RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564822.1

RNPS1-212, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 4

Gene RNPS1, Length 314 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-212ENST00000564822 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.35■■■■■ 5.65
RNPS1-212ENST00000564822 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.8■■■■■ 4.76
RNPS1-212ENST00000564822 ABCC9O60706 1549 aa43.78■■■■■ 4.6
RNPS1-212ENST00000564822 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.14■■■■■ 4.34
RNPS1-212ENST00000564822 NACADO15069 1562 aa42.09■■■■■ 4.33
RNPS1-212ENST00000564822 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.97■■■■■ 4.31
RNPS1-212ENST00000564822 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.96■■■■■ 4.31
RNPS1-212ENST00000564822 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.85■■■■■ 4.29
RNPS1-212ENST00000564822 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.68■■■■■ 4.26
RNPS1-212ENST00000564822 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.23■■■■■ 4.19
RNPS1-212ENST00000564822 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.9■■■■■ 4.14
RNPS1-212ENST00000564822 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.88■■■■■ 4.13
RNPS1-212ENST00000564822 SCRIBQ14160 1630 aa40.85■■■■■ 4.13
RNPS1-212ENST00000564822 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.45■■■■■ 4.07
RNPS1-212ENST00000564822 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.18■■■■■ 4.02
RNPS1-212ENST00000564822 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.8■■■■□ 3.96
RNPS1-212ENST00000564822 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.63■■■■□ 3.93
RNPS1-212ENST00000564822 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.34■■■■□ 3.89
RNPS1-212ENST00000564822 SMARCA4P51532 1647 aa39.09■■■■□ 3.85
RNPS1-212ENST00000564822 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.03■■■■□ 3.84
RNPS1-212ENST00000564822 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.86■■■■□ 3.81
RNPS1-212ENST00000564822 NCAPD3P42695 1498 aa38.83■■■■□ 3.81
RNPS1-212ENST00000564822 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.82■■■■□ 3.8
RNPS1-212ENST00000564822 SMARCA2P51531 1590 aa38.81■■■■□ 3.8
RNPS1-212ENST00000564822 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.72■■■■□ 3.79
RNPS1-212ENST00000564822 HMGXB3Q12766 1538 aa38.67■■■■□ 3.78
RNPS1-212ENST00000564822 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.53■■■■□ 3.76
RNPS1-212ENST00000564822 WIZO95785 1651 aa38.39■■■■□ 3.74
RNPS1-212ENST00000564822 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.35■■■■□ 3.73
RNPS1-212ENST00000564822 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.99■■■■□ 3.67
RNPS1-212ENST00000564822 NESP48681 1621 aa37.9■■■■□ 3.66
RNPS1-212ENST00000564822 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.82■■■■□ 3.65
RNPS1-212ENST00000564822 ERCC6Q03468 1493 aa37.72■■■■□ 3.63
RNPS1-212ENST00000564822 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.68■■■■□ 3.62
RNPS1-212ENST00000564822 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.53■■■■□ 3.6
RNPS1-212ENST00000564822 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.52■■■■□ 3.6
RNPS1-212ENST00000564822 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.49■■■■□ 3.59
RNPS1-212ENST00000564822 CFTRP13569 1480 aa37.48■■■■□ 3.59
RNPS1-212ENST00000564822 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.37■■■■□ 3.57
RNPS1-212ENST00000564822 CUX2O14529 1486 aa37.35■■■■□ 3.57
RNPS1-212ENST00000564822 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.31■■■■□ 3.56
RNPS1-212ENST00000564822 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.26■■■■□ 3.56
RNPS1-212ENST00000564822 PRDM2Q13029 1718 aa37.24■■■■□ 3.55
RNPS1-212ENST00000564822 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.22■■■■□ 3.55
RNPS1-212ENST00000564822 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.17■■■■□ 3.54
RNPS1-212ENST00000564822 WDR62O43379 1518 aa37.07■■■■□ 3.53
RNPS1-212ENST00000564822 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.91■■■■□ 3.5
RNPS1-212ENST00000564822 TOPBP1Q92547 1522 aa36.68■■■■□ 3.46
