RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567312.5

TRAPPC2L-212, Transcript of trafficking protein particle complex 2 like, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC2L, Length 499 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2L-212ENST00000567312 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.1■■■□□ 2.73
TRAPPC2L-212ENST00000567312 ABCC9O60706 1549 aa29.48■■■□□ 2.31
TRAPPC2L-212ENST00000567312 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.09■■■□□ 2.25
TRAPPC2L-212ENST00000567312 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.94■■■□□ 2.06
TRAPPC2L-212ENST00000567312 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC2L-212ENST00000567312 NACADO15069 1562 aa27.53■■■□□ 2
TRAPPC2L-212ENST00000567312 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC2L-212ENST00000567312 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC2L-212ENST00000567312 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.21■■□□□ 1.95
TRAPPC2L-212ENST00000567312 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC2L-212ENST00000567312 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC2L-212ENST00000567312 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.64■■□□□ 1.86
TRAPPC2L-212ENST00000567312 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC2L-212ENST00000567312 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.58■■□□□ 1.85
TRAPPC2L-212ENST00000567312 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC2L-212ENST00000567312 SCRIBQ14160 1630 aa26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC2L-212ENST00000567312 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC2L-212ENST00000567312 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
TRAPPC2L-212ENST00000567312 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC2L-212ENST00000567312 CUX2O14529 1486 aa25.58■■□□□ 1.69
TRAPPC2L-212ENST00000567312 ERCC6Q03468 1493 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC2L-212ENST00000567312 NCAPD3P42695 1498 aa25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC2L-212ENST00000567312 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC2L-212ENST00000567312 HMGXB3Q12766 1538 aa25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC2L-212ENST00000567312 SMARCA2P51531 1590 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC2L-212ENST00000567312 NESP48681 1621 aa25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC2L-212ENST00000567312 SMARCA4P51532 1647 aa25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC2L-212ENST00000567312 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC2L-212ENST00000567312 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC2L-212ENST00000567312 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC2L-212ENST00000567312 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC2L-212ENST00000567312 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC2L-212ENST00000567312 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC2L-212ENST00000567312 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC2L-212ENST00000567312 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC2L-212ENST00000567312 TRIM41Q8WV44 630 aa24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC2L-212ENST00000567312 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC2L-212ENST00000567312 WDR62O43379 1518 aa24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC2L-212ENST00000567312 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC2L-212ENST00000567312 WIZO95785 1651 aa24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC2L-212ENST00000567312 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.45■■□□□ 1.51
TRAPPC2L-212ENST00000567312 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC2L-212ENST00000567312 CFTRP13569 1480 aa24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC2L-212ENST00000567312 OSCARQ8IYS5 282 aa24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC2L-212ENST00000567312 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC2L-212ENST00000567312 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC2L-212ENST00000567312 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC2L-212ENST00000567312 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC2L-212ENST00000567312 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC2L-212ENST00000567312 PRDM2Q13029 1718 aa24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC2L-212ENST00000567312 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC2L-212ENST00000567312 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC2L-212ENST00000567312 ARHGEF11O15085 1522 aa23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC2L-212ENST00000567312 IFT140Q96RY7 1462 aa23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC2L-212ENST00000567312 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC2L-212ENST00000567312 TOPBP1Q92547 1522 aa23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC2L-212ENST00000567312 CHD1O14646 1710 aa23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC2L-212ENST00000567312 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC2L-212ENST00000567312 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC2L-212ENST00000567312 ARAP1Q96P48 1450 aa23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC2L-212ENST00000567312 ABCC8Q09428 1581 aa23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC2L-212ENST00000567312 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC2L-212ENST00000567312 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.39
TRAPPC2L-212ENST00000567312 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.67■■□□□ 1.387e-7■■■□□ 15.5
TRAPPC2L-212ENST00000567312 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC2L-212ENST00000567312 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC2L-212ENST00000567312 FBLN2P98095 1184 aa23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC2L-212ENST00000567312 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC2L-212ENST00000567312 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC2L-212ENST00000567312 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC2L-212ENST00000567312 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC2L-212ENST00000567312 WDR97A6NE52 1622 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC2L-212ENST00000567312 SYNJ1O43426 1573 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC2L-212ENST00000567312 SOGA1O94964 1423 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC2L-212ENST00000567312 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.39■■□□□ 1.34
TRAPPC2L-212ENST00000567312 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC2L-212ENST00000567312 GRIN2BQ13224 1484 aa23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC2L-212ENST00000567312 CUX1P39880 1505 aa23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC2L-212ENST00000567312 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC2L-212ENST00000567312 SYNJ2O15056 1496 aa23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC2L-212ENST00000567312 PBRM1Q86U86 1689 aa23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC2L-212ENST00000567312 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC2L-212ENST00000567312 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC2L-212ENST00000567312 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC2L-212ENST00000567312 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC2L-212ENST00000567312 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.08■■□□□ 1.28
TRAPPC2L-212ENST00000567312 ADAMTS12P58397 1594 aa23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC2L-212ENST00000567312 GRIN2AQ12879 1464 aa23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC2L-212ENST00000567312 CEP170Q5SW79 1584 aa23■■□□□ 1.27
TRAPPC2L-212ENST00000567312 NUP160Q12769 1436 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC2L-212ENST00000567312 SHROOM2Q13796 1616 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC2L-212ENST00000567312 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC2L-212ENST00000567312 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC2L-212ENST00000567312 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC2L-212ENST00000567312 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC2L-212ENST00000567312 TOP2BQ02880 1626 aa22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC2L-212ENST00000567312 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC2L-212ENST00000567312 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC2L-212ENST00000567312 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC2L-212ENST00000567312 DIP2BQ9P265 1576 aa22.66■■□□□ 1.22
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