RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565684.5

KIFC3-223, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 5

Gene KIFC3, Length 623 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-223	ENST00000565684	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		56.28	■■■■■ 6.6
KIFC3-223	ENST00000565684	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		50.36	■■■■■ 5.65
KIFC3-223	ENST00000565684	ABCC9	O60706	1549 aa		49.69	■■■■■ 5.54
KIFC3-223	ENST00000565684	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		47.58	■■■■■ 5.21
KIFC3-223	ENST00000565684	NACAD	O15069	1562 aa		47.38	■■■■■ 5.18
KIFC3-223	ENST00000565684	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		47.03	■■■■■ 5.12
KIFC3-223	ENST00000565684	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		46.94	■■■■■ 5.1
KIFC3-223	ENST00000565684	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	46.8	■■■■■ 5.08
KIFC3-223	ENST00000565684	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		46.71	■■■■■ 5.07
KIFC3-223	ENST00000565684	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		46.55	■■■■■ 5.04
KIFC3-223	ENST00000565684	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		46.27	■■■■■ 5
KIFC3-223	ENST00000565684	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	46.27	■■■■■ 5
KIFC3-223	ENST00000565684	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		46.1	■■■■■ 4.97
KIFC3-223	ENST00000565684	SCRIB	Q14160	1630 aa		45.88	■■■■■ 4.93
KIFC3-223	ENST00000565684	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		45.61	■■■■■ 4.89
KIFC3-223	ENST00000565684	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	45.03	■■■■■ 4.8
KIFC3-223	ENST00000565684	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		44.99	■■■■■ 4.79
KIFC3-223	ENST00000565684	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		44.69	■■■■■ 4.74
KIFC3-223	ENST00000565684	SMARCA4	P51532	1647 aa		43.84	■■■■■ 4.61
KIFC3-223	ENST00000565684	NCAPD3	P42695	1498 aa		43.71	■■■■■ 4.59
KIFC3-223	ENST00000565684	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		43.67	■■■■■ 4.58
KIFC3-223	ENST00000565684	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	43.65	■■■■■ 4.58
KIFC3-223	ENST00000565684	SMARCA2	P51531	1590 aa		43.58	■■■■■ 4.57
KIFC3-223	ENST00000565684	HMGXB3	Q12766	1538 aa		43.5	■■■■■ 4.55
KIFC3-223	ENST00000565684	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		43.42	■■■■■ 4.54
KIFC3-223	ENST00000565684	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		43.4	■■■■■ 4.54
KIFC3-223	ENST00000565684	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	43.25	■■■■■ 4.51
KIFC3-223	ENST00000565684	WIZ	O95785	1651 aa		42.95	■■■■■ 4.47
KIFC3-223	ENST00000565684	NES	P48681	1621 aa		42.89	■■■■■ 4.46
KIFC3-223	ENST00000565684	ERCC6	Q03468	1493 aa		42.81	■■■■■ 4.44
KIFC3-223	ENST00000565684	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		42.69	■■■■■ 4.42
KIFC3-223	ENST00000565684	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	42.65	■■■■■ 4.42
KIFC3-223	ENST00000565684	CUX2	O14529	1486 aa		42.6	■■■■■ 4.41
KIFC3-223	ENST00000565684	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		42.46	■■■■■ 4.39
KIFC3-223	ENST00000565684	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	42.44	■■■■■ 4.38
KIFC3-223	ENST00000565684	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	42.41	■■■■■ 4.38
KIFC3-223	ENST00000565684	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		42.36	■■■■■ 4.37
KIFC3-223	ENST00000565684	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		42.31	■■■■■ 4.36
KIFC3-223	ENST00000565684	CFTR	P13569	1480 aa		42.05	■■■■■ 4.32
KIFC3-223	ENST00000565684	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		41.98	■■■■■ 4.31
KIFC3-223	ENST00000565684	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		41.92	■■■■■ 4.3
KIFC3-223	ENST00000565684	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		41.92	■■■■■ 4.3
KIFC3-223	ENST00000565684	WDR62	O43379	1518 aa		41.92	■■■■■ 4.3
KIFC3-223	ENST00000565684	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		41.87	■■■■■ 4.29
KIFC3-223	ENST00000565684	PRDM2	Q13029	1718 aa		41.86	■■■■■ 4.29
KIFC3-223	ENST00000565684	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		41.86	■■■■■ 4.29
KIFC3-223	ENST00000565684	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	41.59	■■■■■ 4.25
KIFC3-223	ENST00000565684	TOPBP1	Q92547	1522 aa		41.23	■■■■■ 4.19
