RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564066.1

LINGO1-208, Transcript of leucine rich repeat and Ig domain containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene LINGO1, Length 569 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO1-208ENST00000564066 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.54■■■■■ 6.64
LINGO1-208ENST00000564066 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.03■■■■■ 5.6
LINGO1-208ENST00000564066 ABCC9O60706 1549 aa47.88■■■■■ 5.26
LINGO1-208ENST00000564066 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.3■■■■■ 5.16
LINGO1-208ENST00000564066 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.94■■■■■ 5.1
LINGO1-208ENST00000564066 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.84■■■■■ 5.09
LINGO1-208ENST00000564066 NACADO15069 1562 aa46.78■■■■■ 5.08
LINGO1-208ENST00000564066 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.69■■■■■ 5.06
LINGO1-208ENST00000564066 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.61■■■■■ 5.05
LINGO1-208ENST00000564066 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.55■■■■■ 4.88
LINGO1-208ENST00000564066 SCRIBQ14160 1630 aa45.54■■■■■ 4.88
LINGO1-208ENST00000564066 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.09■■■■■ 4.81
LINGO1-208ENST00000564066 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.98■■■■■ 4.79
LINGO1-208ENST00000564066 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.79■■■■■ 4.76
LINGO1-208ENST00000564066 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.84■■■■■ 4.61
LINGO1-208ENST00000564066 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.83■■■■■ 4.61
LINGO1-208ENST00000564066 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.82■■■■■ 4.61
LINGO1-208ENST00000564066 SMARCA4P51532 1647 aa43.71■■■■■ 4.59
LINGO1-208ENST00000564066 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.53■■■■■ 4.56
LINGO1-208ENST00000564066 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.44■■■■■ 4.54
LINGO1-208ENST00000564066 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.35■■■■■ 4.53
LINGO1-208ENST00000564066 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.33■■■■■ 4.53
LINGO1-208ENST00000564066 SMARCA2P51531 1590 aa43.3■■■■■ 4.52
LINGO1-208ENST00000564066 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.21■■■■■ 4.51
LINGO1-208ENST00000564066 WIZO95785 1651 aa43.12■■■■■ 4.49
LINGO1-208ENST00000564066 NCAPD3P42695 1498 aa43.1■■■■■ 4.49
LINGO1-208ENST00000564066 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.04■■■■■ 4.48
LINGO1-208ENST00000564066 HMGXB3Q12766 1538 aa43.03■■■■■ 4.48
LINGO1-208ENST00000564066 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.93■■■■■ 4.46
LINGO1-208ENST00000564066 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.78■■■■■ 4.44
LINGO1-208ENST00000564066 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.77■■■■■ 4.44
LINGO1-208ENST00000564066 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.19■■■■■ 4.34
LINGO1-208ENST00000564066 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.88■■■■■ 4.3
LINGO1-208ENST00000564066 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.85■■■■■ 4.29
LINGO1-208ENST00000564066 CFTRP13569 1480 aa41.81■■■■■ 4.28
LINGO1-208ENST00000564066 PRDM2Q13029 1718 aa41.72■■■■■ 4.27
LINGO1-208ENST00000564066 NESP48681 1621 aa41.67■■■■■ 4.26
LINGO1-208ENST00000564066 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.52■■■■■ 4.24
LINGO1-208ENST00000564066 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.37■■■■■ 4.21
LINGO1-208ENST00000564066 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.33■■■■■ 4.21
LINGO1-208ENST00000564066 ERCC6Q03468 1493 aa41.28■■■■■ 4.2
LINGO1-208ENST00000564066 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.28■■■■■ 4.2
LINGO1-208ENST00000564066 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.02■■■■■ 4.16
LINGO1-208ENST00000564066 ABCC8Q09428 1581 aa40.98■■■■■ 4.15
LINGO1-208ENST00000564066 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.98■■■■■ 4.15
LINGO1-208ENST00000564066 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.9■■■■■ 4.14
LINGO1-208ENST00000564066 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.89■■■■■ 4.14
LINGO1-208ENST00000564066 WDR62O43379 1518 aa40.88■■■■■ 4.14
LINGO1-208ENST00000564066 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.88■■■■■ 4.13
LINGO1-208ENST00000564066 TOPBP1Q92547 1522 aa40.82■■■■■ 4.12
LINGO1-208ENST00000564066 CUX1P39880 1505 aa40.8■■■■■ 4.12
LINGO1-208ENST00000564066 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.78■■■■■ 4.12
LINGO1-208ENST00000564066 TOP2BQ02880 1626 aa40.76■■■■■ 4.12
LINGO1-208ENST00000564066 SYNJ1O43426 1573 aa40.71■■■■■ 4.11
LINGO1-208ENST00000564066 CUX2O14529 1486 aa40.6■■■■■ 4.09
LINGO1-208ENST00000564066 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.53■■■■■ 4.08
LINGO1-208ENST00000564066 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.51■■■■■ 4.08
LINGO1-208ENST00000564066 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.48■■■■■ 4.07
LINGO1-208ENST00000564066 TRIM41Q8WV44 630 aa40.45■■■■■ 4.07
LINGO1-208ENST00000564066 IFT140Q96RY7 1462 aa40.39■■■■■ 4.06
LINGO1-208ENST00000564066 SOGA1O94964 1423 aa40.34■■■■■ 4.05
LINGO1-208ENST00000564066 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.33■■■■■ 4.05
LINGO1-208ENST00000564066 WDR97A6NE52 1622 aa40.25■■■■■ 4.03
LINGO1-208ENST00000564066 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.25■■■■■ 4.03
LINGO1-208ENST00000564066 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.24■■■■■ 4.03
LINGO1-208ENST00000564066 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.02■■■■■ 4
LINGO1-208ENST00000564066 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.01■■■■□ 3.99
LINGO1-208ENST00000564066 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40■■■■□ 3.99
LINGO1-208ENST00000564066 KIF27Q86VH2 1401 aa39.99■■■■□ 3.99
LINGO1-208ENST00000564066 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.95■■■■□ 3.99
LINGO1-208ENST00000564066 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.93■■■■□ 3.98
LINGO1-208ENST00000564066 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.88■■■■□ 3.98
LINGO1-208ENST00000564066 EEA1Q15075 1411 aa39.88■■■■□ 3.97
LINGO1-208ENST00000564066 PBRM1Q86U86 1689 aa39.86■■■■□ 3.97
LINGO1-208ENST00000564066 GRIN2BQ13224 1484 aa39.82■■■■□ 3.97
LINGO1-208ENST00000564066 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.81■■■■□ 3.96
LINGO1-208ENST00000564066 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.74■■■■□ 3.95
LINGO1-208ENST00000564066 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.67■■■■□ 3.94
LINGO1-208ENST00000564066 CUL7Q14999 1698 aa39.66■■■■□ 3.94
LINGO1-208ENST00000564066 IGF1RP08069 1367 aa39.65■■■■□ 3.94
LINGO1-208ENST00000564066 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.6■■■■□ 3.93
LINGO1-208ENST00000564066 ADAMTS12P58397 1594 aa39.56■■■■□ 3.92
LINGO1-208ENST00000564066 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.55■■■■□ 3.92
LINGO1-208ENST00000564066 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.52■■■■□ 3.92
LINGO1-208ENST00000564066 SYNJ2O15056 1496 aa39.47■■■■□ 3.91
LINGO1-208ENST00000564066 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.46■■■■□ 3.91
LINGO1-208ENST00000564066 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.46■■■■□ 3.91
LINGO1-208ENST00000564066 PRXQ9BXM0 1461 aa39.42■■■■□ 3.9
LINGO1-208ENST00000564066 KIF21BO75037 1637 aa39.37■■■■□ 3.89
LINGO1-208ENST00000564066 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.36■■■■□ 3.89
LINGO1-208ENST00000564066 CHD1O14646 1710 aa39.34■■■■□ 3.89
LINGO1-208ENST00000564066 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.31■■■■□ 3.88
LINGO1-208ENST00000564066 GRIN2AQ12879 1464 aa39.3■■■■□ 3.88
LINGO1-208ENST00000564066 FBLN2P98095 1184 aa39.21■■■■□ 3.87
LINGO1-208ENST00000564066 GOLGA3Q08378 1498 aa39.17■■■■□ 3.86
LINGO1-208ENST00000564066 NUP160Q12769 1436 aa39.1■■■■□ 3.85
LINGO1-208ENST00000564066 CEP170Q5SW79 1584 aa39.04■■■■□ 3.84
LINGO1-208ENST00000564066 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa39.03■■■■□ 3.84
LINGO1-208ENST00000564066 OSCARQ8IYS5 282 aa38.98■■■■□ 3.83
LINGO1-208ENST00000564066 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.95■■■■□ 3.83
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