RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574042.2

TRIM16L-211, Transcript of tripartite motif containing 16 like, humanhuman

TSL 3

Gene TRIM16L, Length 791 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16L-211ENST00000574042 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.68■■■□□ 2.18
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TRIM16L-211ENST00000574042 ABCC9O60706 1549 aa25.6■■□□□ 1.69
TRIM16L-211ENST00000574042 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.5■■□□□ 1.51
TRIM16L-211ENST00000574042 NACADO15069 1562 aa24.34■■□□□ 1.49
TRIM16L-211ENST00000574042 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.07■■□□□ 1.44
TRIM16L-211ENST00000574042 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.93■■□□□ 1.42
TRIM16L-211ENST00000574042 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.93■■□□□ 1.42
TRIM16L-211ENST00000574042 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.84■■□□□ 1.41
TRIM16L-211ENST00000574042 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
TRIM16L-211ENST00000574042 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.77■■□□□ 1.4
TRIM16L-211ENST00000574042 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.75■■□□□ 1.39
TRIM16L-211ENST00000574042 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.73■■□□□ 1.39
TRIM16L-211ENST00000574042 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.57■■□□□ 1.36
TRIM16L-211ENST00000574042 SCRIBQ14160 1630 aa23.44■■□□□ 1.34
TRIM16L-211ENST00000574042 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.19■■□□□ 1.3
TRIM16L-211ENST00000574042 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
TRIM16L-211ENST00000574042 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.09■■□□□ 1.29
TRIM16L-211ENST00000574042 NCAPD3P42695 1498 aa22.41■■□□□ 1.18
TRIM16L-211ENST00000574042 SMARCA4P51532 1647 aa22.4■■□□□ 1.18
TRIM16L-211ENST00000574042 SMARCA2P51531 1590 aa22.36■■□□□ 1.17
TRIM16L-211ENST00000574042 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.35■■□□□ 1.17
TRIM16L-211ENST00000574042 HMGXB3Q12766 1538 aa22.35■■□□□ 1.17
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TRIM16L-211ENST00000574042 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.21■■□□□ 1.15
TRIM16L-211ENST00000574042 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
TRIM16L-211ENST00000574042 CUX2O14529 1486 aa22.15■■□□□ 1.14
TRIM16L-211ENST00000574042 ERCC6Q03468 1493 aa22.14■■□□□ 1.13
TRIM16L-211ENST00000574042 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.07■■□□□ 1.12
TRIM16L-211ENST00000574042 NESP48681 1621 aa22■■□□□ 1.11
TRIM16L-211ENST00000574042 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.96■■□□□ 1.11
TRIM16L-211ENST00000574042 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.91■■□□□ 1.1
TRIM16L-211ENST00000574042 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
TRIM16L-211ENST00000574042 WIZO95785 1651 aa21.81■■□□□ 1.08
TRIM16L-211ENST00000574042 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.8■■□□□ 1.08
TRIM16L-211ENST00000574042 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.78■■□□□ 1.08
TRIM16L-211ENST00000574042 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.7■■□□□ 1.06
TRIM16L-211ENST00000574042 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.62■■□□□ 1.05
TRIM16L-211ENST00000574042 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
TRIM16L-211ENST00000574042 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
TRIM16L-211ENST00000574042 WDR62O43379 1518 aa21.6■■□□□ 1.05
TRIM16L-211ENST00000574042 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.54■■□□□ 1.04
TRIM16L-211ENST00000574042 CFTRP13569 1480 aa21.52■■□□□ 1.03
TRIM16L-211ENST00000574042 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.49■■□□□ 1.03
TRIM16L-211ENST00000574042 PRDM2Q13029 1718 aa21.41■■□□□ 1.02
TRIM16L-211ENST00000574042 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
TRIM16L-211ENST00000574042 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.26■□□□□ 0.99
TRIM16L-211ENST00000574042 TOPBP1Q92547 1522 aa21.1■□□□□ 0.97
TRIM16L-211ENST00000574042 IFT140Q96RY7 1462 aa21.1■□□□□ 0.97
TRIM16L-211ENST00000574042 ABCC8Q09428 1581 aa21.08■□□□□ 0.97
TRIM16L-211ENST00000574042 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.07■□□□□ 0.96
TRIM16L-211ENST00000574042 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
TRIM16L-211ENST00000574042 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
TRIM16L-211ENST00000574042 OSCARQ8IYS5 282 aa20.98■□□□□ 0.95
TRIM16L-211ENST00000574042 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
TRIM16L-211ENST00000574042 TRIM41Q8WV44 630 aa20.92■□□□□ 0.94
TRIM16L-211ENST00000574042 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.94
TRIM16L-211ENST00000574042 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.83■□□□□ 0.93
TRIM16L-211ENST00000574042 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.83■□□□□ 0.93
TRIM16L-211ENST00000574042 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.83■□□□□ 0.93
TRIM16L-211ENST00000574042 WDR97A6NE52 1622 aa20.82■□□□□ 0.92
TRIM16L-211ENST00000574042 CHD1O14646 1710 aa20.81■□□□□ 0.92
TRIM16L-211ENST00000574042 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.78■□□□□ 0.92
TRIM16L-211ENST00000574042 ARHGEF11O15085 1522 aa20.77■□□□□ 0.92
TRIM16L-211ENST00000574042 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.76■□□□□ 0.91
TRIM16L-211ENST00000574042 CUX1P39880 1505 aa20.76■□□□□ 0.91
TRIM16L-211ENST00000574042 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.75■□□□□ 0.91
TRIM16L-211ENST00000574042 SOGA1O94964 1423 aa20.73■□□□□ 0.91
TRIM16L-211ENST00000574042 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.66■□□□□ 0.9
TRIM16L-211ENST00000574042 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
TRIM16L-211ENST00000574042 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
TRIM16L-211ENST00000574042 GRIN2BQ13224 1484 aa20.62■□□□□ 0.89
TRIM16L-211ENST00000574042 PBRM1Q86U86 1689 aa20.59■□□□□ 0.89
TRIM16L-211ENST00000574042 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.58■□□□□ 0.89
TRIM16L-211ENST00000574042 SYNJ1O43426 1573 aa20.58■□□□□ 0.88
TRIM16L-211ENST00000574042 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.57■□□□□ 0.88
TRIM16L-211ENST00000574042 FBLN2P98095 1184 aa20.56■□□□□ 0.88
TRIM16L-211ENST00000574042 ARAP1Q96P48 1450 aa20.56■□□□□ 0.88
TRIM16L-211ENST00000574042 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.55■□□□□ 0.88
TRIM16L-211ENST00000574042 SYNJ2O15056 1496 aa20.55■□□□□ 0.88
TRIM16L-211ENST00000574042 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
TRIM16L-211ENST00000574042 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.52■□□□□ 0.88
TRIM16L-211ENST00000574042 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.5■□□□□ 0.87
TRIM16L-211ENST00000574042 TOP2BQ02880 1626 aa20.47■□□□□ 0.87
TRIM16L-211ENST00000574042 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
TRIM16L-211ENST00000574042 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.44■□□□□ 0.86
TRIM16L-211ENST00000574042 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.44■□□□□ 0.86
TRIM16L-211ENST00000574042 ADAMTS12P58397 1594 aa20.41■□□□□ 0.86
TRIM16L-211ENST00000574042 GRIN2AQ12879 1464 aa20.36■□□□□ 0.85
TRIM16L-211ENST00000574042 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.32■□□□□ 0.84
TRIM16L-211ENST00000574042 NUP160Q12769 1436 aa20.29■□□□□ 0.84
TRIM16L-211ENST00000574042 CEP170Q5SW79 1584 aa20.29■□□□□ 0.84
TRIM16L-211ENST00000574042 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.27■□□□□ 0.84
TRIM16L-211ENST00000574042 SHROOM2Q13796 1616 aa20.24■□□□□ 0.83
TRIM16L-211ENST00000574042 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
TRIM16L-211ENST00000574042 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.19■□□□□ 0.82
TRIM16L-211ENST00000574042 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.14■□□□□ 0.81
TRIM16L-211ENST00000574042 CUL7Q14999 1698 aa20.07■□□□□ 0.8
TRIM16L-211ENST00000574042 KIF27Q86VH2 1401 aa20.02■□□□□ 0.8
TRIM16L-211ENST00000574042 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
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