KIFC3-223	ENST00000565684	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		41.14	■■■■■ 4.18
KIFC3-223	ENST00000565684	ABCC8	Q09428	1581 aa		41.11	■■■■■ 4.17
KIFC3-223	ENST00000565684	IFT140	Q96RY7	1462 aa		41.04	■■■■■ 4.16
KIFC3-223	ENST00000565684	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	41.03	■■■■■ 4.16
KIFC3-223	ENST00000565684	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	40.98	■■■■■ 4.15
KIFC3-223	ENST00000565684	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	40.89	■■■■■ 4.14
KIFC3-223	ENST00000565684	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	40.85	■■■■■ 4.13
KIFC3-223	ENST00000565684	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	40.83	■■■■■ 4.13
KIFC3-223	ENST00000565684	CUX1	P39880	1505 aa		40.75	■■■■■ 4.11
KIFC3-223	ENST00000565684	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		40.65	■■■■■ 4.1
KIFC3-223	ENST00000565684	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		40.65	■■■■■ 4.1
KIFC3-223	ENST00000565684	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	40.62	■■■■■ 4.09	3e-9	■■■■■ 42.8
KIFC3-223	ENST00000565684	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		40.61	■■■■■ 4.09
KIFC3-223	ENST00000565684	SOGA1	O94964	1423 aa		40.58	■■■■■ 4.09
KIFC3-223	ENST00000565684	WDR97	A6NE52	1622 aa		40.49	■■■■■ 4.07
KIFC3-223	ENST00000565684	CHD1	O14646	1710 aa		40.47	■■■■■ 4.07
KIFC3-223	ENST00000565684	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	40.43	■■■■■ 4.06
KIFC3-223	ENST00000565684	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		40.31	■■■■■ 4.04
KIFC3-223	ENST00000565684	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		40.26	■■■■■ 4.04
KIFC3-223	ENST00000565684	TOP2B	Q02880	1626 aa		40.26	■■■■■ 4.04
KIFC3-223	ENST00000565684	SYNJ1	O43426	1573 aa		40.25	■■■■■ 4.03
KIFC3-223	ENST00000565684	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		40.24	■■■■■ 4.03
KIFC3-223	ENST00000565684	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		40.24	■■■■■ 4.03
KIFC3-223	ENST00000565684	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		40.24	■■■■■ 4.03
KIFC3-223	ENST00000565684	PBRM1	Q86U86	1689 aa		40.24	■■■■■ 4.03
KIFC3-223	ENST00000565684	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		40.22	■■■■■ 4.03
KIFC3-223	ENST00000565684	TRIM41	Q8WV44	630 aa		40.21	■■■■■ 4.03
KIFC3-223	ENST00000565684	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		40.2	■■■■■ 4.03
KIFC3-223	ENST00000565684	GRIN2B	Q13224	1484 aa		40.2	■■■■■ 4.03
KIFC3-223	ENST00000565684	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	40.19	■■■■■ 4.02
KIFC3-223	ENST00000565684	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	40.17	■■■■■ 4.02
KIFC3-223	ENST00000565684	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		40.13	■■■■■ 4.02
KIFC3-223	ENST00000565684	ARHGEF11	O15085	1522 aa		40.12	■■■■■ 4.01
KIFC3-223	ENST00000565684	FBLN2	P98095	1184 aa		40.11	■■■■■ 4.01
KIFC3-223	ENST00000565684	SYNJ2	O15056	1496 aa		40.02	■■■■■ 4
KIFC3-223	ENST00000565684	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		39.98	■■■■□ 3.99
KIFC3-223	ENST00000565684	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	39.92	■■■■□ 3.98
KIFC3-223	ENST00000565684	ADAMTS12	P58397	1594 aa		39.84	■■■■□ 3.97
KIFC3-223	ENST00000565684	ARAP1	Q96P48	1450 aa		39.77	■■■■□ 3.96
KIFC3-223	ENST00000565684	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		39.74	■■■■□ 3.95
KIFC3-223	ENST00000565684	GRIN2A	Q12879	1464 aa		39.72	■■■■□ 3.95
KIFC3-223	ENST00000565684	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		39.64	■■■■□ 3.94
KIFC3-223	ENST00000565684	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		39.64	■■■■□ 3.94
KIFC3-223	ENST00000565684	CEP170	Q5SW79	1584 aa		39.62	■■■■□ 3.93
KIFC3-223	ENST00000565684	NUP160	Q12769	1436 aa		39.57	■■■■□ 3.92
KIFC3-223	ENST00000565684	SHROOM2	Q13796	1616 aa		39.42	■■■■□ 3.9
KIFC3-223	ENST00000565684	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		39.41	■■■■□ 3.9
KIFC3-223	ENST00000565684	KIF27	Q86VH2	1401 aa		39.36	■■■■□ 3.89
KIFC3-223	ENST00000565684	CUL7	Q14999	1698 aa		39.32	■■■■□ 3.88
KIFC3-223	ENST00000565684	IGF1R	P08069	1367 aa		39.29	■■■■□ 3.88
KIFC3-223	ENST00000565684	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		39.29	■■■■□ 3.88
KIFC3-223	ENST00000565684	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	39.07	■■■■□ 3.85

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms