RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564160.1

ERVK13-1-202, Transcript of endogenous retrovirus group K13 member 1, humanhuman

TSL 3

Gene ERVK13-1, Length 983 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1-202ENST00000564160 NISCHQ9Y2I1 1504 aa66.03■■■■■ 8.16
ERVK13-1-202ENST00000564160 ABCC9O60706 1549 aa59.43■■■■■ 7.1
ERVK13-1-202ENST00000564160 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa59.34■■■■■ 7.09
ERVK13-1-202ENST00000564160 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa56.5■■■■■ 6.64
ERVK13-1-202ENST00000564160 NACADO15069 1562 aa56.1■■■■■ 6.57
ERVK13-1-202ENST00000564160 DNAJC5BQ9UF47 199 aa55.93■■■■■ 6.54
ERVK13-1-202ENST00000564160 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.63■■■■■ 6.5
ERVK13-1-202ENST00000564160 UNC13AQ9UPW8 1703 aa55.35■■■■■ 6.45
ERVK13-1-202ENST00000564160 MYO15BQ96JP2 1530 aa55.31■■■■■ 6.45
ERVK13-1-202ENST00000564160 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP55.27■■■■■ 6.44
ERVK13-1-202ENST00000564160 BICRAQ9NZM4 1560 aa54.97■■■■■ 6.39
ERVK13-1-202ENST00000564160 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.71■■■■■ 6.35
ERVK13-1-202ENST00000564160 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.55■■■■■ 6.32
ERVK13-1-202ENST00000564160 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa54.13■■■■■ 6.26
ERVK13-1-202ENST00000564160 SCRIBQ14160 1630 aa54.02■■■■■ 6.24
ERVK13-1-202ENST00000564160 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa53.71■■■■■ 6.19
ERVK13-1-202ENST00000564160 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP53.57■■■■■ 6.17
ERVK13-1-202ENST00000564160 CECR2Q9BXF3 1484 aa53.54■■■■■ 6.16
ERVK13-1-202ENST00000564160 NCAPD3P42695 1498 aa51.8■■■■■ 5.88
ERVK13-1-202ENST00000564160 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51.63■■■■■ 5.86
ERVK13-1-202ENST00000564160 SMARCA4P51532 1647 aa51.56■■■■■ 5.84
ERVK13-1-202ENST00000564160 SMARCA2P51531 1590 aa51.45■■■■■ 5.83
ERVK13-1-202ENST00000564160 HMGXB3Q12766 1538 aa51.42■■■■■ 5.82
ERVK13-1-202ENST00000564160 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa51.41■■■■■ 5.82
ERVK13-1-202ENST00000564160 CUX2O14529 1486 aa51.29■■■■■ 5.8
ERVK13-1-202ENST00000564160 ERCC6Q03468 1493 aa51.26■■■■■ 5.8
ERVK13-1-202ENST00000564160 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP51.23■■■■■ 5.79
ERVK13-1-202ENST00000564160 PEG3Q9GZU2 1588 aa51.08■■■■■ 5.77
ERVK13-1-202ENST00000564160 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP51.07■■■■■ 5.77
ERVK13-1-202ENST00000564160 NESP48681 1621 aa51.05■■■■■ 5.76
ERVK13-1-202ENST00000564160 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.89■■■■■ 5.74
ERVK13-1-202ENST00000564160 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa50.65■■■■■ 5.7
ERVK13-1-202ENST00000564160 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP50.6■■■■■ 5.69
ERVK13-1-202ENST00000564160 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa50.41■■■■■ 5.66
ERVK13-1-202ENST00000564160 PDS5BQ9NTI5 1447 aa50.3■■■■■ 5.64
ERVK13-1-202ENST00000564160 WIZO95785 1651 aa50.28■■■■■ 5.64
ERVK13-1-202ENST00000564160 CADPSQ9ULU8 1353 aa50.19■■■■■ 5.63
ERVK13-1-202ENST00000564160 MRC2Q9UBG0 1479 aa49.92■■■■■ 5.58
ERVK13-1-202ENST00000564160 WDR62O43379 1518 aa49.85■■■■■ 5.57
ERVK13-1-202ENST00000564160 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.77■■■■■ 5.56
ERVK13-1-202ENST00000564160 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.68■■■■■ 5.54
ERVK13-1-202ENST00000564160 CFTRP13569 1480 aa49.63■■■■■ 5.53
ERVK13-1-202ENST00000564160 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.63■■■■■ 5.53
ERVK13-1-202ENST00000564160 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.61■■■■■ 5.53
ERVK13-1-202ENST00000564160 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP49.27■■■■■ 5.48
ERVK13-1-202ENST00000564160 PRDM2Q13029 1718 aa49.16■■■■■ 5.46
ERVK13-1-202ENST00000564160 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.05■■■■■ 5.44
ERVK13-1-202ENST00000564160 TRIM41Q8WV44 630 aa49.02■■■■■ 5.44
ERVK13-1-202ENST00000564160 OSCARQ8IYS5 282 aa48.85■■■■■ 5.41
