RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567228.1

E2F4-209, Transcript of E2F transcription factor 4, humanhuman

TSL 2

Gene E2F4, Length 757 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4-209ENST00000567228 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.22■■■■■ 5.31
E2F4-209ENST00000567228 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.01■■■■■ 4.48
E2F4-209ENST00000567228 ABCC9O60706 1549 aa42.82■■■■■ 4.45
E2F4-209ENST00000567228 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.83■■■■■ 4.13
E2F4-209ENST00000567228 NACADO15069 1562 aa40.68■■■■■ 4.1
E2F4-209ENST00000567228 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.51■■■■■ 4.08
E2F4-209ENST00000567228 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.3■■■■■ 4.04
E2F4-209ENST00000567228 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.13■■■■■ 4.01
E2F4-209ENST00000567228 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40■■■■□ 3.99
E2F4-209ENST00000567228 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.99■■■■□ 3.99
E2F4-209ENST00000567228 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.87■■■■□ 3.97
E2F4-209ENST00000567228 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.85■■■■□ 3.97
E2F4-209ENST00000567228 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.75■■■■□ 3.95
E2F4-209ENST00000567228 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.19■■■■□ 3.86
E2F4-209ENST00000567228 SCRIBQ14160 1630 aa39.19■■■■□ 3.86
E2F4-209ENST00000567228 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.69■■■■□ 3.78
E2F4-209ENST00000567228 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.67■■■■□ 3.78
E2F4-209ENST00000567228 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.56■■■■□ 3.76
E2F4-209ENST00000567228 NCAPD3P42695 1498 aa37.65■■■■□ 3.62
E2F4-209ENST00000567228 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.55■■■■□ 3.6
E2F4-209ENST00000567228 SMARCA4P51532 1647 aa37.48■■■■□ 3.59
E2F4-209ENST00000567228 SMARCA2P51531 1590 aa37.36■■■■□ 3.57
E2F4-209ENST00000567228 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.34■■■■□ 3.57
E2F4-209ENST00000567228 HMGXB3Q12766 1538 aa37.29■■■■□ 3.56
E2F4-209ENST00000567228 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.2■■■■□ 3.55
E2F4-209ENST00000567228 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.17■■■■□ 3.54
E2F4-209ENST00000567228 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.1■■■■□ 3.53
E2F4-209ENST00000567228 NESP48681 1621 aa36.91■■■■□ 3.5
E2F4-209ENST00000567228 ERCC6Q03468 1493 aa36.87■■■■□ 3.49
E2F4-209ENST00000567228 CUX2O14529 1486 aa36.79■■■■□ 3.48
E2F4-209ENST00000567228 WIZO95785 1651 aa36.65■■■■□ 3.46
E2F4-209ENST00000567228 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.63■■■■□ 3.45
E2F4-209ENST00000567228 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.59■■■■□ 3.45
E2F4-209ENST00000567228 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.55■■■■□ 3.44
E2F4-209ENST00000567228 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.51■■■■□ 3.43
E2F4-209ENST00000567228 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.45■■■■□ 3.43
E2F4-209ENST00000567228 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.4■■■■□ 3.42
E2F4-209ENST00000567228 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.29■■■■□ 3.4
E2F4-209ENST00000567228 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
E2F4-209ENST00000567228 CFTRP13569 1480 aa36.15■■■■□ 3.38
E2F4-209ENST00000567228 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.1■■■■□ 3.37
E2F4-209ENST00000567228 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.02■■■■□ 3.36
E2F4-209ENST00000567228 WDR62O43379 1518 aa36.01■■■■□ 3.36
E2F4-209ENST00000567228 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.99■■■■□ 3.35
E2F4-209ENST00000567228 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.89■■■■□ 3.34
E2F4-209ENST00000567228 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.74■■■■□ 3.31
E2F4-209ENST00000567228 PRDM2Q13029 1718 aa35.54■■■■□ 3.28
