RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565112.1

C16orf87-204, Transcript of chromosome 16 open reading frame 87, humanhuman

TSL 5

Gene C16orf87, Length 879 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf87-204ENST00000565112 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.37■■■■■ 6.77
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C16orf87-204ENST00000565112 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.07■■■■■ 5.45
C16orf87-204ENST00000565112 NACADO15069 1562 aa48.72■■■■■ 5.39
C16orf87-204ENST00000565112 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.63■■■■■ 5.38
C16orf87-204ENST00000565112 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.38■■■■■ 5.34
C16orf87-204ENST00000565112 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.07■■■■■ 5.29
C16orf87-204ENST00000565112 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.03■■■■■ 5.28
C16orf87-204ENST00000565112 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.98■■■■■ 5.27
C16orf87-204ENST00000565112 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.73■■■■■ 5.23
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C16orf87-204ENST00000565112 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.02■■■■■ 5.12
C16orf87-204ENST00000565112 SCRIBQ14160 1630 aa46.94■■■■■ 5.11
C16orf87-204ENST00000565112 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.65■■■■■ 5.06
C16orf87-204ENST00000565112 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.54■■■■■ 5.04
C16orf87-204ENST00000565112 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.54■■■■■ 5.04
C16orf87-204ENST00000565112 NCAPD3P42695 1498 aa45.01■■■■■ 4.8
C16orf87-204ENST00000565112 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.86■■■■■ 4.77
C16orf87-204ENST00000565112 SMARCA4P51532 1647 aa44.77■■■■■ 4.76
C16orf87-204ENST00000565112 SMARCA2P51531 1590 aa44.69■■■■■ 4.74
C16orf87-204ENST00000565112 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.68■■■■■ 4.74
C16orf87-204ENST00000565112 HMGXB3Q12766 1538 aa44.66■■■■■ 4.74
C16orf87-204ENST00000565112 ERCC6Q03468 1493 aa44.57■■■■■ 4.73
C16orf87-204ENST00000565112 CUX2O14529 1486 aa44.56■■■■■ 4.72
C16orf87-204ENST00000565112 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.51■■■■■ 4.72
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C16orf87-204ENST00000565112 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.35■■■■■ 4.69
C16orf87-204ENST00000565112 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.22■■■■■ 4.67
C16orf87-204ENST00000565112 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.98■■■■■ 4.63
C16orf87-204ENST00000565112 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.94■■■■■ 4.62
C16orf87-204ENST00000565112 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.75■■■■■ 4.59
C16orf87-204ENST00000565112 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.73■■■■■ 4.59
C16orf87-204ENST00000565112 WIZO95785 1651 aa43.65■■■■■ 4.58
C16orf87-204ENST00000565112 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.63■■■■■ 4.57
C16orf87-204ENST00000565112 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.38■■■■■ 4.54
C16orf87-204ENST00000565112 WDR62O43379 1518 aa43.31■■■■■ 4.52
C16orf87-204ENST00000565112 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.26■■■■■ 4.52
C16orf87-204ENST00000565112 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.17■■■■■ 4.5
C16orf87-204ENST00000565112 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.13■■■■■ 4.5
C16orf87-204ENST00000565112 CFTRP13569 1480 aa43.13■■■■■ 4.49
C16orf87-204ENST00000565112 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.1■■■■■ 4.49
C16orf87-204ENST00000565112 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.81■■■■■ 4.44
C16orf87-204ENST00000565112 TRIM41Q8WV44 630 aa42.64■■■■■ 4.42
C16orf87-204ENST00000565112 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.62■■■■■ 4.41
C16orf87-204ENST00000565112 PRDM2Q13029 1718 aa42.6■■■■■ 4.41
C16orf87-204ENST00000565112 OSCARQ8IYS5 282 aa42.46■■■■■ 4.39
C16orf87-204ENST00000565112 IFT140Q96RY7 1462 aa42.32■■■■■ 4.37
