RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572078.1

SPNS3-202, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS3, Length 463 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-202ENST00000572078 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.79■■■■□ 3.16
SPNS3-202ENST00000572078 ABCC9O60706 1549 aa31.48■■■□□ 2.63
SPNS3-202ENST00000572078 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.28■■■□□ 2.6
SPNS3-202ENST00000572078 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.82■■■□□ 2.36
SPNS3-202ENST00000572078 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.75■■■□□ 2.35
SPNS3-202ENST00000572078 NACADO15069 1562 aa29.57■■■□□ 2.32
SPNS3-202ENST00000572078 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.32■■■□□ 2.28
SPNS3-202ENST00000572078 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.28■■■□□ 2.28
SPNS3-202ENST00000572078 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.26■■■□□ 2.27
SPNS3-202ENST00000572078 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.11■■■□□ 2.25
SPNS3-202ENST00000572078 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.09■■■□□ 2.25
SPNS3-202ENST00000572078 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
SPNS3-202ENST00000572078 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.69■■■□□ 2.18
SPNS3-202ENST00000572078 SCRIBQ14160 1630 aa28.54■■■□□ 2.16
SPNS3-202ENST00000572078 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.53■■■□□ 2.16
SPNS3-202ENST00000572078 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.43■■■□□ 2.14
SPNS3-202ENST00000572078 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.34■■■□□ 2.13
SPNS3-202ENST00000572078 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.12
SPNS3-202ENST00000572078 NCAPD3P42695 1498 aa27.32■■□□□ 1.96
SPNS3-202ENST00000572078 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.32■■□□□ 1.96
SPNS3-202ENST00000572078 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.25■■□□□ 1.95
SPNS3-202ENST00000572078 SMARCA4P51532 1647 aa27.19■■□□□ 1.94
SPNS3-202ENST00000572078 CUX2O14529 1486 aa27.13■■□□□ 1.93
SPNS3-202ENST00000572078 HMGXB3Q12766 1538 aa27.12■■□□□ 1.93
SPNS3-202ENST00000572078 ERCC6Q03468 1493 aa27.11■■□□□ 1.93
SPNS3-202ENST00000572078 SMARCA2P51531 1590 aa27.1■■□□□ 1.93
SPNS3-202ENST00000572078 NESP48681 1621 aa27.04■■□□□ 1.92
SPNS3-202ENST00000572078 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
SPNS3-202ENST00000572078 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
SPNS3-202ENST00000572078 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.92■■□□□ 1.9
SPNS3-202ENST00000572078 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.85■■□□□ 1.89
SPNS3-202ENST00000572078 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
SPNS3-202ENST00000572078 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.72■■□□□ 1.87
SPNS3-202ENST00000572078 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.68■■□□□ 1.86
SPNS3-202ENST00000572078 WIZO95785 1651 aa26.52■■□□□ 1.84
SPNS3-202ENST00000572078 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.52■■□□□ 1.84
SPNS3-202ENST00000572078 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.46■■□□□ 1.83
SPNS3-202ENST00000572078 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.37■■□□□ 1.81
SPNS3-202ENST00000572078 WDR62O43379 1518 aa26.35■■□□□ 1.81
SPNS3-202ENST00000572078 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.21■■□□□ 1.79
SPNS3-202ENST00000572078 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
SPNS3-202ENST00000572078 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.19■■□□□ 1.78
SPNS3-202ENST00000572078 CFTRP13569 1480 aa26.17■■□□□ 1.78
SPNS3-202ENST00000572078 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
SPNS3-202ENST00000572078 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
SPNS3-202ENST00000572078 TRIM41Q8WV44 630 aa26.04■■□□□ 1.76
SPNS3-202ENST00000572078 PRDM2Q13029 1718 aa25.91■■□□□ 1.74
SPNS3-202ENST00000572078 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.84■■□□□ 1.73
