RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565864.5

ITGAL-212, Transcript of integrin subunit alpha L, humanhuman

TSL 2

Gene ITGAL, Length 536 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAL-212ENST00000565864 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.39■■■■■ 4.22
ITGAL-212ENST00000565864 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.81■■■■□ 3.48
ITGAL-212ENST00000565864 ABCC9O60706 1549 aa35.52■■■■□ 3.28
ITGAL-212ENST00000565864 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.62■■■■□ 3.13
ITGAL-212ENST00000565864 NACADO15069 1562 aa34.43■■■■□ 3.1
ITGAL-212ENST00000565864 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.4■■■■□ 3.1
ITGAL-212ENST00000565864 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.35■■■■□ 3.09
ITGAL-212ENST00000565864 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.32■■■■□ 3.08
ITGAL-212ENST00000565864 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.15■■■■□ 3.06
ITGAL-212ENST00000565864 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.7■■■□□ 2.99
ITGAL-212ENST00000565864 SCRIBQ14160 1630 aa33.53■■■□□ 2.96
ITGAL-212ENST00000565864 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.35■■■□□ 2.93
ITGAL-212ENST00000565864 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.1■■■□□ 2.89
ITGAL-212ENST00000565864 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.1■■■□□ 2.89
ITGAL-212ENST00000565864 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.45■■■□□ 2.78
ITGAL-212ENST00000565864 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.22■■■□□ 2.75
ITGAL-212ENST00000565864 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.16■■■□□ 2.74
ITGAL-212ENST00000565864 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.14■■■□□ 2.74
ITGAL-212ENST00000565864 SMARCA4P51532 1647 aa32.12■■■□□ 2.73
ITGAL-212ENST00000565864 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.1■■■□□ 2.73
ITGAL-212ENST00000565864 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.9■■■□□ 2.7
ITGAL-212ENST00000565864 SMARCA2P51531 1590 aa31.81■■■□□ 2.68
ITGAL-212ENST00000565864 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.81■■■□□ 2.68
ITGAL-212ENST00000565864 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.78■■■□□ 2.68
ITGAL-212ENST00000565864 HMGXB3Q12766 1538 aa31.7■■■□□ 2.66
ITGAL-212ENST00000565864 NCAPD3P42695 1498 aa31.69■■■□□ 2.66
ITGAL-212ENST00000565864 WIZO95785 1651 aa31.6■■■□□ 2.65
ITGAL-212ENST00000565864 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.59■■■□□ 2.65
ITGAL-212ENST00000565864 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.56■■■□□ 2.64
ITGAL-212ENST00000565864 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.33■■■□□ 2.61
ITGAL-212ENST00000565864 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.89■■■□□ 2.54
ITGAL-212ENST00000565864 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
ITGAL-212ENST00000565864 NESP48681 1621 aa30.84■■■□□ 2.53
ITGAL-212ENST00000565864 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.83■■■□□ 2.53
ITGAL-212ENST00000565864 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.75■■■□□ 2.51
ITGAL-212ENST00000565864 PRDM2Q13029 1718 aa30.7■■■□□ 2.5
ITGAL-212ENST00000565864 CFTRP13569 1480 aa30.7■■■□□ 2.5
ITGAL-212ENST00000565864 ERCC6Q03468 1493 aa30.61■■■□□ 2.49
ITGAL-212ENST00000565864 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.61■■■□□ 2.49
ITGAL-212ENST00000565864 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.57■■■□□ 2.48
ITGAL-212ENST00000565864 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
ITGAL-212ENST00000565864 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.46■■■□□ 2.47
ITGAL-212ENST00000565864 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.44■■■□□ 2.46
ITGAL-212ENST00000565864 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.32■■■□□ 2.44
ITGAL-212ENST00000565864 WDR62O43379 1518 aa30.26■■■□□ 2.43
ITGAL-212ENST00000565864 CUX2O14529 1486 aa30.23■■■□□ 2.43
ITGAL-212ENST00000565864 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