C16orf87-204ENST00000565112 TOPBP1Q92547 1522 aa42.31■■■■■ 4.36
C16orf87-204ENST00000565112 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.31■■■■■ 4.36
C16orf87-204ENST00000565112 ABCC8Q09428 1581 aa42.14■■■■■ 4.34
C16orf87-204ENST00000565112 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.13■■■■■ 4.33
C16orf87-204ENST00000565112 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.05■■■■■ 4.32
C16orf87-204ENST00000565112 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.98■■■■■ 4.31
C16orf87-204ENST00000565112 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.98■■■■■ 4.31
C16orf87-204ENST00000565112 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.98■■■■■ 4.31
C16orf87-204ENST00000565112 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.95■■■■■ 4.31
C16orf87-204ENST00000565112 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.9■■■■■ 4.3
C16orf87-204ENST00000565112 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.88■■■■■ 4.29
C16orf87-204ENST00000565112 ARHGEF11O15085 1522 aa41.85■■■■■ 4.29
C16orf87-204ENST00000565112 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.73■■■■■ 4.27
C16orf87-204ENST00000565112 CHD1O14646 1710 aa41.73■■■■■ 4.27
C16orf87-204ENST00000565112 SOGA1O94964 1423 aa41.65■■■■■ 4.26
C16orf87-204ENST00000565112 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.61■■■■■ 4.25
C16orf87-204ENST00000565112 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.59■■■■■ 4.25
C16orf87-204ENST00000565112 FBLN2P98095 1184 aa41.57■■■■■ 4.25
C16orf87-204ENST00000565112 CUX1P39880 1505 aa41.55■■■■■ 4.24
C16orf87-204ENST00000565112 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.5■■■■■ 4.23
C16orf87-204ENST00000565112 WDR97A6NE52 1622 aa41.47■■■■■ 4.23
C16orf87-204ENST00000565112 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.47■■■■■ 4.23
C16orf87-204ENST00000565112 ARAP1Q96P48 1450 aa41.45■■■■■ 4.23
C16orf87-204ENST00000565112 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.33■■■■■ 4.21
C16orf87-204ENST00000565112 GRIN2BQ13224 1484 aa41.31■■■■■ 4.2
C16orf87-204ENST00000565112 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.3■■■■■ 4.2
C16orf87-204ENST00000565112 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.25■■■■■ 4.19
C16orf87-204ENST00000565112 SYNJ1O43426 1573 aa41.2■■■■■ 4.19
C16orf87-204ENST00000565112 SYNJ2O15056 1496 aa41.2■■■■■ 4.19
C16orf87-204ENST00000565112 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.17■■■■■ 4.18
C16orf87-204ENST00000565112 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.15■■■■■ 4.18
C16orf87-204ENST00000565112 PBRM1Q86U86 1689 aa41.12■■■■■ 4.17
C16orf87-204ENST00000565112 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.12■■■■■ 4.17
C16orf87-204ENST00000565112 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.07■■■■■ 4.16
C16orf87-204ENST00000565112 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.04■■■■■ 4.16
C16orf87-204ENST00000565112 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.89■■■■■ 4.14
C16orf87-204ENST00000565112 TOP2BQ02880 1626 aa40.82■■■■■ 4.13
C16orf87-204ENST00000565112 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.82■■■■■ 4.13
C16orf87-204ENST00000565112 GRIN2AQ12879 1464 aa40.8■■■■■ 4.12
C16orf87-204ENST00000565112 ADAMTS12P58397 1594 aa40.77■■■■■ 4.12
C16orf87-204ENST00000565112 NUP160Q12769 1436 aa40.69■■■■■ 4.1
C16orf87-204ENST00000565112 CEP170Q5SW79 1584 aa40.68■■■■■ 4.1
C16orf87-204ENST00000565112 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.67■■■■■ 4.1
C16orf87-204ENST00000565112 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.62■■■■■ 4.09
C16orf87-204ENST00000565112 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.57■■■■■ 4.09
C16orf87-204ENST00000565112 SHROOM2Q13796 1616 aa40.51■■■■■ 4.08
C16orf87-204ENST00000565112 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.27■■■■■ 4.04
C16orf87-204ENST00000565112 JPH4Q96JJ6 628 aa40.21■■■■■ 4.03
C16orf87-204ENST00000565112 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.21■■■■■ 4.03
C16orf87-204ENST00000565112 IGF1RP08069 1367 aa40.05■■■■■ 4
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