RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565210.5

CDH11-211, Transcript of cadherin 11, humanhuman

TSL 4

Gene CDH11, Length 542 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH11-211ENST00000565210 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.58■■■■■ 6.33
CDH11-211ENST00000565210 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.58■■■■■ 5.37
CDH11-211ENST00000565210 ABCC9O60706 1549 aa47.86■■■■■ 5.25
CDH11-211ENST00000565210 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.96■■■■■ 4.95
CDH11-211ENST00000565210 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.93■■■■■ 4.94
CDH11-211ENST00000565210 NACADO15069 1562 aa45.84■■■■■ 4.93
CDH11-211ENST00000565210 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.49■■■■■ 4.87
CDH11-211ENST00000565210 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.36■■■■■ 4.85
CDH11-211ENST00000565210 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.17■■■■■ 4.82
CDH11-211ENST00000565210 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.74■■■■■ 4.75
CDH11-211ENST00000565210 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.66■■■■■ 4.74
CDH11-211ENST00000565210 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.41■■■■■ 4.7
CDH11-211ENST00000565210 SCRIBQ14160 1630 aa44.29■■■■■ 4.68
CDH11-211ENST00000565210 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.14■■■■■ 4.66
CDH11-211ENST00000565210 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.12■■■■■ 4.65
CDH11-211ENST00000565210 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.35■■■■■ 4.53
CDH11-211ENST00000565210 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.23■■■■■ 4.51
CDH11-211ENST00000565210 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.07■■■■■ 4.49
CDH11-211ENST00000565210 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.36■■■■■ 4.37
CDH11-211ENST00000565210 SMARCA4P51532 1647 aa42.35■■■■■ 4.37
CDH11-211ENST00000565210 NCAPD3P42695 1498 aa42.32■■■■■ 4.37
CDH11-211ENST00000565210 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.26■■■■■ 4.36
CDH11-211ENST00000565210 SMARCA2P51531 1590 aa42.23■■■■■ 4.35
CDH11-211ENST00000565210 HMGXB3Q12766 1538 aa42.03■■■■■ 4.32
CDH11-211ENST00000565210 MROH2BQ7Z745 1585 aa42■■■■■ 4.31
CDH11-211ENST00000565210 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.96■■■■■ 4.31
CDH11-211ENST00000565210 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.94■■■■■ 4.3
CDH11-211ENST00000565210 WIZO95785 1651 aa41.5■■■■■ 4.23
CDH11-211ENST00000565210 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.49■■■■■ 4.23
CDH11-211ENST00000565210 ERCC6Q03468 1493 aa41.38■■■■■ 4.21
CDH11-211ENST00000565210 NESP48681 1621 aa41.26■■■■■ 4.2
CDH11-211ENST00000565210 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.22■■■■■ 4.19
CDH11-211ENST00000565210 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.12■■■■■ 4.17
CDH11-211ENST00000565210 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.12■■■■■ 4.17
CDH11-211ENST00000565210 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.07■■■■■ 4.16
CDH11-211ENST00000565210 CUX2O14529 1486 aa41.01■■■■■ 4.16
CDH11-211ENST00000565210 CFTRP13569 1480 aa40.75■■■■■ 4.11
CDH11-211ENST00000565210 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.71■■■■■ 4.11
CDH11-211ENST00000565210 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.66■■■■■ 4.1
CDH11-211ENST00000565210 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.65■■■■■ 4.1
CDH11-211ENST00000565210 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.58■■■■■ 4.09
CDH11-211ENST00000565210 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.58■■■■■ 4.09
CDH11-211ENST00000565210 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.56■■■■■ 4.08
CDH11-211ENST00000565210 WDR62O43379 1518 aa40.37■■■■■ 4.05
CDH11-211ENST00000565210 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.36■■■■■ 4.05
CDH11-211ENST00000565210 PRDM2Q13029 1718 aa40.26■■■■■ 4.04
CDH11-211ENST00000565210 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.11■■■■■ 4.01
