RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574894.1

NOMO3-212, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

TSL 2

Gene NOMO3, Length 1,269 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-212ENST00000574894 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.48■■■■□ 3.43
NOMO3-212ENST00000574894 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.6■■■□□ 2.81
NOMO3-212ENST00000574894 ABCC9O60706 1549 aa32■■■□□ 2.71
NOMO3-212ENST00000574894 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.8■■■□□ 2.52
NOMO3-212ENST00000574894 NACADO15069 1562 aa30.72■■■□□ 2.51
NOMO3-212ENST00000574894 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.51■■■□□ 2.47
NOMO3-212ENST00000574894 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.51■■■□□ 2.47
NOMO3-212ENST00000574894 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
NOMO3-212ENST00000574894 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.26■■■□□ 2.43
NOMO3-212ENST00000574894 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.96■■■□□ 2.39
NOMO3-212ENST00000574894 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.84■■■□□ 2.37
NOMO3-212ENST00000574894 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.77■■■□□ 2.36
NOMO3-212ENST00000574894 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.65■■■□□ 2.34
NOMO3-212ENST00000574894 SCRIBQ14160 1630 aa29.61■■■□□ 2.33
NOMO3-212ENST00000574894 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.51■■■□□ 2.31
NOMO3-212ENST00000574894 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
NOMO3-212ENST00000574894 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.97■■■□□ 2.23
NOMO3-212ENST00000574894 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.85■■■□□ 2.21
NOMO3-212ENST00000574894 SMARCA4P51532 1647 aa28.35■■■□□ 2.13
NOMO3-212ENST00000574894 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
NOMO3-212ENST00000574894 NCAPD3P42695 1498 aa28.33■■■□□ 2.13
NOMO3-212ENST00000574894 SMARCA2P51531 1590 aa28.28■■■□□ 2.12
NOMO3-212ENST00000574894 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.26■■■□□ 2.11
NOMO3-212ENST00000574894 HMGXB3Q12766 1538 aa28.18■■■□□ 2.1
NOMO3-212ENST00000574894 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.12■■■□□ 2.09
NOMO3-212ENST00000574894 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.04■■■□□ 2.08
NOMO3-212ENST00000574894 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
NOMO3-212ENST00000574894 WIZO95785 1651 aa27.72■■■□□ 2.03
NOMO3-212ENST00000574894 ERCC6Q03468 1493 aa27.7■■■□□ 2.02
NOMO3-212ENST00000574894 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
NOMO3-212ENST00000574894 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.63■■■□□ 2.01
NOMO3-212ENST00000574894 NESP48681 1621 aa27.59■■■□□ 2.01
NOMO3-212ENST00000574894 CUX2O14529 1486 aa27.54■■■□□ 2
NOMO3-212ENST00000574894 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
NOMO3-212ENST00000574894 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.48■■□□□ 1.99
NOMO3-212ENST00000574894 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.48■■□□□ 1.99
NOMO3-212ENST00000574894 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
NOMO3-212ENST00000574894 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.28■■□□□ 1.96
NOMO3-212ENST00000574894 CFTRP13569 1480 aa27.26■■□□□ 1.95
NOMO3-212ENST00000574894 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.17■■□□□ 1.94
NOMO3-212ENST00000574894 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.15■■□□□ 1.94
NOMO3-212ENST00000574894 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.13■■□□□ 1.93
NOMO3-212ENST00000574894 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.13■■□□□ 1.93
NOMO3-212ENST00000574894 WDR62O43379 1518 aa27.08■■□□□ 1.93
NOMO3-212ENST00000574894 PRDM2Q13029 1718 aa27.02■■□□□ 1.92
NOMO3-212ENST00000574894 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.91■■□□□ 1.9
NOMO3-212ENST00000574894 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