ERVK13-1-202ENST00000564160 TOPBP1Q92547 1522 aa48.7■■■■■ 5.39
ERVK13-1-202ENST00000564160 IFT140Q96RY7 1462 aa48.69■■■■■ 5.39
ERVK13-1-202ENST00000564160 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP48.68■■■■■ 5.38
ERVK13-1-202ENST00000564160 ABCC8Q09428 1581 aa48.53■■■■■ 5.36
ERVK13-1-202ENST00000564160 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.5■■■■■ 5.35
ERVK13-1-202ENST00000564160 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP48.4■■■■■ 5.34
ERVK13-1-202ENST00000564160 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa48.33■■■■■ 5.33
ERVK13-1-202ENST00000564160 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa48.33■■■■■ 5.33
ERVK13-1-202ENST00000564160 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa48.33■■■■■ 5.33
ERVK13-1-202ENST00000564160 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP48.32■■■■■ 5.33
ERVK13-1-202ENST00000564160 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP48.19■■■■■ 5.311e-6■■■■■ 33.8
ERVK13-1-202ENST00000564160 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP48.19■■■■■ 5.31
ERVK13-1-202ENST00000564160 ARHGEF11O15085 1522 aa48.15■■■■■ 5.3
ERVK13-1-202ENST00000564160 CHD1O14646 1710 aa48.09■■■■■ 5.29
ERVK13-1-202ENST00000564160 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa48.01■■■■■ 5.28
ERVK13-1-202ENST00000564160 SOGA1O94964 1423 aa47.92■■■■■ 5.26
ERVK13-1-202ENST00000564160 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.85■■■■■ 5.25
ERVK13-1-202ENST00000564160 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.85■■■■■ 5.25
ERVK13-1-202ENST00000564160 CUX1P39880 1505 aa47.82■■■■■ 5.25
ERVK13-1-202ENST00000564160 FBLN2P98095 1184 aa47.79■■■■■ 5.24
ERVK13-1-202ENST00000564160 WDR97A6NE52 1622 aa47.78■■■■■ 5.24
ERVK13-1-202ENST00000564160 CYB5RLQ6IPT4 315 aa47.72■■■■■ 5.23
ERVK13-1-202ENST00000564160 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.7■■■■■ 5.23
ERVK13-1-202ENST00000564160 ARAP1Q96P48 1450 aa47.69■■■■■ 5.22
ERVK13-1-202ENST00000564160 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.56■■■■■ 5.2
ERVK13-1-202ENST00000564160 CLASP1Q7Z460 1538 aa47.55■■■■■ 5.2
ERVK13-1-202ENST00000564160 GRIN2BQ13224 1484 aa47.53■■■■■ 5.2
ERVK13-1-202ENST00000564160 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP47.44■■■■■ 5.18
ERVK13-1-202ENST00000564160 SYNJ1O43426 1573 aa47.43■■■■■ 5.18
ERVK13-1-202ENST00000564160 SYNJ2O15056 1496 aa47.4■■■■■ 5.18
ERVK13-1-202ENST00000564160 PBRM1Q86U86 1689 aa47.39■■■■■ 5.18
ERVK13-1-202ENST00000564160 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.35■■■■■ 5.17
ERVK13-1-202ENST00000564160 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.33■■■■■ 5.17
ERVK13-1-202ENST00000564160 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.31■■■■■ 5.16
ERVK13-1-202ENST00000564160 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.29■■■■■ 5.16
ERVK13-1-202ENST00000564160 TRHP20396 242 aaPredicted RBP47.18■■■■■ 5.14
ERVK13-1-202ENST00000564160 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.04■■■■■ 5.12
ERVK13-1-202ENST00000564160 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.04■■■■■ 5.12
ERVK13-1-202ENST00000564160 TOP2BQ02880 1626 aa47.01■■■■■ 5.12
ERVK13-1-202ENST00000564160 GRIN2AQ12879 1464 aa46.95■■■■■ 5.11
ERVK13-1-202ENST00000564160 ADAMTS12P58397 1594 aa46.93■■■■■ 5.1
ERVK13-1-202ENST00000564160 CEP170Q5SW79 1584 aa46.82■■■■■ 5.09
ERVK13-1-202ENST00000564160 NUP160Q12769 1436 aa46.82■■■■■ 5.09
ERVK13-1-202ENST00000564160 ERCC6L2Q5T890 1561 aa46.81■■■■■ 5.08
ERVK13-1-202ENST00000564160 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.74■■■■■ 5.07
ERVK13-1-202ENST00000564160 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.71■■■■■ 5.07
ERVK13-1-202ENST00000564160 SHROOM2Q13796 1616 aa46.66■■■■■ 5.06
ERVK13-1-202ENST00000564160 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP46.32■■■■■ 5.01
ERVK13-1-202ENST00000564160 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa46.28■■■■■ 5
ERVK13-1-202ENST00000564160 JPH4Q96JJ6 628 aa46.26■■■■■ 5
ERVK13-1-202ENST00000564160 KIF13AQ9H1H9 1805 aa46.12■■■■■ 4.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.4 ms