIN4-205ENST00000574958 CEP170Q5SW79 1584 aa41.98■■■■■ 4.31
GEMIN4-205ENST00000574958 NUP160Q12769 1436 aa41.97■■■■■ 4.31
GEMIN4-205ENST00000574958 KIF27Q86VH2 1401 aa41.78■■■■■ 4.28
GEMIN4-205ENST00000574958 SHROOM2Q13796 1616 aa41.75■■■■■ 4.27
GEMIN4-205ENST00000574958 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.75■■■■■ 4.27
GEMIN4-205ENST00000574958 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.69■■■■■ 4.26
GEMIN4-205ENST00000574958 IGF1RP08069 1367 aa41.67■■■■■ 4.26
GEMIN4-205ENST00000574958 CUL7Q14999 1698 aa41.65■■■■■ 4.26
GEMIN4-205ENST00000574958 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.6■■■■■ 4.25
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