RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568689.5

JMJD8-212, Transcript of jumonji domain containing 8, humanhuman

TSL 3

Gene JMJD8, Length 1,998 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD8-212ENST00000568689 NISCHQ9Y2I1 1504 aa67.07■■■■■ 8.33
JMJD8-212ENST00000568689 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa58.37■■■■■ 6.93
JMJD8-212ENST00000568689 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP56.34■■■■■ 6.61
JMJD8-212ENST00000568689 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.49■■■■■ 6.47
JMJD8-212ENST00000568689 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa55.4■■■■■ 6.46
JMJD8-212ENST00000568689 ABCC9O60706 1549 aa55.34■■■■■ 6.45
JMJD8-212ENST00000568689 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa54.82■■■■■ 6.37
JMJD8-212ENST00000568689 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.75■■■■■ 6.35
JMJD8-212ENST00000568689 NACADO15069 1562 aa54.42■■■■■ 6.3
JMJD8-212ENST00000568689 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.95■■■■■ 6.23
JMJD8-212ENST00000568689 SCRIBQ14160 1630 aa53.79■■■■■ 6.2
JMJD8-212ENST00000568689 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.83■■■■■ 6.05
JMJD8-212ENST00000568689 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP52.74■■■■■ 6.03
JMJD8-212ENST00000568689 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.37■■■■■ 5.97
JMJD8-212ENST00000568689 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP52.25■■■■■ 5.962e-6■■■■□ 24.9
JMJD8-212ENST00000568689 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.17■■■■■ 5.94
JMJD8-212ENST00000568689 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP52.08■■■■■ 5.93
JMJD8-212ENST00000568689 MROH2BQ7Z745 1585 aa51.85■■■■■ 5.89
JMJD8-212ENST00000568689 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP51.76■■■■■ 5.88
JMJD8-212ENST00000568689 SMARCA4P51532 1647 aa51.53■■■■■ 5.84
JMJD8-212ENST00000568689 WIZO95785 1651 aa51.39■■■■■ 5.82
JMJD8-212ENST00000568689 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.89■■■■■ 5.74
JMJD8-212ENST00000568689 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP50.84■■■■■ 5.73
JMJD8-212ENST00000568689 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.79■■■■■ 5.72
JMJD8-212ENST00000568689 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.73■■■■■ 5.71
JMJD8-212ENST00000568689 SMARCA2P51531 1590 aa50.65■■■■■ 5.7
JMJD8-212ENST00000568689 CHIC1Q5VXU3 224 aa50.48■■■■■ 5.67
JMJD8-212ENST00000568689 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.43■■■■■ 5.66
JMJD8-212ENST00000568689 CCDC88BA6NC98 1476 aa50.37■■■■■ 5.65
JMJD8-212ENST00000568689 NCAPD3P42695 1498 aa50.28■■■■■ 5.64
JMJD8-212ENST00000568689 HMGXB3Q12766 1538 aa50.17■■■■■ 5.62
JMJD8-212ENST00000568689 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.03■■■■■ 5.6
JMJD8-212ENST00000568689 TRIM41Q8WV44 630 aa49.56■■■■■ 5.52
JMJD8-212ENST00000568689 ABCC8Q09428 1581 aa49.32■■■■■ 5.49
JMJD8-212ENST00000568689 CFTRP13569 1480 aa49.17■■■■■ 5.46
JMJD8-212ENST00000568689 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.01■■■■■ 5.44
JMJD8-212ENST00000568689 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP49■■■■■ 5.44
JMJD8-212ENST00000568689 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.92■■■■■ 5.42
JMJD8-212ENST00000568689 SYNJ1O43426 1573 aa48.79■■■■■ 5.4
JMJD8-212ENST00000568689 PRDM2Q13029 1718 aa48.77■■■■■ 5.4
JMJD8-212ENST00000568689 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP48.7■■■■■ 5.39
JMJD8-212ENST00000568689 NESP48681 1621 aa48.6■■■■■ 5.37
JMJD8-212ENST00000568689 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa48.58■■■■■ 5.37
JMJD8-212ENST00000568689 TOP2BQ02880 1626 aa48.56■■■■■ 5.36
JMJD8-212ENST00000568689 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.52■■■■■ 5.36
JMJD8-212ENST00000568689 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa48.47■■■■■ 5.35
JMJD8-212ENST00000568689 CUX1P39880 1505 aa48.47■■■■■ 5.35
JMJD8-212ENST00000568689 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.47■■■■■ 5.35
