RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574407.5

PHF23-210, Transcript of PHD finger protein 23, humanhuman

TSL 2

Gene PHF23, Length 497 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF23-210ENST00000574407 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.07■■■■■ 5.93
PHF23-210ENST00000574407 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.68■■■■■ 5.06
PHF23-210ENST00000574407 ABCC9O60706 1549 aa46.1■■■■■ 4.97
PHF23-210ENST00000574407 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.11■■■■■ 4.65
PHF23-210ENST00000574407 NACADO15069 1562 aa43.9■■■■■ 4.62
PHF23-210ENST00000574407 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.56■■■■■ 4.56
PHF23-210ENST00000574407 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.43■■■■■ 4.54
PHF23-210ENST00000574407 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.37■■■■■ 4.53
PHF23-210ENST00000574407 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.29■■■■■ 4.52
PHF23-210ENST00000574407 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.04■■■■■ 4.48
PHF23-210ENST00000574407 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.89■■■■■ 4.46
PHF23-210ENST00000574407 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.87■■■■■ 4.45
PHF23-210ENST00000574407 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.78■■■■■ 4.44
PHF23-210ENST00000574407 SCRIBQ14160 1630 aa42.52■■■■■ 4.4
PHF23-210ENST00000574407 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.25■■■■■ 4.35
PHF23-210ENST00000574407 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.76■■■■■ 4.27
PHF23-210ENST00000574407 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.75■■■■■ 4.27
PHF23-210ENST00000574407 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.46■■■■■ 4.23
PHF23-210ENST00000574407 SMARCA4P51532 1647 aa40.6■■■■■ 4.09
PHF23-210ENST00000574407 NCAPD3P42695 1498 aa40.45■■■■■ 4.07
PHF23-210ENST00000574407 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.43■■■■■ 4.06
PHF23-210ENST00000574407 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.4■■■■■ 4.06
PHF23-210ENST00000574407 SMARCA2P51531 1590 aa40.37■■■■■ 4.05
PHF23-210ENST00000574407 HMGXB3Q12766 1538 aa40.3■■■■■ 4.04
PHF23-210ENST00000574407 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.19■■■■■ 4.02
PHF23-210ENST00000574407 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.15■■■■■ 4.02
PHF23-210ENST00000574407 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.07■■■■■ 4.01
PHF23-210ENST00000574407 WIZO95785 1651 aa39.76■■■■□ 3.96
PHF23-210ENST00000574407 NESP48681 1621 aa39.76■■■■□ 3.95
PHF23-210ENST00000574407 ERCC6Q03468 1493 aa39.74■■■■□ 3.95
PHF23-210ENST00000574407 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.58■■■■□ 3.93
PHF23-210ENST00000574407 CUX2O14529 1486 aa39.55■■■■□ 3.92
PHF23-210ENST00000574407 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.41■■■■□ 3.9
PHF23-210ENST00000574407 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.4■■■■□ 3.9
PHF23-210ENST00000574407 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.38■■■■□ 3.89
PHF23-210ENST00000574407 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.24■■■■□ 3.87
PHF23-210ENST00000574407 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.22■■■■□ 3.87
PHF23-210ENST00000574407 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.2■■■■□ 3.87
PHF23-210ENST00000574407 CFTRP13569 1480 aa38.92■■■■□ 3.82
PHF23-210ENST00000574407 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.92■■■■□ 3.82
PHF23-210ENST00000574407 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.9■■■■□ 3.82
PHF23-210ENST00000574407 WDR62O43379 1518 aa38.87■■■■□ 3.81
PHF23-210ENST00000574407 PRDM2Q13029 1718 aa38.86■■■■□ 3.81
PHF23-210ENST00000574407 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.85■■■■□ 3.81
PHF23-210ENST00000574407 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.84■■■■□ 3.81
PHF23-210ENST00000574407 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.73■■■■□ 3.79
PHF23-210ENST00000574407 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.53■■■■□ 3.76
PHF23-210ENST00000574407 TOPBP1Q92547 1522 aa38.18■■■■□ 3.7
