RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567605.5

LINGO1-211, Transcript of leucine rich repeat and Ig domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene LINGO1, Length 685 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO1-211ENST00000567605 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.61■■■■■ 6.33
LINGO1-211ENST00000567605 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.76■■■■■ 5.4
LINGO1-211ENST00000567605 ABCC9O60706 1549 aa48.1■■■■■ 5.29
LINGO1-211ENST00000567605 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.09■■■■■ 4.97
LINGO1-211ENST00000567605 NACADO15069 1562 aa45.95■■■■■ 4.95
LINGO1-211ENST00000567605 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.73■■■■■ 4.91
LINGO1-211ENST00000567605 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.56■■■■■ 4.88
LINGO1-211ENST00000567605 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.41■■■■■ 4.86
LINGO1-211ENST00000567605 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.19■■■■■ 4.82
LINGO1-211ENST00000567605 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.04■■■■■ 4.8
LINGO1-211ENST00000567605 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.85■■■■■ 4.77
LINGO1-211ENST00000567605 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.73■■■■■ 4.75
LINGO1-211ENST00000567605 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.56■■■■■ 4.72
LINGO1-211ENST00000567605 SCRIBQ14160 1630 aa44.42■■■■■ 4.7
LINGO1-211ENST00000567605 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.25■■■■■ 4.67
LINGO1-211ENST00000567605 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.58■■■■■ 4.57
LINGO1-211ENST00000567605 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.51■■■■■ 4.56
LINGO1-211ENST00000567605 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.28■■■■■ 4.52
LINGO1-211ENST00000567605 SMARCA4P51532 1647 aa42.46■■■■■ 4.39
LINGO1-211ENST00000567605 NCAPD3P42695 1498 aa42.41■■■■■ 4.38
LINGO1-211ENST00000567605 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.36■■■■■ 4.37
LINGO1-211ENST00000567605 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.35■■■■■ 4.37
LINGO1-211ENST00000567605 SMARCA2P51531 1590 aa42.28■■■■■ 4.36
LINGO1-211ENST00000567605 HMGXB3Q12766 1538 aa42.15■■■■■ 4.34
LINGO1-211ENST00000567605 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.08■■■■■ 4.33
LINGO1-211ENST00000567605 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.07■■■■■ 4.33
LINGO1-211ENST00000567605 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.97■■■■■ 4.31
LINGO1-211ENST00000567605 WIZO95785 1651 aa41.58■■■■■ 4.25
LINGO1-211ENST00000567605 NESP48681 1621 aa41.5■■■■■ 4.23
LINGO1-211ENST00000567605 ERCC6Q03468 1493 aa41.49■■■■■ 4.23
LINGO1-211ENST00000567605 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.43■■■■■ 4.22
LINGO1-211ENST00000567605 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.35■■■■■ 4.21
LINGO1-211ENST00000567605 CUX2O14529 1486 aa41.25■■■■■ 4.19
LINGO1-211ENST00000567605 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.13■■■■■ 4.18
LINGO1-211ENST00000567605 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.13■■■■■ 4.18
LINGO1-211ENST00000567605 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.08■■■■■ 4.17
LINGO1-211ENST00000567605 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.99■■■■■ 4.15
LINGO1-211ENST00000567605 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.99■■■■■ 4.15
LINGO1-211ENST00000567605 CFTRP13569 1480 aa40.8■■■■■ 4.12
LINGO1-211ENST00000567605 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.69■■■■■ 4.1
LINGO1-211ENST00000567605 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.65■■■■■ 4.1
LINGO1-211ENST00000567605 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.64■■■■■ 4.1
LINGO1-211ENST00000567605 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.64■■■■■ 4.1
LINGO1-211ENST00000567605 WDR62O43379 1518 aa40.58■■■■■ 4.09
LINGO1-211ENST00000567605 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.49■■■■■ 4.07
LINGO1-211ENST00000567605 PRDM2Q13029 1718 aa40.45■■■■■ 4.07
LINGO1-211ENST00000567605 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.28■■■■■ 4.04
