RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568622.1

KIAA0556-208, Transcript of KIAA0556, humanhuman

TSL 2

Gene KIAA0556, Length 570 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556-208ENST00000568622 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.39■■■□□ 2.14
KIAA0556-208ENST00000568622 ABCC9O60706 1549 aa25.55■■□□□ 1.68
KIAA0556-208ENST00000568622 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.52■■□□□ 1.68
KIAA0556-208ENST00000568622 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.31■■□□□ 1.48
KIAA0556-208ENST00000568622 NACADO15069 1562 aa24.16■■□□□ 1.46
KIAA0556-208ENST00000568622 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.13■■□□□ 1.45
KIAA0556-208ENST00000568622 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.89■■□□□ 1.41
KIAA0556-208ENST00000568622 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.78■■□□□ 1.4
KIAA0556-208ENST00000568622 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.76■■□□□ 1.39
KIAA0556-208ENST00000568622 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.74■■□□□ 1.39
KIAA0556-208ENST00000568622 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.69■■□□□ 1.38
KIAA0556-208ENST00000568622 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
KIAA0556-208ENST00000568622 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.52■■□□□ 1.36
KIAA0556-208ENST00000568622 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.39■■□□□ 1.34
KIAA0556-208ENST00000568622 SCRIBQ14160 1630 aa23.16■■□□□ 1.3
KIAA0556-208ENST00000568622 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.11■■□□□ 1.29
KIAA0556-208ENST00000568622 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
KIAA0556-208ENST00000568622 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.05■■□□□ 1.28
KIAA0556-208ENST00000568622 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.44■■□□□ 1.18
KIAA0556-208ENST00000568622 NCAPD3P42695 1498 aa22.34■■□□□ 1.17
KIAA0556-208ENST00000568622 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.22■■□□□ 1.15
KIAA0556-208ENST00000568622 SMARCA4P51532 1647 aa22.15■■□□□ 1.14
KIAA0556-208ENST00000568622 HMGXB3Q12766 1538 aa22.15■■□□□ 1.14
KIAA0556-208ENST00000568622 CUX2O14529 1486 aa22.14■■□□□ 1.13
KIAA0556-208ENST00000568622 SMARCA2P51531 1590 aa22.13■■□□□ 1.13
KIAA0556-208ENST00000568622 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 ERCC6Q03468 1493 aa22.03■■□□□ 1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.02■■□□□ 1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 NESP48681 1621 aa21.95■■□□□ 1.1
KIAA0556-208ENST00000568622 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
KIAA0556-208ENST00000568622 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.87■■□□□ 1.09
KIAA0556-208ENST00000568622 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.81■■□□□ 1.08
KIAA0556-208ENST00000568622 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
KIAA0556-208ENST00000568622 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.65■■□□□ 1.06
KIAA0556-208ENST00000568622 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.63■■□□□ 1.05
KIAA0556-208ENST00000568622 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.61■■□□□ 1.05
KIAA0556-208ENST00000568622 WIZO95785 1651 aa21.55■■□□□ 1.04
KIAA0556-208ENST00000568622 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.49■■□□□ 1.03
KIAA0556-208ENST00000568622 WDR62O43379 1518 aa21.48■■□□□ 1.03
KIAA0556-208ENST00000568622 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
KIAA0556-208ENST00000568622 CFTRP13569 1480 aa21.38■■□□□ 1.01
KIAA0556-208ENST00000568622 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.36■■□□□ 1.01
KIAA0556-208ENST00000568622 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.34■■□□□ 1.01
KIAA0556-208ENST00000568622 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
KIAA0556-208ENST00000568622 TRIM41Q8WV44 630 aa21.24■□□□□ 0.99
KIAA0556-208ENST00000568622 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
KIAA0556-208ENST00000568622 PRDM2Q13029 1718 aa21.08■□□□□ 0.97
KIAA0556-208ENST00000568622 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.06■□□□□ 0.96