CDH11-211ENST00000565210 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.11■■■■■ 4.01
CDH11-211ENST00000565210 ABCC8Q09428 1581 aa40■■■■□ 3.99
CDH11-211ENST00000565210 TOPBP1Q92547 1522 aa39.87■■■■□ 3.97
CDH11-211ENST00000565210 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.8■■■■□ 3.96
CDH11-211ENST00000565210 IFT140Q96RY7 1462 aa39.76■■■■□ 3.96
CDH11-211ENST00000565210 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.51■■■■□ 3.92
CDH11-211ENST00000565210 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.49■■■■□ 3.91
CDH11-211ENST00000565210 SOGA1O94964 1423 aa39.45■■■■□ 3.91
CDH11-211ENST00000565210 CUX1P39880 1505 aa39.41■■■■□ 3.9
CDH11-211ENST00000565210 OSCARQ8IYS5 282 aa39.39■■■■□ 3.9
CDH11-211ENST00000565210 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.38■■■■□ 3.9
CDH11-211ENST00000565210 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.37■■■■□ 3.89
CDH11-211ENST00000565210 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.33■■■■□ 3.89
CDH11-211ENST00000565210 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.3■■■■□ 3.88
CDH11-211ENST00000565210 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.29■■■■□ 3.88
CDH11-211ENST00000565210 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.21■■■■□ 3.87
CDH11-211ENST00000565210 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.19■■■■□ 3.86
CDH11-211ENST00000565210 WDR97A6NE52 1622 aa39.18■■■■□ 3.86
CDH11-211ENST00000565210 TOP2BQ02880 1626 aa39.03■■■■□ 3.84
CDH11-211ENST00000565210 FBLN2P98095 1184 aa39.03■■■■□ 3.84
CDH11-211ENST00000565210 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.01■■■■□ 3.84
CDH11-211ENST00000565210 GRIN2BQ13224 1484 aa38.99■■■■□ 3.83
CDH11-211ENST00000565210 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.99■■■■□ 3.83
CDH11-211ENST00000565210 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.95■■■■□ 3.83
CDH11-211ENST00000565210 SYNJ1O43426 1573 aa38.94■■■■□ 3.82
CDH11-211ENST00000565210 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.92■■■■□ 3.82
CDH11-211ENST00000565210 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.91■■■■□ 3.82
CDH11-211ENST00000565210 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.91■■■■□ 3.82
CDH11-211ENST00000565210 CHD1O14646 1710 aa38.8■■■■□ 3.8
CDH11-211ENST00000565210 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.78■■■■□ 3.8
CDH11-211ENST00000565210 SYNJ2O15056 1496 aa38.75■■■■□ 3.79
CDH11-211ENST00000565210 PBRM1Q86U86 1689 aa38.72■■■■□ 3.79
CDH11-211ENST00000565210 TRIM41Q8WV44 630 aa38.7■■■■□ 3.79
CDH11-211ENST00000565210 ARHGEF11O15085 1522 aa38.55■■■■□ 3.76
CDH11-211ENST00000565210 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.55■■■■□ 3.76
CDH11-211ENST00000565210 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.53■■■■□ 3.76
CDH11-211ENST00000565210 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.53■■■■□ 3.76
CDH11-211ENST00000565210 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.53■■■■□ 3.76
CDH11-211ENST00000565210 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.52■■■■□ 3.76
CDH11-211ENST00000565210 KIF27Q86VH2 1401 aa38.45■■■■□ 3.75
CDH11-211ENST00000565210 ADAMTS12P58397 1594 aa38.44■■■■□ 3.74
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CDH11-211ENST00000565210 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.43■■■■□ 3.74
CDH11-211ENST00000565210 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.36■■■■□ 3.73
CDH11-211ENST00000565210 NUP160Q12769 1436 aa38.29■■■■□ 3.72
CDH11-211ENST00000565210 IGF1RP08069 1367 aa38.27■■■■□ 3.72
CDH11-211ENST00000565210 ARAP1Q96P48 1450 aa38.2■■■■□ 3.71
CDH11-211ENST00000565210 CEP170Q5SW79 1584 aa38.17■■■■□ 3.7
CDH11-211ENST00000565210 CUL7Q14999 1698 aa38.11■■■■□ 3.69
CDH11-211ENST00000565210 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.08■■■■□ 3.69
CDH11-211ENST00000565210 JPH4Q96JJ6 628 aa38.02■■■■□ 3.68
CDH11-211ENST00000565210 SHROOM2Q13796 1616 aa37.93■■■■□ 3.66
CDH11-211ENST00000565210 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa37.91■■■■□ 3.66
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