NOMO3-212ENST00000574894 ABCC8Q09428 1581 aa26.77■■□□□ 1.88
NOMO3-212ENST00000574894 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
NOMO3-212ENST00000574894 TOPBP1Q92547 1522 aa26.66■■□□□ 1.86
NOMO3-212ENST00000574894 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.65■■□□□ 1.86
NOMO3-212ENST00000574894 IFT140Q96RY7 1462 aa26.62■■□□□ 1.85
NOMO3-212ENST00000574894 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
NOMO3-212ENST00000574894 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
NOMO3-212ENST00000574894 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
NOMO3-212ENST00000574894 CUX1P39880 1505 aa26.34■■□□□ 1.81
NOMO3-212ENST00000574894 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
NOMO3-212ENST00000574894 OSCARQ8IYS5 282 aa26.33■■□□□ 1.81
NOMO3-212ENST00000574894 SOGA1O94964 1423 aa26.32■■□□□ 1.8
NOMO3-212ENST00000574894 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.31■■□□□ 1.8
NOMO3-212ENST00000574894 WDR97A6NE52 1622 aa26.3■■□□□ 1.8
NOMO3-212ENST00000574894 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.25■■□□□ 1.79
NOMO3-212ENST00000574894 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.23■■□□□ 1.79
NOMO3-212ENST00000574894 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
NOMO3-212ENST00000574894 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.14■■□□□ 1.77
NOMO3-212ENST00000574894 TOP2BQ02880 1626 aa26.1■■□□□ 1.77
NOMO3-212ENST00000574894 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.09■■□□□ 1.77
NOMO3-212ENST00000574894 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.09■■□□□ 1.77
NOMO3-212ENST00000574894 GRIN2BQ13224 1484 aa26.08■■□□□ 1.77
NOMO3-212ENST00000574894 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
NOMO3-212ENST00000574894 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.03■■□□□ 1.76
NOMO3-212ENST00000574894 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.03■■□□□ 1.76
NOMO3-212ENST00000574894 CHD1O14646 1710 aa26.02■■□□□ 1.76
NOMO3-212ENST00000574894 SYNJ1O43426 1573 aa26.01■■□□□ 1.75
NOMO3-212ENST00000574894 FBLN2P98095 1184 aa25.99■■□□□ 1.75
NOMO3-212ENST00000574894 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.97■■□□□ 1.75
NOMO3-212ENST00000574894 PBRM1Q86U86 1689 aa25.95■■□□□ 1.74
NOMO3-212ENST00000574894 SYNJ2O15056 1496 aa25.94■■□□□ 1.74
NOMO3-212ENST00000574894 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
NOMO3-212ENST00000574894 TRIM41Q8WV44 630 aa25.86■■□□□ 1.73
NOMO3-212ENST00000574894 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.85■■□□□ 1.73
NOMO3-212ENST00000574894 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.85■■□□□ 1.73
NOMO3-212ENST00000574894 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.85■■□□□ 1.73
NOMO3-212ENST00000574894 ARHGEF11O15085 1522 aa25.85■■□□□ 1.73
NOMO3-212ENST00000574894 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.8■■□□□ 1.72
NOMO3-212ENST00000574894 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.78■■□□□ 1.72
NOMO3-212ENST00000574894 ADAMTS12P58397 1594 aa25.75■■□□□ 1.71
NOMO3-212ENST00000574894 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.74■■□□□ 1.71
NOMO3-212ENST00000574894 GRIN2AQ12879 1464 aa25.72■■□□□ 1.71
NOMO3-212ENST00000574894 KIF27Q86VH2 1401 aa25.65■■□□□ 1.7
NOMO3-212ENST00000574894 NUP160Q12769 1436 aa25.63■■□□□ 1.69
NOMO3-212ENST00000574894 ARAP1Q96P48 1450 aa25.6■■□□□ 1.69
NOMO3-212ENST00000574894 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.6■■□□□ 1.69
NOMO3-212ENST00000574894 CEP170Q5SW79 1584 aa25.55■■□□□ 1.68
NOMO3-212ENST00000574894 CUL7Q14999 1698 aa25.52■■□□□ 1.68
NOMO3-212ENST00000574894 IGF1RP08069 1367 aa25.51■■□□□ 1.67
NOMO3-212ENST00000574894 SHROOM2Q13796 1616 aa25.45■■□□□ 1.66
NOMO3-212ENST00000574894 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.38■■□□□ 1.65
NOMO3-212ENST00000574894 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.37■■□□□ 1.65
NOMO3-212ENST00000574894 JPH4Q96JJ6 628 aa25.35■■□□□ 1.65
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