RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567843.1

GTF3C1-208, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTF3C1, Length 474 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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GTF3C1-208ENST00000567843 SMARCA2P51531 1590 aa23.39■■□□□ 1.33
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GTF3C1-208ENST00000567843 WIZO95785 1651 aa23.03■■□□□ 1.28
GTF3C1-208ENST00000567843 CUX2O14529 1486 aa23■■□□□ 1.27
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GTF3C1-208ENST00000567843 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.91■■□□□ 1.26
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GTF3C1-208ENST00000567843 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.8■■□□□ 1.24
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GTF3C1-208ENST00000567843 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.64■■□□□ 1.21
GTF3C1-208ENST00000567843 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.6■■□□□ 1.21
GTF3C1-208ENST00000567843 CFTRP13569 1480 aa22.6■■□□□ 1.21
GTF3C1-208ENST00000567843 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.59■■□□□ 1.21
GTF3C1-208ENST00000567843 WDR62O43379 1518 aa22.53■■□□□ 1.2
GTF3C1-208ENST00000567843 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.52■■□□□ 1.2
GTF3C1-208ENST00000567843 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
GTF3C1-208ENST00000567843 PRDM2Q13029 1718 aa22.25■■□□□ 1.15
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GTF3C1-208ENST00000567843 IFT140Q96RY7 1462 aa22.12■■□□□ 1.13
GTF3C1-208ENST00000567843 OSCARQ8IYS5 282 aa22.1■■□□□ 1.13
GTF3C1-208ENST00000567843 TRIM41Q8WV44 630 aa22.1■■□□□ 1.13
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GTF3C1-208ENST00000567843 SOGA1O94964 1423 aa21.91■■□□□ 1.1
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GTF3C1-208ENST00000567843 FBLN2P98095 1184 aa21.89■■□□□ 1.09
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GTF3C1-208ENST00000567843 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.88■■□□□ 1.09
GTF3C1-208ENST00000567843 CHD1O14646 1710 aa21.73■■□□□ 1.07
GTF3C1-208ENST00000567843 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.72■■□□□ 1.07
GTF3C1-208ENST00000567843 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.72■■□□□ 1.07
GTF3C1-208ENST00000567843 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.72■■□□□ 1.07
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GTF3C1-208ENST00000567843 ARHGEF11O15085 1522 aa21.7■■□□□ 1.06
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GTF3C1-208ENST00000567843 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.26■□□□□ 0.99
GTF3C1-208ENST00000567843 IGF1RP08069 1367 aa21.18■□□□□ 0.98
GTF3C1-208ENST00000567843 KIF27Q86VH2 1401 aa21.17■□□□□ 0.98
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