E2F4-209ENST00000567228 TOPBP1Q92547 1522 aa35.37■■■■□ 3.25
E2F4-209ENST00000567228 ABCC8Q09428 1581 aa35.3■■■■□ 3.24
E2F4-209ENST00000567228 IFT140Q96RY7 1462 aa35.29■■■■□ 3.24
E2F4-209ENST00000567228 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.26■■■■□ 3.23
E2F4-209ENST00000567228 OSCARQ8IYS5 282 aa35.23■■■■□ 3.23
E2F4-209ENST00000567228 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.22■■■■□ 3.23
E2F4-209ENST00000567228 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.05■■■■□ 3.2
E2F4-209ENST00000567228 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.04■■■■□ 3.2
E2F4-209ENST00000567228 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.04■■■■□ 3.2
E2F4-209ENST00000567228 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.97■■■■□ 3.195e-8■■■■■ 52.3
E2F4-209ENST00000567228 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.96■■■■□ 3.19
E2F4-209ENST00000567228 TRIM41Q8WV44 630 aa34.94■■■■□ 3.18
E2F4-209ENST00000567228 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.92■■■■□ 3.18
E2F4-209ENST00000567228 SOGA1O94964 1423 aa34.9■■■■□ 3.18
E2F4-209ENST00000567228 CUX1P39880 1505 aa34.89■■■■□ 3.18
E2F4-209ENST00000567228 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.84■■■■□ 3.17
E2F4-209ENST00000567228 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.82■■■■□ 3.16
E2F4-209ENST00000567228 WDR97A6NE52 1622 aa34.64■■■■□ 3.14
E2F4-209ENST00000567228 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.62■■■■□ 3.13
E2F4-209ENST00000567228 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.62■■■■□ 3.13
E2F4-209ENST00000567228 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.62■■■■□ 3.13
E2F4-209ENST00000567228 FBLN2P98095 1184 aa34.61■■■■□ 3.13
E2F4-209ENST00000567228 ARHGEF11O15085 1522 aa34.6■■■■□ 3.13
E2F4-209ENST00000567228 CHD1O14646 1710 aa34.58■■■■□ 3.13
E2F4-209ENST00000567228 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.56■■■■□ 3.12
E2F4-209ENST00000567228 GRIN2BQ13224 1484 aa34.53■■■■□ 3.12
E2F4-209ENST00000567228 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.5■■■■□ 3.11
E2F4-209ENST00000567228 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.49■■■■□ 3.11
E2F4-209ENST00000567228 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.46■■■■□ 3.11
E2F4-209ENST00000567228 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.45■■■■□ 3.11
E2F4-209ENST00000567228 SYNJ2O15056 1496 aa34.39■■■■□ 3.1
E2F4-209ENST00000567228 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.39■■■■□ 3.1
E2F4-209ENST00000567228 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.37■■■■□ 3.09
E2F4-209ENST00000567228 TOP2BQ02880 1626 aa34.35■■■■□ 3.09
E2F4-209ENST00000567228 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.35■■■■□ 3.09
E2F4-209ENST00000567228 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.34■■■■□ 3.09
E2F4-209ENST00000567228 SYNJ1O43426 1573 aa34.32■■■■□ 3.09
E2F4-209ENST00000567228 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.32■■■■□ 3.08
E2F4-209ENST00000567228 ARAP1Q96P48 1450 aa34.3■■■■□ 3.08
E2F4-209ENST00000567228 PBRM1Q86U86 1689 aa34.27■■■■□ 3.08
E2F4-209ENST00000567228 GRIN2AQ12879 1464 aa34.09■■■■□ 3.05
E2F4-209ENST00000567228 ADAMTS12P58397 1594 aa34.05■■■■□ 3.04
E2F4-209ENST00000567228 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.04■■■■□ 3.04
E2F4-209ENST00000567228 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.04■■■■□ 3.04
E2F4-209ENST00000567228 NUP160Q12769 1436 aa34.03■■■■□ 3.04
E2F4-209ENST00000567228 CEP170Q5SW79 1584 aa33.94■■■■□ 3.02
E2F4-209ENST00000567228 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.84■■■■□ 3.01
E2F4-209ENST00000567228 TRHP20396 242 aaPredicted RBP33.8■■■■□ 3
E2F4-209ENST00000567228 IGF1RP08069 1367 aa33.8■■■■□ 3
E2F4-209ENST00000567228 SHROOM2Q13796 1616 aa33.77■■■■□ 3
E2F4-209ENST00000567228 KIF27Q86VH2 1401 aa33.71■■■□□ 2.99
E2F4-209ENST00000567228 JPH4Q96JJ6 628 aa33.71■■■□□ 2.99
E2F4-209ENST00000567228 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP33.63■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms