RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563783.5

SPG7-208, Transcript of SPG7, paraplegin matrix AAA peptidase subunit, humanhuman

TSL 3

Gene SPG7, Length 573 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG7-208ENST00000563783 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.67■■■■■ 7.62
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SPG7-208ENST00000563783 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.21■■■■■ 6.11
SPG7-208ENST00000563783 NACADO15069 1562 aa53■■■■■ 6.07
SPG7-208ENST00000563783 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.55■■■■■ 6
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SPG7-208ENST00000563783 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.98■■■■■ 5.91
SPG7-208ENST00000563783 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.57■■■■■ 5.85
SPG7-208ENST00000563783 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.56■■■■■ 5.84
SPG7-208ENST00000563783 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.54■■■■■ 5.84
SPG7-208ENST00000563783 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.21■■■■■ 5.79
SPG7-208ENST00000563783 SCRIBQ14160 1630 aa50.98■■■■■ 5.75
SPG7-208ENST00000563783 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.28■■■■■ 5.64
SPG7-208ENST00000563783 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.25■■■■■ 5.63
SPG7-208ENST00000563783 CECR2Q9BXF3 1484 aa50■■■■■ 5.59
SPG7-208ENST00000563783 NCAPD3P42695 1498 aa48.87■■■■■ 5.41
SPG7-208ENST00000563783 SMARCA4P51532 1647 aa48.81■■■■■ 5.4
SPG7-208ENST00000563783 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.71■■■■■ 5.39
SPG7-208ENST00000563783 SMARCA2P51531 1590 aa48.71■■■■■ 5.39
SPG7-208ENST00000563783 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.68■■■■■ 5.38
SPG7-208ENST00000563783 HMGXB3Q12766 1538 aa48.61■■■■■ 5.37
SPG7-208ENST00000563783 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.47■■■■■ 5.35
SPG7-208ENST00000563783 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.26■■■■■ 5.32
SPG7-208ENST00000563783 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.2■■■■■ 5.31
SPG7-208ENST00000563783 ERCC6Q03468 1493 aa47.91■■■■■ 5.26
SPG7-208ENST00000563783 CUX2O14529 1486 aa47.85■■■■■ 5.25
SPG7-208ENST00000563783 NESP48681 1621 aa47.75■■■■■ 5.23
SPG7-208ENST00000563783 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.74■■■■■ 5.23
SPG7-208ENST00000563783 WIZO95785 1651 aa47.64■■■■■ 5.22
SPG7-208ENST00000563783 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.39■■■■■ 5.18
SPG7-208ENST00000563783 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.38■■■■■ 5.17
SPG7-208ENST00000563783 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.37■■■■■ 5.17
SPG7-208ENST00000563783 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.34■■■■■ 5.17
SPG7-208ENST00000563783 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.29■■■■■ 5.16
SPG7-208ENST00000563783 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.19■■■■■ 5.14
SPG7-208ENST00000563783 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.18■■■■■ 5.14
SPG7-208ENST00000563783 CFTRP13569 1480 aa46.94■■■■■ 5.1
SPG7-208ENST00000563783 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.93■■■■■ 5.1
SPG7-208ENST00000563783 WDR62O43379 1518 aa46.84■■■■■ 5.09
SPG7-208ENST00000563783 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.82■■■■■ 5.09
SPG7-208ENST00000563783 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.77■■■■■ 5.08
SPG7-208ENST00000563783 PRDM2Q13029 1718 aa46.65■■■■■ 5.06
SPG7-208ENST00000563783 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.54■■■■■ 5.04
SPG7-208ENST00000563783 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.34■■■■■ 5.01
SPG7-208ENST00000563783 ABCC8Q09428 1581 aa46.03■■■■■ 4.96
