RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573823.5

SCPEP1-212, Transcript of serine carboxypeptidase 1, humanhuman

TSL 3

Gene SCPEP1, Length 581 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCPEP1-212ENST00000573823 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.17■■■■□ 3.7
SCPEP1-212ENST00000573823 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.37■■■■□ 3.09
SCPEP1-212ENST00000573823 ABCC9O60706 1549 aa34.03■■■■□ 3.04
SCPEP1-212ENST00000573823 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.51■■■□□ 2.79
SCPEP1-212ENST00000573823 NACADO15069 1562 aa32.32■■■□□ 2.77
SCPEP1-212ENST00000573823 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.05■■■□□ 2.72
SCPEP1-212ENST00000573823 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.95■■■□□ 2.71
SCPEP1-212ENST00000573823 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.77■■■□□ 2.68
SCPEP1-212ENST00000573823 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.76■■■□□ 2.67
SCPEP1-212ENST00000573823 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.72■■■□□ 2.67
SCPEP1-212ENST00000573823 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.68■■■□□ 2.66
SCPEP1-212ENST00000573823 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.59■■■□□ 2.65
SCPEP1-212ENST00000573823 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.55■■■□□ 2.64
SCPEP1-212ENST00000573823 SCRIBQ14160 1630 aa31.22■■■□□ 2.59
SCPEP1-212ENST00000573823 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.2■■■□□ 2.58
SCPEP1-212ENST00000573823 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.87■■■□□ 2.53
SCPEP1-212ENST00000573823 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.82■■■□□ 2.52
SCPEP1-212ENST00000573823 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.63■■■□□ 2.49
SCPEP1-212ENST00000573823 SMARCA4P51532 1647 aa29.84■■■□□ 2.37
SCPEP1-212ENST00000573823 NCAPD3P42695 1498 aa29.78■■■□□ 2.36
SCPEP1-212ENST00000573823 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.73■■■□□ 2.35
SCPEP1-212ENST00000573823 HMGXB3Q12766 1538 aa29.69■■■□□ 2.34
SCPEP1-212ENST00000573823 SMARCA2P51531 1590 aa29.67■■■□□ 2.34
SCPEP1-212ENST00000573823 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
SCPEP1-212ENST00000573823 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.57■■■□□ 2.32
SCPEP1-212ENST00000573823 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.43■■■□□ 2.3
SCPEP1-212ENST00000573823 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
SCPEP1-212ENST00000573823 CUX2O14529 1486 aa29.33■■■□□ 2.29
SCPEP1-212ENST00000573823 NESP48681 1621 aa29.32■■■□□ 2.28
SCPEP1-212ENST00000573823 ERCC6Q03468 1493 aa29.3■■■□□ 2.28
SCPEP1-212ENST00000573823 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
SCPEP1-212ENST00000573823 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.17■■■□□ 2.26
SCPEP1-212ENST00000573823 WIZO95785 1651 aa29.14■■■□□ 2.26
SCPEP1-212ENST00000573823 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.11■■■□□ 2.25
SCPEP1-212ENST00000573823 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.01■■■□□ 2.23
SCPEP1-212ENST00000573823 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.84■■■□□ 2.21
SCPEP1-212ENST00000573823 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.81■■■□□ 2.2
SCPEP1-212ENST00000573823 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
SCPEP1-212ENST00000573823 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
SCPEP1-212ENST00000573823 WDR62O43379 1518 aa28.71■■■□□ 2.19
SCPEP1-212ENST00000573823 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.69■■■□□ 2.18
SCPEP1-212ENST00000573823 PRDM2Q13029 1718 aa28.6■■■□□ 2.17
SCPEP1-212ENST00000573823 CFTRP13569 1480 aa28.59■■■□□ 2.17
SCPEP1-212ENST00000573823 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.58■■■□□ 2.17
SCPEP1-212ENST00000573823 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.55■■■□□ 2.16
SCPEP1-212ENST00000573823 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
SCPEP1-212ENST00000573823 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.33■■■□□ 2.13
SCPEP1-212ENST00000573823 TOPBP1Q92547 1522 aa28.08■■■□□ 2.08
SCPEP1-212ENST00000573823 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.02■■■□□ 2.08
SCPEP1-212ENST00000573823 IFT140Q96RY7 1462 aa27.99■■■□□ 2.07
SCPEP1-212ENST00000573823 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
SCPEP1-212ENST00000573823 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
SCPEP1-212ENST00000573823 ABCC8Q09428 1581 aa27.92■■■□□ 2.06
SCPEP1-212ENST00000573823 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
SCPEP1-212ENST00000573823 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
SCPEP1-212ENST00000573823 OSCARQ8IYS5 282 aa27.77■■■□□ 2.04
SCPEP1-212ENST00000573823 CHD1O14646 1710 aa27.76■■■□□ 2.03
SCPEP1-212ENST00000573823 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.71■■■□□ 2.03
SCPEP1-212ENST00000573823 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.71■■■□□ 2.03
SCPEP1-212ENST00000573823 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.71■■■□□ 2.03
SCPEP1-212ENST00000573823 TRIM41Q8WV44 630 aa27.71■■■□□ 2.03
SCPEP1-212ENST00000573823 CUX1P39880 1505 aa27.67■■■□□ 2.02
SCPEP1-212ENST00000573823 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.65■■■□□ 2.02
SCPEP1-212ENST00000573823 WDR97A6NE52 1622 aa27.65■■■□□ 2.02
SCPEP1-212ENST00000573823 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.64■■■□□ 2.01
SCPEP1-212ENST00000573823 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.62■■■□□ 2.01
SCPEP1-212ENST00000573823 ARHGEF11O15085 1522 aa27.58■■■□□ 2.01
SCPEP1-212ENST00000573823 SOGA1O94964 1423 aa27.52■■■□□ 2
SCPEP1-212ENST00000573823 PBRM1Q86U86 1689 aa27.47■■□□□ 1.99
SCPEP1-212ENST00000573823 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.45■■□□□ 1.99
SCPEP1-212ENST00000573823 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
SCPEP1-212ENST00000573823 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.4■■□□□ 1.98
SCPEP1-212ENST00000573823 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.39■■□□□ 1.98
SCPEP1-212ENST00000573823 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
SCPEP1-212ENST00000573823 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.34■■□□□ 1.97
SCPEP1-212ENST00000573823 GRIN2BQ13224 1484 aa27.34■■□□□ 1.97
SCPEP1-212ENST00000573823 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
SCPEP1-212ENST00000573823 ARAP1Q96P48 1450 aa27.33■■□□□ 1.97
SCPEP1-212ENST00000573823 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.32■■□□□ 1.96
SCPEP1-212ENST00000573823 SYNJ1O43426 1573 aa27.29■■□□□ 1.96
SCPEP1-212ENST00000573823 TOP2BQ02880 1626 aa27.27■■□□□ 1.96
SCPEP1-212ENST00000573823 SYNJ2O15056 1496 aa27.26■■□□□ 1.95
SCPEP1-212ENST00000573823 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.26■■□□□ 1.95
SCPEP1-212ENST00000573823 FBLN2P98095 1184 aa27.24■■□□□ 1.95
SCPEP1-212ENST00000573823 ADAMTS12P58397 1594 aa27.16■■□□□ 1.94
SCPEP1-212ENST00000573823 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.12■■□□□ 1.93
SCPEP1-212ENST00000573823 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.11■■□□□ 1.93
SCPEP1-212ENST00000573823 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
SCPEP1-212ENST00000573823 GRIN2AQ12879 1464 aa27.04■■□□□ 1.92
SCPEP1-212ENST00000573823 CEP170Q5SW79 1584 aa27.03■■□□□ 1.92
SCPEP1-212ENST00000573823 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.99■■□□□ 1.91
SCPEP1-212ENST00000573823 NUP160Q12769 1436 aa26.97■■□□□ 1.91
SCPEP1-212ENST00000573823 SHROOM2Q13796 1616 aa26.96■■□□□ 1.91
SCPEP1-212ENST00000573823 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.95■■□□□ 1.9
SCPEP1-212ENST00000573823 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.9■■□□□ 1.9
SCPEP1-212ENST00000573823 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.8■■□□□ 1.88
SCPEP1-212ENST00000573823 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
SCPEP1-212ENST00000573823 CUL7Q14999 1698 aa26.68■■□□□ 1.86
SCPEP1-212ENST00000573823 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.58■■□□□ 1.85
SCPEP1-212ENST00000573823 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
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