RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42■■■■■ 4.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.52■■■■□ 3.6
CCNDBP1-211ENST00000567434 ABCC9O60706 1549 aa36.96■■■■□ 3.51
CCNDBP1-211ENST00000567434 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.42■■■■□ 3.26
CCNDBP1-211ENST00000567434 NACADO15069 1562 aa35.34■■■■□ 3.25
CCNDBP1-211ENST00000567434 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.09■■■■□ 3.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.08■■■■□ 3.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.94■■■■□ 3.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.87■■■■□ 3.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.82■■■■□ 3.16
CCNDBP1-211ENST00000567434 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.53■■■■□ 3.12
CCNDBP1-211ENST00000567434 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.36■■■■□ 3.09
CCNDBP1-211ENST00000567434 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.3■■■■□ 3.08
CCNDBP1-211ENST00000567434 SCRIBQ14160 1630 aa34.1■■■■□ 3.05
CCNDBP1-211ENST00000567434 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.07■■■■□ 3.05
CCNDBP1-211ENST00000567434 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.44■■■□□ 2.94
CCNDBP1-211ENST00000567434 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.39■■■□□ 2.94
CCNDBP1-211ENST00000567434 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.33■■■□□ 2.93
CCNDBP1-211ENST00000567434 SMARCA4P51532 1647 aa32.64■■■□□ 2.82
CCNDBP1-211ENST00000567434 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.61■■■□□ 2.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 NCAPD3P42695 1498 aa32.59■■■□□ 2.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 SMARCA2P51531 1590 aa32.53■■■□□ 2.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.53■■■□□ 2.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 HMGXB3Q12766 1538 aa32.42■■■□□ 2.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.38■■■□□ 2.77
CCNDBP1-211ENST00000567434 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.32■■■□□ 2.76
CCNDBP1-211ENST00000567434 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.26■■■□□ 2.75
CCNDBP1-211ENST00000567434 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.22■■■□□ 2.75
CCNDBP1-211ENST00000567434 CUX2O14529 1486 aa31.98■■■□□ 2.71
CCNDBP1-211ENST00000567434 ERCC6Q03468 1493 aa31.95■■■□□ 2.7
CCNDBP1-211ENST00000567434 WIZO95785 1651 aa31.94■■■□□ 2.7
CCNDBP1-211ENST00000567434 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.87■■■□□ 2.69
CCNDBP1-211ENST00000567434 NESP48681 1621 aa31.78■■■□□ 2.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.78■■■□□ 2.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.65■■■□□ 2.66
CCNDBP1-211ENST00000567434 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.6■■■□□ 2.65
CCNDBP1-211ENST00000567434 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.58■■■□□ 2.65
CCNDBP1-211ENST00000567434 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.44■■■□□ 2.62
CCNDBP1-211ENST00000567434 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.43■■■□□ 2.62
CCNDBP1-211ENST00000567434 CFTRP13569 1480 aa31.37■■■□□ 2.61
CCNDBP1-211ENST00000567434 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.25■■■□□ 2.59
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.24■■■□□ 2.59
CCNDBP1-211ENST00000567434 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.24■■■□□ 2.59
CCNDBP1-211ENST00000567434 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.23■■■□□ 2.59
CCNDBP1-211ENST00000567434 WDR62O43379 1518 aa31.15■■■□□ 2.58
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRDM2Q13029 1718 aa31.12■■■□□ 2.57
CCNDBP1-211ENST00000567434 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.91■■■□□ 2.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 ABCC8Q09428 1581 aa30.76■■■□□ 2.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 TOPBP1Q92547 1522 aa30.69■■■□□ 2.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRIM41Q8WV44 630 aa30.68■■■□□ 2.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.66■■■□□ 2.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 IFT140Q96RY7 1462 aa30.6■■■□□ 2.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 OSCARQ8IYS5 282 aa30.48■■■□□ 2.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.42■■■□□ 2.46
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.41■■■□□ 2.46
CCNDBP1-211ENST00000567434 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.39■■■□□ 2.46
CCNDBP1-211ENST00000567434 CUX1P39880 1505 aa30.35■■■□□ 2.45
CCNDBP1-211ENST00000567434 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.45
CCNDBP1-211ENST00000567434 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.3■■■□□ 2.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 SOGA1O94964 1423 aa30.28■■■□□ 2.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 WDR97A6NE52 1622 aa30.23■■■□□ 2.43
CCNDBP1-211ENST00000567434 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.23■■■□□ 2.43
CCNDBP1-211ENST00000567434 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.2■■■□□ 2.437e-9■■■□□ 16.4
CCNDBP1-211ENST00000567434 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
CCNDBP1-211ENST00000567434 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.11■■■□□ 2.41
CCNDBP1-211ENST00000567434 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.11■■■□□ 2.41
CCNDBP1-211ENST00000567434 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.11■■■□□ 2.41
CCNDBP1-211ENST00000567434 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.08■■■□□ 2.41
CCNDBP1-211ENST00000567434 TOP2BQ02880 1626 aa30.06■■■□□ 2.4
CCNDBP1-211ENST00000567434 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.06■■■□□ 2.4
CCNDBP1-211ENST00000567434 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.02■■■□□ 2.4
CCNDBP1-211ENST00000567434 GRIN2BQ13224 1484 aa29.99■■■□□ 2.39
CCNDBP1-211ENST00000567434 SYNJ1O43426 1573 aa29.98■■■□□ 2.39
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARHGEF11O15085 1522 aa29.97■■■□□ 2.39
CCNDBP1-211ENST00000567434 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
CCNDBP1-211ENST00000567434 CHD1O14646 1710 aa29.96■■■□□ 2.39
CCNDBP1-211ENST00000567434 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.94■■■□□ 2.38
CCNDBP1-211ENST00000567434 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.94■■■□□ 2.38
CCNDBP1-211ENST00000567434 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.92■■■□□ 2.38
CCNDBP1-211ENST00000567434 PBRM1Q86U86 1689 aa29.88■■■□□ 2.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 FBLN2P98095 1184 aa29.88■■■□□ 2.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 SYNJ2O15056 1496 aa29.84■■■□□ 2.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.76■■■□□ 2.35
CCNDBP1-211ENST00000567434 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.69■■■□□ 2.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.68■■■□□ 2.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARAP1Q96P48 1450 aa29.66■■■□□ 2.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 ADAMTS12P58397 1594 aa29.65■■■□□ 2.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.61■■■□□ 2.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 GRIN2AQ12879 1464 aa29.6■■■□□ 2.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 NUP160Q12769 1436 aa29.49■■■□□ 2.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 KIF27Q86VH2 1401 aa29.49■■■□□ 2.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 CEP170Q5SW79 1584 aa29.43■■■□□ 2.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 CUL7Q14999 1698 aa29.37■■■□□ 2.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 IGF1RP08069 1367 aa29.37■■■□□ 2.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 SHROOM2Q13796 1616 aa29.3■■■□□ 2.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.22■■■□□ 2.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.2■■■□□ 2.26
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