RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574701.5

LITAF-213, Transcript of lipopolysaccharide induced TNF factor, humanhuman

TSL 4

Gene LITAF, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LITAF-213ENST00000574701 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.58■■■■■ 6.97
LITAF-213ENST00000574701 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.1■■■■■ 5.93
LITAF-213ENST00000574701 ABCC9O60706 1549 aa50.7■■■■■ 5.71
LITAF-213ENST00000574701 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.93■■■■■ 5.42
LITAF-213ENST00000574701 NACADO15069 1562 aa48.9■■■■■ 5.42
LITAF-213ENST00000574701 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.87■■■■■ 5.41
LITAF-213ENST00000574701 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.85■■■■■ 5.41
LITAF-213ENST00000574701 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.63■■■■■ 5.38
LITAF-213ENST00000574701 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.5■■■■■ 5.35
LITAF-213ENST00000574701 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.8■■■■■ 5.24
LITAF-213ENST00000574701 SCRIBQ14160 1630 aa47.52■■■■■ 5.2
LITAF-213ENST00000574701 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.35■■■■■ 5.17
LITAF-213ENST00000574701 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.34■■■■■ 5.17
LITAF-213ENST00000574701 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.97■■■■■ 5.11
LITAF-213ENST00000574701 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.19■■■■■ 4.98
LITAF-213ENST00000574701 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.13■■■■■ 4.98
LITAF-213ENST00000574701 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.9■■■■■ 4.94
LITAF-213ENST00000574701 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.57■■■■■ 4.89
LITAF-213ENST00000574701 SMARCA4P51532 1647 aa45.47■■■■■ 4.87
LITAF-213ENST00000574701 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.45■■■■■ 4.87
LITAF-213ENST00000574701 SMARCA2P51531 1590 aa45.15■■■■■ 4.82
LITAF-213ENST00000574701 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.13■■■■■ 4.82
LITAF-213ENST00000574701 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.11■■■■■ 4.81
LITAF-213ENST00000574701 NCAPD3P42695 1498 aa45.04■■■■■ 4.8
LITAF-213ENST00000574701 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.99■■■■■ 4.79
LITAF-213ENST00000574701 HMGXB3Q12766 1538 aa44.92■■■■■ 4.78
LITAF-213ENST00000574701 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.81■■■■■ 4.76
LITAF-213ENST00000574701 WIZO95785 1651 aa44.7■■■■■ 4.75
LITAF-213ENST00000574701 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.67■■■■■ 4.74
LITAF-213ENST00000574701 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.27■■■■■ 4.68
LITAF-213ENST00000574701 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.91■■■■■ 4.62
LITAF-213ENST00000574701 NESP48681 1621 aa43.9■■■■■ 4.62
LITAF-213ENST00000574701 ERCC6Q03468 1493 aa43.76■■■■■ 4.6
LITAF-213ENST00000574701 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.75■■■■■ 4.59
LITAF-213ENST00000574701 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.7■■■■■ 4.59
LITAF-213ENST00000574701 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.67■■■■■ 4.58
LITAF-213ENST00000574701 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.58■■■■■ 4.57
LITAF-213ENST00000574701 CFTRP13569 1480 aa43.54■■■■■ 4.56
LITAF-213ENST00000574701 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.48■■■■■ 4.55
LITAF-213ENST00000574701 PRDM2Q13029 1718 aa43.37■■■■■ 4.53
LITAF-213ENST00000574701 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.29■■■■■ 4.52
LITAF-213ENST00000574701 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.28■■■■■ 4.52
LITAF-213ENST00000574701 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.25■■■■■ 4.51
LITAF-213ENST00000574701 CUX2O14529 1486 aa43.21■■■■■ 4.51
LITAF-213ENST00000574701 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.14■■■■■ 4.5
LITAF-213ENST00000574701 WDR62O43379 1518 aa42.99■■■■■ 4.47
LITAF-213ENST00000574701 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.81■■■■■ 4.44
LITAF-213ENST00000574701 ABCC8Q09428 1581 aa42.65■■■■■ 4.42
LITAF-213ENST00000574701 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.62■■■■■ 4.41
LITAF-213ENST00000574701 TOPBP1Q92547 1522 aa42.61■■■■■ 4.41
LITAF-213ENST00000574701 CUX1P39880 1505 aa42.35■■■■■ 4.37
LITAF-213ENST00000574701 IFT140Q96RY7 1462 aa42.32■■■■■ 4.37
LITAF-213ENST00000574701 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.26■■■■■ 4.36
LITAF-213ENST00000574701 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.2■■■■■ 4.35
LITAF-213ENST00000574701 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.17■■■■■ 4.34
LITAF-213ENST00000574701 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.13■■■■■ 4.33
LITAF-213ENST00000574701 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.09■■■■■ 4.33
LITAF-213ENST00000574701 TOP2BQ02880 1626 aa42.08■■■■■ 4.33
LITAF-213ENST00000574701 SOGA1O94964 1423 aa42.07■■■■■ 4.33
LITAF-213ENST00000574701 SYNJ1O43426 1573 aa42.05■■■■■ 4.32
LITAF-213ENST00000574701 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.05■■■■■ 4.32
LITAF-213ENST00000574701 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.04■■■■■ 4.32
LITAF-213ENST00000574701 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.98■■■■■ 4.31
LITAF-213ENST00000574701 WDR97A6NE52 1622 aa41.9■■■■■ 4.3
LITAF-213ENST00000574701 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.84■■■■■ 4.292e-8■■■□□ 18.1
LITAF-213ENST00000574701 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.79■■■■■ 4.28
LITAF-213ENST00000574701 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.78■■■■■ 4.28
LITAF-213ENST00000574701 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.65■■■■■ 4.26
LITAF-213ENST00000574701 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.62■■■■■ 4.25
LITAF-213ENST00000574701 PBRM1Q86U86 1689 aa41.6■■■■■ 4.25
LITAF-213ENST00000574701 GRIN2BQ13224 1484 aa41.6■■■■■ 4.25
LITAF-213ENST00000574701 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.52■■■■■ 4.24
LITAF-213ENST00000574701 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.52■■■■■ 4.24
LITAF-213ENST00000574701 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.48■■■■■ 4.23
LITAF-213ENST00000574701 CHD1O14646 1710 aa41.43■■■■■ 4.22
LITAF-213ENST00000574701 OSCARQ8IYS5 282 aa41.38■■■■■ 4.21
LITAF-213ENST00000574701 FBLN2P98095 1184 aa41.33■■■■■ 4.21
LITAF-213ENST00000574701 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.33■■■■■ 4.21
LITAF-213ENST00000574701 SYNJ2O15056 1496 aa41.3■■■■■ 4.2
LITAF-213ENST00000574701 KIF27Q86VH2 1401 aa41.29■■■■■ 4.2
LITAF-213ENST00000574701 TRIM41Q8WV44 630 aa41.28■■■■■ 4.2
LITAF-213ENST00000574701 ADAMTS12P58397 1594 aa41.25■■■■■ 4.19
LITAF-213ENST00000574701 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.25■■■■■ 4.19
LITAF-213ENST00000574701 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.15■■■■■ 4.18
LITAF-213ENST00000574701 GRIN2AQ12879 1464 aa41.06■■■■■ 4.16
LITAF-213ENST00000574701 CUL7Q14999 1698 aa41.04■■■■■ 4.16
LITAF-213ENST00000574701 IGF1RP08069 1367 aa40.99■■■■■ 4.15
LITAF-213ENST00000574701 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.93■■■■■ 4.14
LITAF-213ENST00000574701 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.88■■■■■ 4.14
LITAF-213ENST00000574701 CEP170Q5SW79 1584 aa40.85■■■■■ 4.13
LITAF-213ENST00000574701 NUP160Q12769 1436 aa40.84■■■■■ 4.13
LITAF-213ENST00000574701 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.84■■■■■ 4.13
LITAF-213ENST00000574701 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.82■■■■■ 4.12
LITAF-213ENST00000574701 ARHGEF11O15085 1522 aa40.76■■■■■ 4.12
LITAF-213ENST00000574701 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.75■■■■■ 4.11
LITAF-213ENST00000574701 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.75■■■■■ 4.11
LITAF-213ENST00000574701 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.75■■■■■ 4.11
LITAF-213ENST00000574701 EEA1Q15075 1411 aa40.65■■■■■ 4.1
LITAF-213ENST00000574701 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.64■■■■■ 4.1
LITAF-213ENST00000574701 SHROOM2Q13796 1616 aa40.55■■■■■ 4.08
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