RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563857.1

RNPS1-208, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 2

Gene RNPS1, Length 739 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-208ENST00000563857 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.91■■■■□ 3.82
RNPS1-208ENST00000563857 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.69■■■■□ 3.14
RNPS1-208ENST00000563857 ABCC9O60706 1549 aa33.98■■■■□ 3.03
RNPS1-208ENST00000563857 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.76■■■□□ 2.84
RNPS1-208ENST00000563857 NACADO15069 1562 aa32.7■■■□□ 2.83
RNPS1-208ENST00000563857 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.64■■■□□ 2.82
RNPS1-208ENST00000563857 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.51■■■□□ 2.79
RNPS1-208ENST00000563857 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.35■■■□□ 2.77
RNPS1-208ENST00000563857 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.28■■■□□ 2.76
RNPS1-208ENST00000563857 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.78■■■□□ 2.68
RNPS1-208ENST00000563857 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.74■■■□□ 2.67
RNPS1-208ENST00000563857 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.59■■■□□ 2.65
RNPS1-208ENST00000563857 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.53■■■□□ 2.64
RNPS1-208ENST00000563857 SCRIBQ14160 1630 aa31.51■■■□□ 2.63
RNPS1-208ENST00000563857 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.23■■■□□ 2.59
RNPS1-208ENST00000563857 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.84■■■□□ 2.53
RNPS1-208ENST00000563857 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.73■■■□□ 2.51
RNPS1-208ENST00000563857 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.62■■■□□ 2.49
RNPS1-208ENST00000563857 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.23■■■□□ 2.43
RNPS1-208ENST00000563857 SMARCA4P51532 1647 aa30.18■■■□□ 2.42
RNPS1-208ENST00000563857 NCAPD3P42695 1498 aa30.16■■■□□ 2.42
RNPS1-208ENST00000563857 SMARCA2P51531 1590 aa30.14■■■□□ 2.42
RNPS1-208ENST00000563857 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.09■■■□□ 2.41
RNPS1-208ENST00000563857 HMGXB3Q12766 1538 aa29.97■■■□□ 2.39
RNPS1-208ENST00000563857 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.94■■■□□ 2.38
RNPS1-208ENST00000563857 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.9■■■□□ 2.38
RNPS1-208ENST00000563857 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
RNPS1-208ENST00000563857 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
RNPS1-208ENST00000563857 WIZO95785 1651 aa29.54■■■□□ 2.32
RNPS1-208ENST00000563857 ERCC6Q03468 1493 aa29.42■■■□□ 2.3
RNPS1-208ENST00000563857 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.39■■■□□ 2.29
RNPS1-208ENST00000563857 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
RNPS1-208ENST00000563857 NESP48681 1621 aa29.3■■■□□ 2.28
RNPS1-208ENST00000563857 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.29■■■□□ 2.28
RNPS1-208ENST00000563857 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.28■■■□□ 2.28
RNPS1-208ENST00000563857 CUX2O14529 1486 aa29.19■■■□□ 2.26
RNPS1-208ENST00000563857 CFTRP13569 1480 aa29.04■■■□□ 2.24
RNPS1-208ENST00000563857 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.97■■■□□ 2.23
RNPS1-208ENST00000563857 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.95■■■□□ 2.22
RNPS1-208ENST00000563857 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
RNPS1-208ENST00000563857 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.91■■■□□ 2.22
RNPS1-208ENST00000563857 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.9■■■□□ 2.22
RNPS1-208ENST00000563857 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.89■■■□□ 2.22
RNPS1-208ENST00000563857 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.88■■■□□ 2.21
RNPS1-208ENST00000563857 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
RNPS1-208ENST00000563857 PRDM2Q13029 1718 aa28.75■■■□□ 2.19
RNPS1-208ENST00000563857 WDR62O43379 1518 aa28.74■■■□□ 2.19
