RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568982.5

CORO1A-212, Transcript of coronin 1A, humanhuman

TSL 2

Gene CORO1A, Length 756 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CORO1A-212ENST00000568982 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.5■■■■■ 5.84
CORO1A-212ENST00000568982 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.25■■■■■ 4.99
CORO1A-212ENST00000568982 ABCC9O60706 1549 aa46.12■■■■■ 4.97
CORO1A-212ENST00000568982 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.97■■■■■ 4.63
CORO1A-212ENST00000568982 NACADO15069 1562 aa43.67■■■■■ 4.58
CORO1A-212ENST00000568982 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.38■■■■■ 4.53
CORO1A-212ENST00000568982 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.12■■■■■ 4.49
CORO1A-212ENST00000568982 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.06■■■■■ 4.48
CORO1A-212ENST00000568982 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.89■■■■■ 4.46
CORO1A-212ENST00000568982 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.88■■■■■ 4.46
CORO1A-212ENST00000568982 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.74■■■■■ 4.43
CORO1A-212ENST00000568982 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.62■■■■■ 4.41
CORO1A-212ENST00000568982 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.58■■■■■ 4.41
CORO1A-212ENST00000568982 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.19■■■■■ 4.34
CORO1A-212ENST00000568982 SCRIBQ14160 1630 aa42.13■■■■■ 4.33
CORO1A-212ENST00000568982 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.66■■■■■ 4.26
CORO1A-212ENST00000568982 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.62■■■■■ 4.25
CORO1A-212ENST00000568982 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.55■■■■■ 4.24
CORO1A-212ENST00000568982 NCAPD3P42695 1498 aa40.29■■■■■ 4.04
CORO1A-212ENST00000568982 SMARCA4P51532 1647 aa40.19■■■■■ 4.02
CORO1A-212ENST00000568982 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.19■■■■■ 4.02
CORO1A-212ENST00000568982 SMARCA2P51531 1590 aa40.13■■■■■ 4.01
CORO1A-212ENST00000568982 HMGXB3Q12766 1538 aa40.06■■■■■ 4
CORO1A-212ENST00000568982 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.02■■■■■ 4
CORO1A-212ENST00000568982 ERCC6Q03468 1493 aa39.88■■■■□ 3.97
CORO1A-212ENST00000568982 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.85■■■■□ 3.97
CORO1A-212ENST00000568982 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.8■■■■□ 3.96
CORO1A-212ENST00000568982 CUX2O14529 1486 aa39.76■■■■□ 3.96
CORO1A-212ENST00000568982 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.67■■■■□ 3.94
CORO1A-212ENST00000568982 NESP48681 1621 aa39.61■■■■□ 3.93
CORO1A-212ENST00000568982 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.54■■■■□ 3.92
CORO1A-212ENST00000568982 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.42■■■■□ 3.9
CORO1A-212ENST00000568982 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.25■■■■□ 3.87
CORO1A-212ENST00000568982 WIZO95785 1651 aa39.19■■■■□ 3.86
CORO1A-212ENST00000568982 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.18■■■■□ 3.86
CORO1A-212ENST00000568982 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.13■■■■□ 3.85
CORO1A-212ENST00000568982 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.08■■■■□ 3.85
CORO1A-212ENST00000568982 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.88■■■■□ 3.81
CORO1A-212ENST00000568982 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.85■■■■□ 3.81
CORO1A-212ENST00000568982 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.77■■■■□ 3.8
CORO1A-212ENST00000568982 WDR62O43379 1518 aa38.75■■■■□ 3.79
CORO1A-212ENST00000568982 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.72■■■■□ 3.79
CORO1A-212ENST00000568982 CFTRP13569 1480 aa38.66■■■■□ 3.78
CORO1A-212ENST00000568982 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.66■■■■□ 3.78
CORO1A-212ENST00000568982 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.31■■■■□ 3.72
CORO1A-212ENST00000568982 PRDM2Q13029 1718 aa38.29■■■■□ 3.72
CORO1A-212ENST00000568982 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.26■■■■□ 3.72
CORO1A-212ENST00000568982 IFT140Q96RY7 1462 aa37.93■■■■□ 3.66
