RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565270.1

KIFC3-219, Transcript of kinesin family member C3, humanhuman

TSL 5

Gene KIFC3, Length 1,081 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFC3-219ENST00000565270 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.93■■■■■ 7.18
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KIFC3-219ENST00000565270 SCRIBQ14160 1630 aa48.63■■■■■ 5.38
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KIFC3-219ENST00000565270 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.23■■■■■ 5.15
KIFC3-219ENST00000565270 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.96■■■■■ 5.11
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KIFC3-219ENST00000565270 SMARCA2P51531 1590 aa46.23■■■■■ 4.99
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KIFC3-219ENST00000565270 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.05■■■■■ 4.8
KIFC3-219ENST00000565270 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.94■■■■■ 4.78
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KIFC3-219ENST00000565270 CUX2O14529 1486 aa44.6■■■■■ 4.73
KIFC3-219ENST00000565270 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.59■■■■■ 4.73
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KIFC3-219ENST00000565270 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.34■■■■■ 4.69
KIFC3-219ENST00000565270 PRDM2Q13029 1718 aa44.2■■■■■ 4.67
KIFC3-219ENST00000565270 WDR62O43379 1518 aa44.18■■■■■ 4.66
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KIFC3-219ENST00000565270 TOPBP1Q92547 1522 aa43.69■■■■■ 4.59
KIFC3-219ENST00000565270 ABCC8Q09428 1581 aa43.67■■■■■ 4.58
KIFC3-219ENST00000565270 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.63■■■■■ 4.58
KIFC3-219ENST00000565270 IFT140Q96RY7 1462 aa43.45■■■■■ 4.55
KIFC3-219ENST00000565270 CUX1P39880 1505 aa43.33■■■■■ 4.53
KIFC3-219ENST00000565270 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.32■■■■■ 4.53
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KIFC3-219ENST00000565270 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.2■■■■■ 4.51
KIFC3-219ENST00000565270 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.2■■■■■ 4.51
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KIFC3-219ENST00000565270 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.91■■■■■ 4.46
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KIFC3-219ENST00000565270 WDR97A6NE52 1622 aa42.87■■■■■ 4.45
KIFC3-219ENST00000565270 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.79■■■■■ 4.44
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KIFC3-219ENST00000565270 GRIN2BQ13224 1484 aa42.66■■■■■ 4.42
KIFC3-219ENST00000565270 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.64■■■■■ 4.42
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KIFC3-219ENST00000565270 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.6■■■■■ 4.41
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KIFC3-219ENST00000565270 CHD1O14646 1710 aa42.48■■■■■ 4.39
KIFC3-219ENST00000565270 SYNJ2O15056 1496 aa42.39■■■■■ 4.38
KIFC3-219ENST00000565270 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.37■■■■■ 4.37
KIFC3-219ENST00000565270 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.26■■■■■ 4.36
KIFC3-219ENST00000565270 ADAMTS12P58397 1594 aa42.22■■■■■ 4.35
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KIFC3-219ENST00000565270 KIF27Q86VH2 1401 aa42.15■■■■■ 4.34
KIFC3-219ENST00000565270 GRIN2AQ12879 1464 aa42.11■■■■■ 4.33
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KIFC3-219ENST00000565270 CEP170Q5SW79 1584 aa41.88■■■■■ 4.3
KIFC3-219ENST00000565270 CUL7Q14999 1698 aa41.84■■■■■ 4.29
KIFC3-219ENST00000565270 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.73■■■■■ 4.27
KIFC3-219ENST00000565270 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.72■■■■■ 4.27
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KIFC3-219ENST00000565270 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.64■■■■■ 4.26
KIFC3-219ENST00000565270 SHROOM2Q13796 1616 aa41.58■■■■■ 4.25
KIFC3-219ENST00000565270 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.5■■■■■ 4.23
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