PHF23-210ENST00000574407 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.11■■■■□ 3.69
PHF23-210ENST00000574407 ABCC8Q09428 1581 aa38.06■■■■□ 3.68
PHF23-210ENST00000574407 IFT140Q96RY7 1462 aa38.03■■■■□ 3.68
PHF23-210ENST00000574407 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.97■■■■□ 3.67
PHF23-210ENST00000574407 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.89■■■■□ 3.66
PHF23-210ENST00000574407 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.88■■■■□ 3.65
PHF23-210ENST00000574407 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.88■■■■□ 3.65
PHF23-210ENST00000574407 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.82■■■■□ 3.64
PHF23-210ENST00000574407 CUX1P39880 1505 aa37.71■■■■□ 3.63
PHF23-210ENST00000574407 OSCARQ8IYS5 282 aa37.66■■■■□ 3.62
PHF23-210ENST00000574407 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.65■■■■□ 3.62
PHF23-210ENST00000574407 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.64■■■■□ 3.62
PHF23-210ENST00000574407 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.63■■■■□ 3.618e-8■■■■□ 25.8
PHF23-210ENST00000574407 CHD1O14646 1710 aa37.59■■■■□ 3.61
PHF23-210ENST00000574407 SOGA1O94964 1423 aa37.56■■■■□ 3.6
PHF23-210ENST00000574407 WDR97A6NE52 1622 aa37.53■■■■□ 3.6
PHF23-210ENST00000574407 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.43■■■■□ 3.58
PHF23-210ENST00000574407 TRIM41Q8WV44 630 aa37.4■■■■□ 3.58
PHF23-210ENST00000574407 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.38■■■■□ 3.57
PHF23-210ENST00000574407 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.38■■■■□ 3.57
PHF23-210ENST00000574407 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.38■■■■□ 3.57
PHF23-210ENST00000574407 PBRM1Q86U86 1689 aa37.33■■■■□ 3.57
PHF23-210ENST00000574407 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.32■■■■□ 3.56
PHF23-210ENST00000574407 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.3■■■■□ 3.56
PHF23-210ENST00000574407 TOP2BQ02880 1626 aa37.25■■■■□ 3.55
PHF23-210ENST00000574407 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.25■■■■□ 3.55
PHF23-210ENST00000574407 ARHGEF11O15085 1522 aa37.24■■■■□ 3.55
PHF23-210ENST00000574407 SYNJ1O43426 1573 aa37.24■■■■□ 3.55
PHF23-210ENST00000574407 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.23■■■■□ 3.55
PHF23-210ENST00000574407 GRIN2BQ13224 1484 aa37.22■■■■□ 3.55
PHF23-210ENST00000574407 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.21■■■■□ 3.55
PHF23-210ENST00000574407 FBLN2P98095 1184 aa37.19■■■■□ 3.54
PHF23-210ENST00000574407 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.17■■■■□ 3.54
PHF23-210ENST00000574407 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.16■■■■□ 3.54
PHF23-210ENST00000574407 SYNJ2O15056 1496 aa37.07■■■■□ 3.53
PHF23-210ENST00000574407 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.06■■■■□ 3.52
PHF23-210ENST00000574407 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.99■■■■□ 3.51
PHF23-210ENST00000574407 ADAMTS12P58397 1594 aa36.92■■■■□ 3.5
PHF23-210ENST00000574407 ARAP1Q96P48 1450 aa36.91■■■■□ 3.5
PHF23-210ENST00000574407 GRIN2AQ12879 1464 aa36.79■■■■□ 3.48
PHF23-210ENST00000574407 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.79■■■■□ 3.48
PHF23-210ENST00000574407 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.78■■■■□ 3.48
PHF23-210ENST00000574407 CEP170Q5SW79 1584 aa36.71■■■■□ 3.47
PHF23-210ENST00000574407 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.68■■■■□ 3.46
PHF23-210ENST00000574407 NUP160Q12769 1436 aa36.64■■■■□ 3.46
PHF23-210ENST00000574407 SHROOM2Q13796 1616 aa36.54■■■■□ 3.44
PHF23-210ENST00000574407 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.53■■■■□ 3.44
PHF23-210ENST00000574407 CUL7Q14999 1698 aa36.41■■■■□ 3.42
PHF23-210ENST00000574407 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.4■■■■□ 3.42
PHF23-210ENST00000574407 KIF27Q86VH2 1401 aa36.4■■■■□ 3.42
PHF23-210ENST00000574407 IGF1RP08069 1367 aa36.31■■■■□ 3.4
PHF23-210ENST00000574407 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.21■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 279.3 ms