CORO1A-212ENST00000568982 TOPBP1Q92547 1522 aa37.92■■■■□ 3.66
CORO1A-212ENST00000568982 OSCARQ8IYS5 282 aa37.88■■■■□ 3.65
CORO1A-212ENST00000568982 TRIM41Q8WV44 630 aa37.88■■■■□ 3.65
CORO1A-212ENST00000568982 ABCC8Q09428 1581 aa37.87■■■■□ 3.65
CORO1A-212ENST00000568982 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.82■■■■□ 3.65
CORO1A-212ENST00000568982 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.82■■■■□ 3.64
CORO1A-212ENST00000568982 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.68■■■■□ 3.62
CORO1A-212ENST00000568982 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.57■■■■□ 3.6
CORO1A-212ENST00000568982 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.54■■■■□ 3.6
CORO1A-212ENST00000568982 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.47■■■■□ 3.59
CORO1A-212ENST00000568982 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.42■■■■□ 3.58
CORO1A-212ENST00000568982 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.42■■■■□ 3.58
CORO1A-212ENST00000568982 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.42■■■■□ 3.58
CORO1A-212ENST00000568982 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.37■■■■□ 3.57
CORO1A-212ENST00000568982 SOGA1O94964 1423 aa37.35■■■■□ 3.57
CORO1A-212ENST00000568982 ARHGEF11O15085 1522 aa37.34■■■■□ 3.57
CORO1A-212ENST00000568982 CHD1O14646 1710 aa37.33■■■■□ 3.57
CORO1A-212ENST00000568982 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.33■■■■□ 3.57
CORO1A-212ENST00000568982 CUX1P39880 1505 aa37.29■■■■□ 3.56
CORO1A-212ENST00000568982 WDR97A6NE52 1622 aa37.26■■■■□ 3.56
CORO1A-212ENST00000568982 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.25■■■■□ 3.55
CORO1A-212ENST00000568982 FBLN2P98095 1184 aa37.22■■■■□ 3.55
CORO1A-212ENST00000568982 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.18■■■■□ 3.54
CORO1A-212ENST00000568982 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.15■■■■□ 3.54
CORO1A-212ENST00000568982 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.07■■■■□ 3.53
CORO1A-212ENST00000568982 GRIN2BQ13224 1484 aa37.06■■■■□ 3.52
CORO1A-212ENST00000568982 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.98■■■■□ 3.51
CORO1A-212ENST00000568982 ARAP1Q96P48 1450 aa36.96■■■■□ 3.51
CORO1A-212ENST00000568982 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.96■■■■□ 3.51
CORO1A-212ENST00000568982 SYNJ1O43426 1573 aa36.95■■■■□ 3.51
CORO1A-212ENST00000568982 SYNJ2O15056 1496 aa36.94■■■■□ 3.5
CORO1A-212ENST00000568982 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.93■■■■□ 3.5
CORO1A-212ENST00000568982 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.93■■■■□ 3.5
CORO1A-212ENST00000568982 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.91■■■■□ 3.5
CORO1A-212ENST00000568982 PBRM1Q86U86 1689 aa36.9■■■■□ 3.5
CORO1A-212ENST00000568982 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.85■■■■□ 3.49
CORO1A-212ENST00000568982 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.78■■■■□ 3.48
CORO1A-212ENST00000568982 TOP2BQ02880 1626 aa36.73■■■■□ 3.47
CORO1A-212ENST00000568982 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.73■■■■□ 3.47
CORO1A-212ENST00000568982 ADAMTS12P58397 1594 aa36.6■■■■□ 3.45
CORO1A-212ENST00000568982 GRIN2AQ12879 1464 aa36.58■■■■□ 3.45
CORO1A-212ENST00000568982 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.58■■■■□ 3.45
CORO1A-212ENST00000568982 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.47■■■■□ 3.43
CORO1A-212ENST00000568982 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.46■■■■□ 3.43
CORO1A-212ENST00000568982 NUP160Q12769 1436 aa36.44■■■■□ 3.42
CORO1A-212ENST00000568982 CEP170Q5SW79 1584 aa36.43■■■■□ 3.42
CORO1A-212ENST00000568982 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.32■■■■□ 3.4
CORO1A-212ENST00000568982 SHROOM2Q13796 1616 aa36.27■■■■□ 3.4
CORO1A-212ENST00000568982 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.08■■■■□ 3.37
CORO1A-212ENST00000568982 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.08■■■■□ 3.37
CORO1A-212ENST00000568982 KIF27Q86VH2 1401 aa36.03■■■■□ 3.36
CORO1A-212ENST00000568982 JPH4Q96JJ6 628 aa36■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms