RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566243.5

EDC3-211, Transcript of enhancer of mRNA decapping 3, humanhuman

TSL 3

Gene EDC3, Length 711 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3-211ENST00000566243 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.57■■■■■ 5.05
EDC3-211ENST00000566243 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.33■■■■■ 4.21
EDC3-211ENST00000566243 ABCC9O60706 1549 aa40.71■■■■■ 4.11
EDC3-211ENST00000566243 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.01■■■■□ 3.84
EDC3-211ENST00000566243 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.01■■■■□ 3.84
EDC3-211ENST00000566243 NACADO15069 1562 aa38.95■■■■□ 3.83
EDC3-211ENST00000566243 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.78■■■■□ 3.8
EDC3-211ENST00000566243 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.68■■■■□ 3.78
EDC3-211ENST00000566243 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.49■■■■□ 3.75
EDC3-211ENST00000566243 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.08■■■■□ 3.69
EDC3-211ENST00000566243 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.04■■■■□ 3.68
EDC3-211ENST00000566243 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.89■■■■□ 3.66
EDC3-211ENST00000566243 SCRIBQ14160 1630 aa37.79■■■■□ 3.64
EDC3-211ENST00000566243 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.56■■■■□ 3.6
EDC3-211ENST00000566243 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.43■■■■□ 3.58
EDC3-211ENST00000566243 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.89■■■■□ 3.5
EDC3-211ENST00000566243 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.76■■■■□ 3.48
EDC3-211ENST00000566243 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.58■■■■□ 3.45
EDC3-211ENST00000566243 SMARCA4P51532 1647 aa36.12■■■■□ 3.37
EDC3-211ENST00000566243 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.06■■■■□ 3.36
EDC3-211ENST00000566243 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.02■■■■□ 3.36
EDC3-211ENST00000566243 NCAPD3P42695 1498 aa36■■■■□ 3.35
EDC3-211ENST00000566243 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.92■■■■□ 3.34
EDC3-211ENST00000566243 SMARCA2P51531 1590 aa35.89■■■■□ 3.34
EDC3-211ENST00000566243 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.77■■■■□ 3.32
EDC3-211ENST00000566243 HMGXB3Q12766 1538 aa35.76■■■■□ 3.31
EDC3-211ENST00000566243 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.68■■■■□ 3.3
EDC3-211ENST00000566243 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.49■■■■□ 3.27
EDC3-211ENST00000566243 WIZO95785 1651 aa35.46■■■■□ 3.27
EDC3-211ENST00000566243 NESP48681 1621 aa35.21■■■■□ 3.23
EDC3-211ENST00000566243 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.1■■■■□ 3.21
EDC3-211ENST00000566243 ERCC6Q03468 1493 aa35.05■■■■□ 3.2
EDC3-211ENST00000566243 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35■■■■□ 3.19
EDC3-211ENST00000566243 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.97■■■■□ 3.19
EDC3-211ENST00000566243 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.81■■■■□ 3.16
EDC3-211ENST00000566243 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.73■■■■□ 3.15
EDC3-211ENST00000566243 CFTRP13569 1480 aa34.72■■■■□ 3.15
EDC3-211ENST00000566243 CUX2O14529 1486 aa34.71■■■■□ 3.15
EDC3-211ENST00000566243 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.66■■■■□ 3.14
EDC3-211ENST00000566243 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.62■■■■□ 3.13
EDC3-211ENST00000566243 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.55■■■■□ 3.12
EDC3-211ENST00000566243 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.52■■■■□ 3.12
EDC3-211ENST00000566243 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.49■■■■□ 3.11
EDC3-211ENST00000566243 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.47■■■■□ 3.11
EDC3-211ENST00000566243 WDR62O43379 1518 aa34.35■■■■□ 3.09
EDC3-211ENST00000566243 PRDM2Q13029 1718 aa34.23■■■■□ 3.07
EDC3-211ENST00000566243 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.23■■■■□ 3.07
EDC3-211ENST00000566243 TOPBP1Q92547 1522 aa33.98■■■■□ 3.03
EDC3-211ENST00000566243 ABCC8Q09428 1581 aa33.9■■■■□ 3.02
EDC3-211ENST00000566243 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.89■■■■□ 3.02
EDC3-211ENST00000566243 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.86■■■■□ 3.01
EDC3-211ENST00000566243 IFT140Q96RY7 1462 aa33.78■■■■□ 3
EDC3-211ENST00000566243 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.69■■■□□ 2.98
EDC3-211ENST00000566243 CUX1P39880 1505 aa33.69■■■□□ 2.98
EDC3-211ENST00000566243 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.69■■■□□ 2.98
EDC3-211ENST00000566243 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.59■■■□□ 2.97
EDC3-211ENST00000566243 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.58■■■□□ 2.97
EDC3-211ENST00000566243 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.58■■■□□ 2.97
EDC3-211ENST00000566243 SOGA1O94964 1423 aa33.55■■■□□ 2.96
EDC3-211ENST00000566243 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.49■■■□□ 2.95
EDC3-211ENST00000566243 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.47■■■□□ 2.95
EDC3-211ENST00000566243 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.43■■■□□ 2.94
EDC3-211ENST00000566243 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.42■■■□□ 2.94
EDC3-211ENST00000566243 SYNJ1O43426 1573 aa33.34■■■□□ 2.93
EDC3-211ENST00000566243 TOP2BQ02880 1626 aa33.31■■■□□ 2.92
EDC3-211ENST00000566243 OSCARQ8IYS5 282 aa33.3■■■□□ 2.92
EDC3-211ENST00000566243 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.28■■■□□ 2.92
EDC3-211ENST00000566243 WDR97A6NE52 1622 aa33.24■■■□□ 2.91
EDC3-211ENST00000566243 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.24■■■□□ 2.91
EDC3-211ENST00000566243 GRIN2BQ13224 1484 aa33.16■■■□□ 2.9
EDC3-211ENST00000566243 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.15■■■□□ 2.9
EDC3-211ENST00000566243 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.15■■■□□ 2.9
EDC3-211ENST00000566243 FBLN2P98095 1184 aa33.1■■■□□ 2.89
EDC3-211ENST00000566243 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.09■■■□□ 2.89
EDC3-211ENST00000566243 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.05■■■□□ 2.88
EDC3-211ENST00000566243 CHD1O14646 1710 aa33■■■□□ 2.87
EDC3-211ENST00000566243 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.98■■■□□ 2.87
EDC3-211ENST00000566243 PBRM1Q86U86 1689 aa32.97■■■□□ 2.87
EDC3-211ENST00000566243 SYNJ2O15056 1496 aa32.95■■■□□ 2.87
EDC3-211ENST00000566243 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.82■■■□□ 2.84
EDC3-211ENST00000566243 ADAMTS12P58397 1594 aa32.79■■■□□ 2.84
EDC3-211ENST00000566243 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.77■■■□□ 2.84
EDC3-211ENST00000566243 ARHGEF11O15085 1522 aa32.75■■■□□ 2.83
EDC3-211ENST00000566243 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.74■■■□□ 2.83
EDC3-211ENST00000566243 GRIN2AQ12879 1464 aa32.74■■■□□ 2.83
EDC3-211ENST00000566243 KIF27Q86VH2 1401 aa32.73■■■□□ 2.83
EDC3-211ENST00000566243 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.72■■■□□ 2.83
EDC3-211ENST00000566243 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.72■■■□□ 2.83
EDC3-211ENST00000566243 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.72■■■□□ 2.83
EDC3-211ENST00000566243 TRIM41Q8WV44 630 aa32.71■■■□□ 2.83
EDC3-211ENST00000566243 IGF1RP08069 1367 aa32.67■■■□□ 2.82
EDC3-211ENST00000566243 NUP160Q12769 1436 aa32.61■■■□□ 2.81
EDC3-211ENST00000566243 CEP170Q5SW79 1584 aa32.57■■■□□ 2.8
EDC3-211ENST00000566243 ARAP1Q96P48 1450 aa32.5■■■□□ 2.79
EDC3-211ENST00000566243 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.49■■■□□ 2.79
EDC3-211ENST00000566243 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.46■■■□□ 2.79
EDC3-211ENST00000566243 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.44■■■□□ 2.78
EDC3-211ENST00000566243 CUL7Q14999 1698 aa32.43■■■□□ 2.78
EDC3-211ENST00000566243 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.32■■■□□ 2.77
EDC3-211ENST00000566243 SHROOM2Q13796 1616 aa32.31■■■□□ 2.76
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