ITGAL-212ENST00000565864 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.07■■■□□ 2.4
ITGAL-212ENST00000565864 TOPBP1Q92547 1522 aa30.03■■■□□ 2.4
ITGAL-212ENST00000565864 ABCC8Q09428 1581 aa30.01■■■□□ 2.39
ITGAL-212ENST00000565864 CUX1P39880 1505 aa29.94■■■□□ 2.38
ITGAL-212ENST00000565864 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.83■■■□□ 2.37
ITGAL-212ENST00000565864 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.81■■■□□ 2.36
ITGAL-212ENST00000565864 SYNJ1O43426 1573 aa29.8■■■□□ 2.36
ITGAL-212ENST00000565864 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
ITGAL-212ENST00000565864 TOP2BQ02880 1626 aa29.79■■■□□ 2.36
ITGAL-212ENST00000565864 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.77■■■□□ 2.36
ITGAL-212ENST00000565864 IFT140Q96RY7 1462 aa29.75■■■□□ 2.35
ITGAL-212ENST00000565864 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
ITGAL-212ENST00000565864 WDR97A6NE52 1622 aa29.66■■■□□ 2.34
ITGAL-212ENST00000565864 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.6■■■□□ 2.33
ITGAL-212ENST00000565864 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
ITGAL-212ENST00000565864 SOGA1O94964 1423 aa29.57■■■□□ 2.32
ITGAL-212ENST00000565864 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
ITGAL-212ENST00000565864 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.5■■■□□ 2.31
ITGAL-212ENST00000565864 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.45■■■□□ 2.3
ITGAL-212ENST00000565864 PBRM1Q86U86 1689 aa29.38■■■□□ 2.29
ITGAL-212ENST00000565864 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.37■■■□□ 2.29
ITGAL-212ENST00000565864 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
ITGAL-212ENST00000565864 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.3■■■□□ 2.28
ITGAL-212ENST00000565864 GRIN2BQ13224 1484 aa29.27■■■□□ 2.28
ITGAL-212ENST00000565864 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.23■■■□□ 2.27
ITGAL-212ENST00000565864 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.26
ITGAL-212ENST00000565864 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.18■■■□□ 2.26
ITGAL-212ENST00000565864 ADAMTS12P58397 1594 aa29.16■■■□□ 2.26
ITGAL-212ENST00000565864 CHD1O14646 1710 aa29.16■■■□□ 2.26
ITGAL-212ENST00000565864 TRIM41Q8WV44 630 aa29.15■■■□□ 2.26
ITGAL-212ENST00000565864 KIF27Q86VH2 1401 aa29.14■■■□□ 2.26
ITGAL-212ENST00000565864 SYNJ2O15056 1496 aa29.06■■■□□ 2.24
ITGAL-212ENST00000565864 CUL7Q14999 1698 aa29.04■■■□□ 2.24
ITGAL-212ENST00000565864 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.01■■■□□ 2.23
ITGAL-212ENST00000565864 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.97■■■□□ 2.23
ITGAL-212ENST00000565864 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.94■■■□□ 2.22
ITGAL-212ENST00000565864 GRIN2AQ12879 1464 aa28.92■■■□□ 2.22
ITGAL-212ENST00000565864 IGF1RP08069 1367 aa28.9■■■□□ 2.22
ITGAL-212ENST00000565864 FBLN2P98095 1184 aa28.85■■■□□ 2.21
ITGAL-212ENST00000565864 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
ITGAL-212ENST00000565864 EEA1Q15075 1411 aa28.84■■■□□ 2.21
ITGAL-212ENST00000565864 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.83■■■□□ 2.21
ITGAL-212ENST00000565864 OSCARQ8IYS5 282 aa28.81■■■□□ 2.2
ITGAL-212ENST00000565864 CEP170Q5SW79 1584 aa28.8■■■□□ 2.2
ITGAL-212ENST00000565864 NUP160Q12769 1436 aa28.78■■■□□ 2.2
ITGAL-212ENST00000565864 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.76■■■□□ 2.2
ITGAL-212ENST00000565864 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.71■■■□□ 2.19
ITGAL-212ENST00000565864 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.7■■■□□ 2.18
ITGAL-212ENST00000565864 PRXQ9BXM0 1461 aa28.69■■■□□ 2.18
ITGAL-212ENST00000565864 KIF21BO75037 1637 aa28.6■■■□□ 2.17
ITGAL-212ENST00000565864 SHROOM2Q13796 1616 aa28.6■■■□□ 2.17
ITGAL-212ENST00000565864 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.58■■■□□ 2.16
ITGAL-212ENST00000565864 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.57■■■□□ 2.16
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