SPNS3-202ENST00000572078 OSCARQ8IYS5 282 aa25.81■■□□□ 1.72
SPNS3-202ENST00000572078 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
SPNS3-202ENST00000572078 TOPBP1Q92547 1522 aa25.7■■□□□ 1.7
SPNS3-202ENST00000572078 IFT140Q96RY7 1462 aa25.69■■□□□ 1.7
SPNS3-202ENST00000572078 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.63■■□□□ 1.69
SPNS3-202ENST00000572078 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.63■■□□□ 1.69
SPNS3-202ENST00000572078 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.63■■□□□ 1.69
SPNS3-202ENST00000572078 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
SPNS3-202ENST00000572078 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.58■■□□□ 1.69
SPNS3-202ENST00000572078 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
SPNS3-202ENST00000572078 ABCC8Q09428 1581 aa25.52■■□□□ 1.68
SPNS3-202ENST00000572078 ARHGEF11O15085 1522 aa25.51■■□□□ 1.67
SPNS3-202ENST00000572078 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.47■■□□□ 1.67
SPNS3-202ENST00000572078 CHD1O14646 1710 aa25.45■■□□□ 1.66
SPNS3-202ENST00000572078 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
SPNS3-202ENST00000572078 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.37■■□□□ 1.65
SPNS3-202ENST00000572078 ARAP1Q96P48 1450 aa25.28■■□□□ 1.64
SPNS3-202ENST00000572078 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
SPNS3-202ENST00000572078 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.26■■□□□ 1.63
SPNS3-202ENST00000572078 SOGA1O94964 1423 aa25.25■■□□□ 1.63
SPNS3-202ENST00000572078 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.25■■□□□ 1.63
SPNS3-202ENST00000572078 CUX1P39880 1505 aa25.23■■□□□ 1.63
SPNS3-202ENST00000572078 FBLN2P98095 1184 aa25.23■■□□□ 1.63
SPNS3-202ENST00000572078 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.2■■□□□ 1.62
SPNS3-202ENST00000572078 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.15■■□□□ 1.62
SPNS3-202ENST00000572078 WDR97A6NE52 1622 aa25.15■■□□□ 1.62
SPNS3-202ENST00000572078 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.6
SPNS3-202ENST00000572078 GRIN2BQ13224 1484 aa25.06■■□□□ 1.6
SPNS3-202ENST00000572078 SYNJ1O43426 1573 aa25.03■■□□□ 1.6
SPNS3-202ENST00000572078 PBRM1Q86U86 1689 aa25.02■■□□□ 1.6
SPNS3-202ENST00000572078 SYNJ2O15056 1496 aa25.01■■□□□ 1.59
SPNS3-202ENST00000572078 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
SPNS3-202ENST00000572078 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
SPNS3-202ENST00000572078 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.96■■□□□ 1.59
SPNS3-202ENST00000572078 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.96■■□□□ 1.59
SPNS3-202ENST00000572078 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.93■■□□□ 1.58
SPNS3-202ENST00000572078 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
SPNS3-202ENST00000572078 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.8■■□□□ 1.56
SPNS3-202ENST00000572078 ADAMTS12P58397 1594 aa24.78■■□□□ 1.56
SPNS3-202ENST00000572078 GRIN2AQ12879 1464 aa24.77■■□□□ 1.56
SPNS3-202ENST00000572078 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.76■■□□□ 1.55
SPNS3-202ENST00000572078 CEP170Q5SW79 1584 aa24.75■■□□□ 1.55
SPNS3-202ENST00000572078 TOP2BQ02880 1626 aa24.74■■□□□ 1.55
SPNS3-202ENST00000572078 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.73■■□□□ 1.55
SPNS3-202ENST00000572078 NUP160Q12769 1436 aa24.7■■□□□ 1.55
SPNS3-202ENST00000572078 SHROOM2Q13796 1616 aa24.65■■□□□ 1.54
SPNS3-202ENST00000572078 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.61■■□□□ 1.53
SPNS3-202ENST00000572078 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.59■■□□□ 1.53
SPNS3-202ENST00000572078 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.51
SPNS3-202ENST00000572078 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.44■■□□□ 1.5
SPNS3-202ENST00000572078 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.42■■□□□ 1.5
SPNS3-202ENST00000572078 JPH4Q96JJ6 628 aa24.37■■□□□ 1.49
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