KIAA0556-208ENST00000568622 OSCARQ8IYS5 282 aa21.03■□□□□ 0.96
KIAA0556-208ENST00000568622 IFT140Q96RY7 1462 aa20.96■□□□□ 0.95
KIAA0556-208ENST00000568622 TOPBP1Q92547 1522 aa20.94■□□□□ 0.94
KIAA0556-208ENST00000568622 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
KIAA0556-208ENST00000568622 ABCC8Q09428 1581 aa20.89■□□□□ 0.93
KIAA0556-208ENST00000568622 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.85■□□□□ 0.93
KIAA0556-208ENST00000568622 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
KIAA0556-208ENST00000568622 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.8■□□□□ 0.92
KIAA0556-208ENST00000568622 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.8■□□□□ 0.92
KIAA0556-208ENST00000568622 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.8■□□□□ 0.92
KIAA0556-208ENST00000568622 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
KIAA0556-208ENST00000568622 ARHGEF11O15085 1522 aa20.75■□□□□ 0.91
KIAA0556-208ENST00000568622 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
KIAA0556-208ENST00000568622 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.7■□□□□ 0.9
KIAA0556-208ENST00000568622 CHD1O14646 1710 aa20.64■□□□□ 0.89
KIAA0556-208ENST00000568622 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.62■□□□□ 0.89
KIAA0556-208ENST00000568622 WDR97A6NE52 1622 aa20.59■□□□□ 0.89
KIAA0556-208ENST00000568622 SOGA1O94964 1423 aa20.59■□□□□ 0.89
KIAA0556-208ENST00000568622 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.56■□□□□ 0.88
KIAA0556-208ENST00000568622 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
KIAA0556-208ENST00000568622 ARAP1Q96P48 1450 aa20.55■□□□□ 0.88
KIAA0556-208ENST00000568622 CUX1P39880 1505 aa20.54■□□□□ 0.88
KIAA0556-208ENST00000568622 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.51■□□□□ 0.87
KIAA0556-208ENST00000568622 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.5■□□□□ 0.87
KIAA0556-208ENST00000568622 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.49■□□□□ 0.87
KIAA0556-208ENST00000568622 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
KIAA0556-208ENST00000568622 FBLN2P98095 1184 aa20.47■□□□□ 0.87
KIAA0556-208ENST00000568622 GRIN2BQ13224 1484 aa20.44■□□□□ 0.86
KIAA0556-208ENST00000568622 SYNJ2O15056 1496 aa20.4■□□□□ 0.86
KIAA0556-208ENST00000568622 SYNJ1O43426 1573 aa20.39■□□□□ 0.85
KIAA0556-208ENST00000568622 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
KIAA0556-208ENST00000568622 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.36■□□□□ 0.85
KIAA0556-208ENST00000568622 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.35■□□□□ 0.85
KIAA0556-208ENST00000568622 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.33■□□□□ 0.84
KIAA0556-208ENST00000568622 PBRM1Q86U86 1689 aa20.32■□□□□ 0.84
KIAA0556-208ENST00000568622 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
KIAA0556-208ENST00000568622 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.2■□□□□ 0.82
KIAA0556-208ENST00000568622 GRIN2AQ12879 1464 aa20.19■□□□□ 0.82
KIAA0556-208ENST00000568622 TOP2BQ02880 1626 aa20.19■□□□□ 0.82
KIAA0556-208ENST00000568622 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.19■□□□□ 0.82
KIAA0556-208ENST00000568622 NUP160Q12769 1436 aa20.18■□□□□ 0.82
KIAA0556-208ENST00000568622 ADAMTS12P58397 1594 aa20.17■□□□□ 0.82
KIAA0556-208ENST00000568622 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
KIAA0556-208ENST00000568622 CEP170Q5SW79 1584 aa20.13■□□□□ 0.81
KIAA0556-208ENST00000568622 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.12■□□□□ 0.81
KIAA0556-208ENST00000568622 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.1■□□□□ 0.81
KIAA0556-208ENST00000568622 SHROOM2Q13796 1616 aa20.09■□□□□ 0.81
KIAA0556-208ENST00000568622 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.09■□□□□ 0.81
KIAA0556-208ENST00000568622 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
KIAA0556-208ENST00000568622 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
KIAA0556-208ENST00000568622 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa19.9■□□□□ 0.78
KIAA0556-208ENST00000568622 JPH4Q96JJ6 628 aa19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.4 ms