RNPS1-208ENST00000563857 ABCC8Q09428 1581 aa28.58■■■□□ 2.17
RNPS1-208ENST00000563857 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
RNPS1-208ENST00000563857 TOPBP1Q92547 1522 aa28.39■■■□□ 2.14
RNPS1-208ENST00000563857 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.37■■■□□ 2.13
RNPS1-208ENST00000563857 IFT140Q96RY7 1462 aa28.34■■■□□ 2.13
RNPS1-208ENST00000563857 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
RNPS1-208ENST00000563857 SOGA1O94964 1423 aa28.1■■■□□ 2.09
RNPS1-208ENST00000563857 CUX1P39880 1505 aa28.07■■■□□ 2.08
RNPS1-208ENST00000563857 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
RNPS1-208ENST00000563857 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
RNPS1-208ENST00000563857 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.04■■■□□ 2.08
RNPS1-208ENST00000563857 OSCARQ8IYS5 282 aa28.02■■■□□ 2.08
RNPS1-208ENST00000563857 WDR97A6NE52 1622 aa28■■■□□ 2.07
RNPS1-208ENST00000563857 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.96■■■□□ 2.07
RNPS1-208ENST00000563857 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
RNPS1-208ENST00000563857 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.95■■■□□ 2.07
RNPS1-208ENST00000563857 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.93■■■□□ 2.061e-6■■■■■ 33.8
RNPS1-208ENST00000563857 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
RNPS1-208ENST00000563857 TOP2BQ02880 1626 aa27.86■■■□□ 2.05
RNPS1-208ENST00000563857 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.83■■■□□ 2.05
RNPS1-208ENST00000563857 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.82■■■□□ 2.04
RNPS1-208ENST00000563857 GRIN2BQ13224 1484 aa27.8■■■□□ 2.04
RNPS1-208ENST00000563857 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.76■■■□□ 2.03
RNPS1-208ENST00000563857 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
RNPS1-208ENST00000563857 FBLN2P98095 1184 aa27.74■■■□□ 2.03
RNPS1-208ENST00000563857 SYNJ1O43426 1573 aa27.73■■■□□ 2.03
RNPS1-208ENST00000563857 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
RNPS1-208ENST00000563857 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.69■■■□□ 2.02
RNPS1-208ENST00000563857 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.63■■■□□ 2.01
RNPS1-208ENST00000563857 SYNJ2O15056 1496 aa27.62■■■□□ 2.01
RNPS1-208ENST00000563857 CHD1O14646 1710 aa27.61■■■□□ 2.01
RNPS1-208ENST00000563857 PBRM1Q86U86 1689 aa27.59■■■□□ 2.01
RNPS1-208ENST00000563857 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.51■■■□□ 2
RNPS1-208ENST00000563857 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.47■■□□□ 1.99
RNPS1-208ENST00000563857 KIF27Q86VH2 1401 aa27.45■■□□□ 1.98
RNPS1-208ENST00000563857 ADAMTS12P58397 1594 aa27.39■■□□□ 1.98
RNPS1-208ENST00000563857 TRIM41Q8WV44 630 aa27.39■■□□□ 1.98
RNPS1-208ENST00000563857 ARHGEF11O15085 1522 aa27.39■■□□□ 1.98
RNPS1-208ENST00000563857 GRIN2AQ12879 1464 aa27.38■■□□□ 1.97
RNPS1-208ENST00000563857 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.38■■□□□ 1.97
RNPS1-208ENST00000563857 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.38■■□□□ 1.97
RNPS1-208ENST00000563857 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.38■■□□□ 1.97
RNPS1-208ENST00000563857 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.36■■□□□ 1.97
RNPS1-208ENST00000563857 NUP160Q12769 1436 aa27.27■■□□□ 1.96
RNPS1-208ENST00000563857 IGF1RP08069 1367 aa27.27■■□□□ 1.96
RNPS1-208ENST00000563857 CUL7Q14999 1698 aa27.23■■□□□ 1.95
RNPS1-208ENST00000563857 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.22■■□□□ 1.95
RNPS1-208ENST00000563857 CEP170Q5SW79 1584 aa27.16■■□□□ 1.94
RNPS1-208ENST00000563857 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.15■■□□□ 1.94
RNPS1-208ENST00000563857 ARAP1Q96P48 1450 aa27.13■■□□□ 1.93
RNPS1-208ENST00000563857 JPH4Q96JJ6 628 aa27.08■■□□□ 1.93
RNPS1-208ENST00000563857 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.04■■□□□ 1.92
RNPS1-208ENST00000563857 SHROOM2Q13796 1616 aa27.04■■□□□ 1.92
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