SPG7-208ENST00000563783 TOPBP1Q92547 1522 aa45.96■■■■■ 4.95
SPG7-208ENST00000563783 IFT140Q96RY7 1462 aa45.9■■■■■ 4.94
SPG7-208ENST00000563783 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.88■■■■■ 4.94
SPG7-208ENST00000563783 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.63■■■■■ 4.9
SPG7-208ENST00000563783 OSCARQ8IYS5 282 aa45.59■■■■■ 4.89
SPG7-208ENST00000563783 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.57■■■■■ 4.89
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SPG7-208ENST00000563783 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.5■■■■■ 4.87
SPG7-208ENST00000563783 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.34■■■■■ 4.85
SPG7-208ENST00000563783 WDR97A6NE52 1622 aa45.33■■■■■ 4.85
SPG7-208ENST00000563783 CUX1P39880 1505 aa45.29■■■■■ 4.84
SPG7-208ENST00000563783 SOGA1O94964 1423 aa45.26■■■■■ 4.84
SPG7-208ENST00000563783 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.26■■■■■ 4.845e-6■■■■□ 23.9
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SPG7-208ENST00000563783 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.21■■■■■ 4.83
SPG7-208ENST00000563783 CHD1O14646 1710 aa45.11■■■■■ 4.81
SPG7-208ENST00000563783 TRIM41Q8WV44 630 aa45.06■■■■■ 4.8
SPG7-208ENST00000563783 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.03■■■■■ 4.8
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SPG7-208ENST00000563783 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.98■■■■■ 4.79
SPG7-208ENST00000563783 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.98■■■■■ 4.79
SPG7-208ENST00000563783 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.92■■■■■ 4.78
SPG7-208ENST00000563783 GRIN2BQ13224 1484 aa44.9■■■■■ 4.78
SPG7-208ENST00000563783 ARHGEF11O15085 1522 aa44.9■■■■■ 4.78
SPG7-208ENST00000563783 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.87■■■■■ 4.77
SPG7-208ENST00000563783 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.86■■■■■ 4.77
SPG7-208ENST00000563783 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.8■■■■■ 4.76
SPG7-208ENST00000563783 PBRM1Q86U86 1689 aa44.78■■■■■ 4.76
SPG7-208ENST00000563783 TOP2BQ02880 1626 aa44.78■■■■■ 4.76
SPG7-208ENST00000563783 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.77■■■■■ 4.76
SPG7-208ENST00000563783 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.77■■■■■ 4.76
SPG7-208ENST00000563783 FBLN2P98095 1184 aa44.76■■■■■ 4.76
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SPG7-208ENST00000563783 SYNJ1O43426 1573 aa44.66■■■■■ 4.74
SPG7-208ENST00000563783 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.64■■■■■ 4.74
SPG7-208ENST00000563783 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.63■■■■■ 4.74
SPG7-208ENST00000563783 ARAP1Q96P48 1450 aa44.46■■■■■ 4.71
SPG7-208ENST00000563783 ADAMTS12P58397 1594 aa44.37■■■■■ 4.69
SPG7-208ENST00000563783 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.36■■■■■ 4.69
SPG7-208ENST00000563783 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.35■■■■■ 4.69
SPG7-208ENST00000563783 GRIN2AQ12879 1464 aa44.31■■■■■ 4.68
SPG7-208ENST00000563783 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.24■■■■■ 4.67
SPG7-208ENST00000563783 NUP160Q12769 1436 aa44.18■■■■■ 4.66
SPG7-208ENST00000563783 CEP170Q5SW79 1584 aa44.09■■■■■ 4.65
SPG7-208ENST00000563783 SHROOM2Q13796 1616 aa44■■■■■ 4.63
SPG7-208ENST00000563783 KIF27Q86VH2 1401 aa43.86■■■■■ 4.61
SPG7-208ENST00000563783 CUL7Q14999 1698 aa43.81■■■■■ 4.6
SPG7-208ENST00000563783 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.8■■■■■ 4.6
SPG7-208ENST00000563783 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.73■■■■■ 4.59
SPG7-208ENST00000563783 IGF1RP08069 1367 aa43.73■■■■■ 4.59
SPG7-208ENST00000563783 TRHP20396 242 aaPredicted RBP43.69■■■■■ 4.58
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