RNPS1-212ENST00000564822 ABCC8Q09428 1581 aa36.65■■■■□ 3.46
RNPS1-212ENST00000564822 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.65■■■■□ 3.46
RNPS1-212ENST00000564822 IFT140Q96RY7 1462 aa36.44■■■■□ 3.42
RNPS1-212ENST00000564822 CUX1P39880 1505 aa36.41■■■■□ 3.42
RNPS1-212ENST00000564822 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.37■■■■□ 3.41
RNPS1-212ENST00000564822 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.3■■■■□ 3.4
RNPS1-212ENST00000564822 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.29■■■■□ 3.4
RNPS1-212ENST00000564822 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.28■■■■□ 3.4
RNPS1-212ENST00000564822 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.2■■■■□ 3.39
RNPS1-212ENST00000564822 SOGA1O94964 1423 aa36.18■■■■□ 3.38
RNPS1-212ENST00000564822 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.17■■■■□ 3.38
RNPS1-212ENST00000564822 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.17■■■■□ 3.38
RNPS1-212ENST00000564822 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.16■■■■□ 3.38
RNPS1-212ENST00000564822 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.12■■■■□ 3.37
RNPS1-212ENST00000564822 TOP2BQ02880 1626 aa36.1■■■■□ 3.37
RNPS1-212ENST00000564822 SYNJ1O43426 1573 aa36.1■■■■□ 3.37
RNPS1-212ENST00000564822 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.06■■■■□ 3.361e-6■■■■■ 33.8
RNPS1-212ENST00000564822 WDR97A6NE52 1622 aa36.03■■■■□ 3.36
RNPS1-212ENST00000564822 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.99■■■■□ 3.35
RNPS1-212ENST00000564822 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.93■■■■□ 3.34
RNPS1-212ENST00000564822 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.82■■■■□ 3.32
RNPS1-212ENST00000564822 GRIN2BQ13224 1484 aa35.79■■■■□ 3.32
RNPS1-212ENST00000564822 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.79■■■■□ 3.32
RNPS1-212ENST00000564822 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.75■■■■□ 3.31
RNPS1-212ENST00000564822 OSCARQ8IYS5 282 aa35.75■■■■□ 3.31
RNPS1-212ENST00000564822 PBRM1Q86U86 1689 aa35.75■■■■□ 3.31
RNPS1-212ENST00000564822 CHD1O14646 1710 aa35.71■■■■□ 3.31
RNPS1-212ENST00000564822 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.7■■■■□ 3.31
RNPS1-212ENST00000564822 FBLN2P98095 1184 aa35.57■■■■□ 3.28
RNPS1-212ENST00000564822 SYNJ2O15056 1496 aa35.56■■■■□ 3.28
RNPS1-212ENST00000564822 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.5■■■■□ 3.27
RNPS1-212ENST00000564822 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.49■■■■□ 3.27
RNPS1-212ENST00000564822 ADAMTS12P58397 1594 aa35.47■■■■□ 3.27
RNPS1-212ENST00000564822 KIF27Q86VH2 1401 aa35.39■■■■□ 3.26
RNPS1-212ENST00000564822 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.37■■■■□ 3.25
RNPS1-212ENST00000564822 GRIN2AQ12879 1464 aa35.34■■■■□ 3.25
RNPS1-212ENST00000564822 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.32■■■■□ 3.25
RNPS1-212ENST00000564822 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.25■■■■□ 3.23
RNPS1-212ENST00000564822 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.25■■■■□ 3.23
RNPS1-212ENST00000564822 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.25■■■■□ 3.23
RNPS1-212ENST00000564822 ARHGEF11O15085 1522 aa35.24■■■■□ 3.23
RNPS1-212ENST00000564822 IGF1RP08069 1367 aa35.24■■■■□ 3.23
RNPS1-212ENST00000564822 TRIM41Q8WV44 630 aa35.23■■■■□ 3.23
RNPS1-212ENST00000564822 NUP160Q12769 1436 aa35.19■■■■□ 3.22
RNPS1-212ENST00000564822 CUL7Q14999 1698 aa35.19■■■■□ 3.22
RNPS1-212ENST00000564822 CEP170Q5SW79 1584 aa35.18■■■■□ 3.22
RNPS1-212ENST00000564822 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.09■■■■□ 3.21
RNPS1-212ENST00000564822 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.02■■■■□ 3.2
RNPS1-212ENST00000564822 ARAP1Q96P48 1450 aa34.97■■■■□ 3.19
RNPS1-212ENST00000564822 SHROOM2Q13796 1616 aa34.94■■■■□ 3.18
RNPS1-212ENST00000564822 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.84■■■■□ 3.17
RNPS1-212ENST00000564822 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.84■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93.6 ms