LINGO1-211ENST00000567605 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.99■■■■□ 3.99
LINGO1-211ENST00000567605 TOPBP1Q92547 1522 aa39.96■■■■□ 3.99
LINGO1-211ENST00000567605 ABCC8Q09428 1581 aa39.94■■■■□ 3.98
LINGO1-211ENST00000567605 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.88■■■■□ 3.97
LINGO1-211ENST00000567605 IFT140Q96RY7 1462 aa39.82■■■■□ 3.97
LINGO1-211ENST00000567605 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.67■■■■□ 3.94
LINGO1-211ENST00000567605 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.59■■■■□ 3.93
LINGO1-211ENST00000567605 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.57■■■■□ 3.92
LINGO1-211ENST00000567605 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.5■■■■□ 3.91
LINGO1-211ENST00000567605 CUX1P39880 1505 aa39.5■■■■□ 3.91
LINGO1-211ENST00000567605 OSCARQ8IYS5 282 aa39.43■■■■□ 3.9
LINGO1-211ENST00000567605 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.43■■■■□ 3.9
LINGO1-211ENST00000567605 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.42■■■■□ 3.9
LINGO1-211ENST00000567605 SOGA1O94964 1423 aa39.41■■■■□ 3.9
LINGO1-211ENST00000567605 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.38■■■■□ 3.9
LINGO1-211ENST00000567605 WDR97A6NE52 1622 aa39.25■■■■□ 3.87
LINGO1-211ENST00000567605 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.24■■■■□ 3.87
LINGO1-211ENST00000567605 CHD1O14646 1710 aa39.08■■■■□ 3.85
LINGO1-211ENST00000567605 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.07■■■■□ 3.85
LINGO1-211ENST00000567605 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.04■■■■□ 3.84
LINGO1-211ENST00000567605 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.04■■■■□ 3.84
LINGO1-211ENST00000567605 TOP2BQ02880 1626 aa39.03■■■■□ 3.84
LINGO1-211ENST00000567605 GRIN2BQ13224 1484 aa39.02■■■■□ 3.84
LINGO1-211ENST00000567605 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.02■■■■□ 3.84
LINGO1-211ENST00000567605 SYNJ1O43426 1573 aa38.99■■■■□ 3.83
LINGO1-211ENST00000567605 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.97■■■■□ 3.83
LINGO1-211ENST00000567605 FBLN2P98095 1184 aa38.96■■■■□ 3.83
LINGO1-211ENST00000567605 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.95■■■■□ 3.83
LINGO1-211ENST00000567605 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.92■■■■□ 3.82
LINGO1-211ENST00000567605 TRIM41Q8WV44 630 aa38.92■■■■□ 3.82
LINGO1-211ENST00000567605 PBRM1Q86U86 1689 aa38.9■■■■□ 3.82
LINGO1-211ENST00000567605 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.86■■■■□ 3.81
LINGO1-211ENST00000567605 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.86■■■■□ 3.81
LINGO1-211ENST00000567605 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.86■■■■□ 3.81
LINGO1-211ENST00000567605 SYNJ2O15056 1496 aa38.82■■■■□ 3.81
LINGO1-211ENST00000567605 ARHGEF11O15085 1522 aa38.81■■■■□ 3.8
LINGO1-211ENST00000567605 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.81■■■■□ 3.8
LINGO1-211ENST00000567605 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.68■■■■□ 3.78
LINGO1-211ENST00000567605 ADAMTS12P58397 1594 aa38.58■■■■□ 3.77
LINGO1-211ENST00000567605 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.56■■■■□ 3.76
LINGO1-211ENST00000567605 GRIN2AQ12879 1464 aa38.52■■■■□ 3.76
LINGO1-211ENST00000567605 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.5■■■■□ 3.75
LINGO1-211ENST00000567605 ARAP1Q96P48 1450 aa38.47■■■■□ 3.75
LINGO1-211ENST00000567605 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.44■■■■□ 3.74
LINGO1-211ENST00000567605 NUP160Q12769 1436 aa38.38■■■■□ 3.73
LINGO1-211ENST00000567605 CEP170Q5SW79 1584 aa38.34■■■■□ 3.73
LINGO1-211ENST00000567605 KIF27Q86VH2 1401 aa38.29■■■■□ 3.72
LINGO1-211ENST00000567605 IGF1RP08069 1367 aa38.19■■■■□ 3.7
LINGO1-211ENST00000567605 SHROOM2Q13796 1616 aa38.14■■■■□ 3.7
LINGO1-211ENST00000567605 CUL7Q14999 1698 aa38.12■■■■□ 3.69
LINGO1-211ENST00000567605 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.09■■■■□ 3.69
LINGO1-211ENST00000567605 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.02■■■■□ 3.68
LINGO1-211ENST00000567605 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.95■■■■□ 3.67
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