RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570360.1

ITGAE-202, Transcript of integrin subunit alpha E, humanhuman

TSL 2

Gene ITGAE, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAE-202ENST00000570360 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.6■■■■■ 4.09
ITGAE-202ENST00000570360 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.92■■■■□ 3.34
ITGAE-202ENST00000570360 ABCC9O60706 1549 aa34.4■■■■□ 3.1
ITGAE-202ENST00000570360 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.99■■■■□ 3.03
ITGAE-202ENST00000570360 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.63■■■□□ 2.97
ITGAE-202ENST00000570360 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.53■■■□□ 2.96
ITGAE-202ENST00000570360 NACADO15069 1562 aa33.51■■■□□ 2.96
ITGAE-202ENST00000570360 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.44■■■□□ 2.94
ITGAE-202ENST00000570360 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.4■■■□□ 2.94
ITGAE-202ENST00000570360 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.85■■■□□ 2.85
ITGAE-202ENST00000570360 SCRIBQ14160 1630 aa32.78■■■□□ 2.84
ITGAE-202ENST00000570360 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.45■■■□□ 2.79
ITGAE-202ENST00000570360 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.38■■■□□ 2.77
ITGAE-202ENST00000570360 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.17■■■□□ 2.74
ITGAE-202ENST00000570360 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.55■■■□□ 2.64
ITGAE-202ENST00000570360 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
ITGAE-202ENST00000570360 SMARCA4P51532 1647 aa31.42■■■□□ 2.62
ITGAE-202ENST00000570360 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.42■■■□□ 2.62
ITGAE-202ENST00000570360 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.32■■■□□ 2.6
ITGAE-202ENST00000570360 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.21■■■□□ 2.59
ITGAE-202ENST00000570360 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.14■■■□□ 2.58
ITGAE-202ENST00000570360 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.09■■■□□ 2.57
ITGAE-202ENST00000570360 WIZO95785 1651 aa31.06■■■□□ 2.56
ITGAE-202ENST00000570360 SMARCA2P51531 1590 aa31.02■■■□□ 2.56
ITGAE-202ENST00000570360 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.01■■■□□ 2.55
ITGAE-202ENST00000570360 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.95■■■□□ 2.55
ITGAE-202ENST00000570360 NCAPD3P42695 1498 aa30.88■■■□□ 2.53
ITGAE-202ENST00000570360 HMGXB3Q12766 1538 aa30.86■■■□□ 2.53
ITGAE-202ENST00000570360 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.79■■■□□ 2.52
ITGAE-202ENST00000570360 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.73■■■□□ 2.51
ITGAE-202ENST00000570360 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.71■■■□□ 2.51
ITGAE-202ENST00000570360 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.31■■■□□ 2.44
ITGAE-202ENST00000570360 PRDM2Q13029 1718 aa30.02■■■□□ 2.4
ITGAE-202ENST00000570360 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.02■■■□□ 2.4
ITGAE-202ENST00000570360 NESP48681 1621 aa30■■■□□ 2.39
ITGAE-202ENST00000570360 CFTRP13569 1480 aa29.99■■■□□ 2.39
ITGAE-202ENST00000570360 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.97■■■□□ 2.39
ITGAE-202ENST00000570360 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.77■■■□□ 2.36
ITGAE-202ENST00000570360 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.69■■■□□ 2.34
ITGAE-202ENST00000570360 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.68■■■□□ 2.34
ITGAE-202ENST00000570360 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.59■■■□□ 2.33
ITGAE-202ENST00000570360 ERCC6Q03468 1493 aa29.55■■■□□ 2.32
ITGAE-202ENST00000570360 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
ITGAE-202ENST00000570360 ABCC8Q09428 1581 aa29.47■■■□□ 2.31
ITGAE-202ENST00000570360 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.42■■■□□ 2.3
ITGAE-202ENST00000570360 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
ITGAE-202ENST00000570360 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.36■■■□□ 2.29
ITGAE-202ENST00000570360 WDR62O43379 1518 aa29.35■■■□□ 2.29
ITGAE-202ENST00000570360 CUX1P39880 1505 aa29.35■■■□□ 2.29
ITGAE-202ENST00000570360 SYNJ1O43426 1573 aa29.33■■■□□ 2.29
ITGAE-202ENST00000570360 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.32■■■□□ 2.28
ITGAE-202ENST00000570360 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.32■■■□□ 2.28
ITGAE-202ENST00000570360 TOPBP1Q92547 1522 aa29.3■■■□□ 2.28
ITGAE-202ENST00000570360 TOP2BQ02880 1626 aa29.28■■■□□ 2.28
ITGAE-202ENST00000570360 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.12■■■□□ 2.25
ITGAE-202ENST00000570360 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
ITGAE-202ENST00000570360 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.07■■■□□ 2.24
ITGAE-202ENST00000570360 CUX2O14529 1486 aa29.05■■■□□ 2.24
ITGAE-202ENST00000570360 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
ITGAE-202ENST00000570360 WDR97A6NE52 1622 aa29■■■□□ 2.23
ITGAE-202ENST00000570360 TRIM41Q8WV44 630 aa28.95■■■□□ 2.22
ITGAE-202ENST00000570360 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.94■■■□□ 2.22
ITGAE-202ENST00000570360 IFT140Q96RY7 1462 aa28.92■■■□□ 2.22
ITGAE-202ENST00000570360 SOGA1O94964 1423 aa28.91■■■□□ 2.22
ITGAE-202ENST00000570360 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.87■■■□□ 2.21
ITGAE-202ENST00000570360 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.79■■■□□ 2.2
ITGAE-202ENST00000570360 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
ITGAE-202ENST00000570360 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
ITGAE-202ENST00000570360 PBRM1Q86U86 1689 aa28.69■■■□□ 2.18
ITGAE-202ENST00000570360 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
ITGAE-202ENST00000570360 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.65■■■□□ 2.18
ITGAE-202ENST00000570360 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.64■■■□□ 2.18
ITGAE-202ENST00000570360 KIF27Q86VH2 1401 aa28.63■■■□□ 2.17
ITGAE-202ENST00000570360 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.63■■■□□ 2.17
ITGAE-202ENST00000570360 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.53■■■□□ 2.16
ITGAE-202ENST00000570360 GRIN2BQ13224 1484 aa28.53■■■□□ 2.16
ITGAE-202ENST00000570360 EEA1Q15075 1411 aa28.52■■■□□ 2.16
ITGAE-202ENST00000570360 CUL7Q14999 1698 aa28.46■■■□□ 2.15
ITGAE-202ENST00000570360 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.45■■■□□ 2.14
ITGAE-202ENST00000570360 ADAMTS12P58397 1594 aa28.45■■■□□ 2.14
ITGAE-202ENST00000570360 IGF1RP08069 1367 aa28.43■■■□□ 2.14
ITGAE-202ENST00000570360 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
ITGAE-202ENST00000570360 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
ITGAE-202ENST00000570360 CHD1O14646 1710 aa28.34■■■□□ 2.13
ITGAE-202ENST00000570360 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.31■■■□□ 2.12
ITGAE-202ENST00000570360 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.31■■■□□ 2.12
ITGAE-202ENST00000570360 PRXQ9BXM0 1461 aa28.3■■■□□ 2.12
ITGAE-202ENST00000570360 KIF21BO75037 1637 aa28.29■■■□□ 2.12
ITGAE-202ENST00000570360 SYNJ2O15056 1496 aa28.28■■■□□ 2.12
ITGAE-202ENST00000570360 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.26■■■□□ 2.12
ITGAE-202ENST00000570360 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.21■■■□□ 2.11
ITGAE-202ENST00000570360 GRIN2AQ12879 1464 aa28.2■■■□□ 2.1
ITGAE-202ENST00000570360 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
ITGAE-202ENST00000570360 CEP170Q5SW79 1584 aa28.1■■■□□ 2.09
ITGAE-202ENST00000570360 GOLGA3Q08378 1498 aa28.09■■■□□ 2.09
ITGAE-202ENST00000570360 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.09■■■□□ 2.09
ITGAE-202ENST00000570360 FBLN2P98095 1184 aa28.07■■■□□ 2.08
ITGAE-202ENST00000570360 NUP160Q12769 1436 aa28.05■■■□□ 2.08
ITGAE-202ENST00000570360 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.97■■■□□ 2.07
ITGAE-202ENST00000570360 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.94■■■□□ 2.06
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