JMJD8-212ENST00000568689 SOGA1O94964 1423 aa48.43■■■■■ 5.34
JMJD8-212ENST00000568689 EEA1Q15075 1411 aa48.25■■■■■ 5.31
JMJD8-212ENST00000568689 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa48.25■■■■■ 5.31
JMJD8-212ENST00000568689 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.19■■■■■ 5.31
JMJD8-212ENST00000568689 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.14■■■■■ 5.3
JMJD8-212ENST00000568689 CSRNP3Q8WYN3 585 aa48.06■■■■■ 5.28
JMJD8-212ENST00000568689 EHMT2Q96KQ7 1210 aa48.04■■■■■ 5.28
JMJD8-212ENST00000568689 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.99■■■■■ 5.27
JMJD8-212ENST00000568689 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.94■■■■■ 5.27
JMJD8-212ENST00000568689 TOPBP1Q92547 1522 aa47.93■■■■■ 5.26
JMJD8-212ENST00000568689 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.92■■■■■ 5.26
JMJD8-212ENST00000568689 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.86■■■■■ 5.25
JMJD8-212ENST00000568689 KIF27Q86VH2 1401 aa47.75■■■■■ 5.23
JMJD8-212ENST00000568689 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.72■■■■■ 5.23
JMJD8-212ENST00000568689 CUX2O14529 1486 aa47.65■■■■■ 5.22
JMJD8-212ENST00000568689 GOLGA3Q08378 1498 aa47.62■■■■■ 5.21
JMJD8-212ENST00000568689 KIF21BO75037 1637 aa47.61■■■■■ 5.21
JMJD8-212ENST00000568689 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.59■■■■■ 5.21
JMJD8-212ENST00000568689 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.57■■■■■ 5.21
JMJD8-212ENST00000568689 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.5■■■■■ 5.19
JMJD8-212ENST00000568689 TNIKQ9UKE5 1360 aa47.48■■■■■ 5.19
JMJD8-212ENST00000568689 UBTFP17480 764 aaKnown RBP47.46■■■■■ 5.19
JMJD8-212ENST00000568689 PRXQ9BXM0 1461 aa47.44■■■■■ 5.19
JMJD8-212ENST00000568689 ERCC6Q03468 1493 aa47.43■■■■■ 5.18
JMJD8-212ENST00000568689 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa47.43■■■■■ 5.18
JMJD8-212ENST00000568689 IGF1RP08069 1367 aa47.36■■■■■ 5.17
JMJD8-212ENST00000568689 WDR62O43379 1518 aa47.3■■■■■ 5.16
JMJD8-212ENST00000568689 ERICH3Q5RHP9 1530 aa47.3■■■■■ 5.16
JMJD8-212ENST00000568689 WDR97A6NE52 1622 aa47.28■■■■■ 5.16
JMJD8-212ENST00000568689 CEP162Q5TB80 1403 aa47.25■■■■■ 5.15
JMJD8-212ENST00000568689 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.19■■■■■ 5.14
JMJD8-212ENST00000568689 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.15■■■■■ 5.14
JMJD8-212ENST00000568689 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.14■■■■■ 5.14
JMJD8-212ENST00000568689 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa47.11■■■■■ 5.13
JMJD8-212ENST00000568689 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.09■■■■■ 5.13
JMJD8-212ENST00000568689 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.03■■■■■ 5.12
JMJD8-212ENST00000568689 IFT140Q96RY7 1462 aa46.99■■■■■ 5.11
JMJD8-212ENST00000568689 CUL7Q14999 1698 aa46.89■■■■■ 5.1
JMJD8-212ENST00000568689 CLIP1P30622 1438 aa46.88■■■■■ 5.1
JMJD8-212ENST00000568689 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.83■■■■■ 5.093e-9■■■■■ 43.8
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JMJD8-212ENST00000568689 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP46.74■■■■■ 5.07
JMJD8-212ENST00000568689 PBRM1Q86U86 1689 aa46.68■■■■■ 5.06
JMJD8-212ENST00000568689 GRIN2BQ13224 1484 aa46.65■■■■■ 5.06
JMJD8-212ENST00000568689 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.56■■■■■ 5.04
JMJD8-212ENST00000568689 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.52■■■■■ 5.04
JMJD8-212ENST00000568689 ADAMTS12P58397 1594 aa46.48■■■■■ 5.03
JMJD8-212ENST00000568689 VPS8Q8N3P4 1428 aa46.45■■■■■ 5.03
JMJD8-212ENST00000568689 ARAP1Q96P48 1450 aa46.42■■■■■ 5.02
JMJD8-212ENST00000568689 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa46.42■■■■■ 5.02
JMJD8-212ENST00000568689 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.36■■■■■ 5.01
JMJD8-212ENST00000568689 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa46.34■■■■■ 5.01
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