RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568790.5

COQ9-215, Transcript of coenzyme Q9, humanhuman

TSL 2

Gene COQ9, Length 1,027 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ9-215ENST00000568790 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.78■■■■■ 6.68
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COQ9-215ENST00000568790 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.3■■■■■ 5.32
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COQ9-215ENST00000568790 SMARCA4P51532 1647 aa44.19■■■■■ 4.66
COQ9-215ENST00000568790 SMARCA2P51531 1590 aa44.16■■■■■ 4.66
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COQ9-215ENST00000568790 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.79■■■■■ 4.6
COQ9-215ENST00000568790 ERCC6Q03468 1493 aa43.72■■■■■ 4.59
COQ9-215ENST00000568790 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.69■■■■■ 4.58
COQ9-215ENST00000568790 CUX2O14529 1486 aa43.54■■■■■ 4.56
COQ9-215ENST00000568790 NESP48681 1621 aa43.44■■■■■ 4.55
COQ9-215ENST00000568790 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.29■■■■■ 4.52
COQ9-215ENST00000568790 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.27■■■■■ 4.52
COQ9-215ENST00000568790 WIZO95785 1651 aa43.16■■■■■ 4.5
COQ9-215ENST00000568790 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.13■■■■■ 4.49
COQ9-215ENST00000568790 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.05■■■■■ 4.48
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COQ9-215ENST00000568790 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.93■■■■■ 4.46
COQ9-215ENST00000568790 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.88■■■■■ 4.45
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COQ9-215ENST00000568790 CFTRP13569 1480 aa42.56■■■■■ 4.4
COQ9-215ENST00000568790 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.54■■■■■ 4.4
COQ9-215ENST00000568790 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.5■■■■■ 4.39
COQ9-215ENST00000568790 WDR62O43379 1518 aa42.48■■■■■ 4.39
COQ9-215ENST00000568790 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.23■■■■■ 4.35
COQ9-215ENST00000568790 PRDM2Q13029 1718 aa42.09■■■■■ 4.33
COQ9-215ENST00000568790 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.06■■■■■ 4.32
COQ9-215ENST00000568790 ABCC8Q09428 1581 aa41.78■■■■■ 4.28
COQ9-215ENST00000568790 OSCARQ8IYS5 282 aa41.72■■■■■ 4.27
COQ9-215ENST00000568790 TOPBP1Q92547 1522 aa41.7■■■■■ 4.27
COQ9-215ENST00000568790 IFT140Q96RY7 1462 aa41.7■■■■■ 4.27
COQ9-215ENST00000568790 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.58■■■■■ 4.25
COQ9-215ENST00000568790 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.5■■■■■ 4.23
COQ9-215ENST00000568790 TRIM41Q8WV44 630 aa41.46■■■■■ 4.23
COQ9-215ENST00000568790 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.32■■■■■ 4.21
COQ9-215ENST00000568790 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.28■■■■■ 4.2
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COQ9-215ENST00000568790 CUX1P39880 1505 aa41.03■■■■■ 4.16
COQ9-215ENST00000568790 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.03■■■■■ 4.16
COQ9-215ENST00000568790 FBLN2P98095 1184 aa41.02■■■■■ 4.16
COQ9-215ENST00000568790 WDR97A6NE52 1622 aa40.97■■■■■ 4.15
COQ9-215ENST00000568790 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.93■■■■■ 4.14
COQ9-215ENST00000568790 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.93■■■■■ 4.14
COQ9-215ENST00000568790 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.93■■■■■ 4.14
COQ9-215ENST00000568790 CHD1O14646 1710 aa40.9■■■■■ 4.14
COQ9-215ENST00000568790 ARHGEF11O15085 1522 aa40.86■■■■■ 4.13
COQ9-215ENST00000568790 GRIN2BQ13224 1484 aa40.79■■■■■ 4.12
COQ9-215ENST00000568790 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.79■■■■■ 4.12
COQ9-215ENST00000568790 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.77■■■■■ 4.12
COQ9-215ENST00000568790 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.76■■■■■ 4.12
COQ9-215ENST00000568790 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.68■■■■■ 4.1
COQ9-215ENST00000568790 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.67■■■■■ 4.1
COQ9-215ENST00000568790 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.65■■■■■ 4.1
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COQ9-215ENST00000568790 SYNJ1O43426 1573 aa40.56■■■■■ 4.08
COQ9-215ENST00000568790 PBRM1Q86U86 1689 aa40.53■■■■■ 4.08
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COQ9-215ENST00000568790 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.48■■■■■ 4.07
COQ9-215ENST00000568790 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.47■■■■■ 4.07
COQ9-215ENST00000568790 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.45■■■■■ 4.07
COQ9-215ENST00000568790 ARAP1Q96P48 1450 aa40.44■■■■■ 4.06
COQ9-215ENST00000568790 GRIN2AQ12879 1464 aa40.21■■■■■ 4.03
COQ9-215ENST00000568790 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.18■■■■■ 4.02
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COQ9-215ENST00000568790 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.16■■■■■ 4.02
COQ9-215ENST00000568790 ADAMTS12P58397 1594 aa40.15■■■■■ 4.02
COQ9-215ENST00000568790 NUP160Q12769 1436 aa40.07■■■■■ 4
COQ9-215ENST00000568790 CEP170Q5SW79 1584 aa39.97■■■■□ 3.99
COQ9-215ENST00000568790 KIF27Q86VH2 1401 aa39.82■■■■□ 3.96
COQ9-215ENST00000568790 SHROOM2Q13796 1616 aa39.81■■■■□ 3.96
COQ9-215ENST00000568790 JPH4Q96JJ6 628 aa39.79■■■■□ 3.96
COQ9-215ENST00000568790 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.79■■■■□ 3.96
COQ9-215ENST00000568790 IGF1RP08069 1367 aa39.74■■■■□ 3.95
COQ9-215ENST00000568790 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.71■■■■□ 3.95
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