RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563336.1

PRSS54-203, Transcript of serine protease 54, humanhuman

TSL 3

Gene PRSS54, Length 434 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRSS54-203ENST00000563336 NISCHQ9Y2I1 1504 aa27.23■■□□□ 1.95
PRSS54-203ENST00000563336 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa24.39■■□□□ 1.5
PRSS54-203ENST00000563336 ABCC9O60706 1549 aa24.14■■□□□ 1.45
PRSS54-203ENST00000563336 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.13■■□□□ 1.29
PRSS54-203ENST00000563336 NACADO15069 1562 aa23.05■■□□□ 1.28
PRSS54-203ENST00000563336 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.86■■□□□ 1.25
PRSS54-203ENST00000563336 DCAF8L2P0C7V8 631 aa22.77■■□□□ 1.24
PRSS54-203ENST00000563336 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
PRSS54-203ENST00000563336 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.58■■□□□ 1.21
PRSS54-203ENST00000563336 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.58■■□□□ 1.21
PRSS54-203ENST00000563336 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.56■■□□□ 1.2
PRSS54-203ENST00000563336 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP22.49■■□□□ 1.19
PRSS54-203ENST00000563336 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.45■■□□□ 1.18
PRSS54-203ENST00000563336 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa22.26■■□□□ 1.15
PRSS54-203ENST00000563336 SCRIBQ14160 1630 aa22.1■■□□□ 1.13
PRSS54-203ENST00000563336 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
PRSS54-203ENST00000563336 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.86■■□□□ 1.09
PRSS54-203ENST00000563336 CECR2Q9BXF3 1484 aa21.78■■□□□ 1.08
PRSS54-203ENST00000563336 NCAPD3P42695 1498 aa21.29■■□□□ 1
PRSS54-203ENST00000563336 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.2■□□□□ 0.98
PRSS54-203ENST00000563336 SMARCA4P51532 1647 aa21.18■□□□□ 0.98
PRSS54-203ENST00000563336 SMARCA2P51531 1590 aa21.15■□□□□ 0.98
PRSS54-203ENST00000563336 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
PRSS54-203ENST00000563336 HMGXB3Q12766 1538 aa21.12■□□□□ 0.97
PRSS54-203ENST00000563336 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.06■□□□□ 0.96
PRSS54-203ENST00000563336 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
PRSS54-203ENST00000563336 MROH2BQ7Z745 1585 aa20.94■□□□□ 0.94
PRSS54-203ENST00000563336 CUX2O14529 1486 aa20.85■□□□□ 0.93
PRSS54-203ENST00000563336 ERCC6Q03468 1493 aa20.83■□□□□ 0.93
PRSS54-203ENST00000563336 NESP48681 1621 aa20.78■□□□□ 0.92
PRSS54-203ENST00000563336 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa20.75■□□□□ 0.91
PRSS54-203ENST00000563336 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa20.69■□□□□ 0.9
PRSS54-203ENST00000563336 WIZO95785 1651 aa20.67■□□□□ 0.9
PRSS54-203ENST00000563336 PDS5BQ9NTI5 1447 aa20.62■□□□□ 0.89
PRSS54-203ENST00000563336 CADPSQ9ULU8 1353 aa20.61■□□□□ 0.89
PRSS54-203ENST00000563336 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PRSS54-203ENST00000563336 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PRSS54-203ENST00000563336 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa20.52■□□□□ 0.88
PRSS54-203ENST00000563336 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PRSS54-203ENST00000563336 CFTRP13569 1480 aa20.43■□□□□ 0.86
PRSS54-203ENST00000563336 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.41■□□□□ 0.86
PRSS54-203ENST00000563336 WDR62O43379 1518 aa20.37■□□□□ 0.85
PRSS54-203ENST00000563336 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.34■□□□□ 0.85
PRSS54-203ENST00000563336 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.34■□□□□ 0.85
PRSS54-203ENST00000563336 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.24■□□□□ 0.83
PRSS54-203ENST00000563336 PRDM2Q13029 1718 aa20.18■□□□□ 0.82
PRSS54-203ENST00000563336 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
PRSS54-203ENST00000563336 ABCC8Q09428 1581 aa20.01■□□□□ 0.79
PRSS54-203ENST00000563336 TOPBP1Q92547 1522 aa19.97■□□□□ 0.79
PRSS54-203ENST00000563336 IFT140Q96RY7 1462 aa19.96■□□□□ 0.79
PRSS54-203ENST00000563336 DNMBPQ6XZF7 1577 aa19.91■□□□□ 0.78
PRSS54-203ENST00000563336 OSCARQ8IYS5 282 aa19.91■□□□□ 0.78
PRSS54-203ENST00000563336 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
PRSS54-203ENST00000563336 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
PRSS54-203ENST00000563336 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
PRSS54-203ENST00000563336 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
PRSS54-203ENST00000563336 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP19.71■□□□□ 0.75
PRSS54-203ENST00000563336 SOGA1O94964 1423 aa19.7■□□□□ 0.74
PRSS54-203ENST00000563336 TRIM41Q8WV44 630 aa19.68■□□□□ 0.74
PRSS54-203ENST00000563336 WDR97A6NE52 1622 aa19.68■□□□□ 0.74
PRSS54-203ENST00000563336 CUX1P39880 1505 aa19.67■□□□□ 0.74
PRSS54-203ENST00000563336 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa19.67■□□□□ 0.74
PRSS54-203ENST00000563336 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
PRSS54-203ENST00000563336 FGD5Q6ZNL6 1462 aa19.65■□□□□ 0.74
PRSS54-203ENST00000563336 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
PRSS54-203ENST00000563336 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa19.58■□□□□ 0.72
PRSS54-203ENST00000563336 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa19.58■□□□□ 0.72
PRSS54-203ENST00000563336 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa19.58■□□□□ 0.72
PRSS54-203ENST00000563336 CHD1O14646 1710 aa19.56■□□□□ 0.72
PRSS54-203ENST00000563336 ARHGEF11O15085 1522 aa19.55■□□□□ 0.72
PRSS54-203ENST00000563336 GRIN2BQ13224 1484 aa19.52■□□□□ 0.72
PRSS54-203ENST00000563336 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.72
PRSS54-203ENST00000563336 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa19.5■□□□□ 0.71
PRSS54-203ENST00000563336 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa19.5■□□□□ 0.71
PRSS54-203ENST00000563336 FBLN2P98095 1184 aa19.49■□□□□ 0.71
PRSS54-203ENST00000563336 GAPVD1Q14C86 1478 aa19.46■□□□□ 0.71
PRSS54-203ENST00000563336 SYNJ2O15056 1496 aa19.44■□□□□ 0.7
PRSS54-203ENST00000563336 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP19.44■□□□□ 0.7
PRSS54-203ENST00000563336 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa19.43■□□□□ 0.7
PRSS54-203ENST00000563336 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP19.42■□□□□ 0.7
PRSS54-203ENST00000563336 TOP2BQ02880 1626 aa19.42■□□□□ 0.7
PRSS54-203ENST00000563336 CLASP1Q7Z460 1538 aa19.41■□□□□ 0.7
PRSS54-203ENST00000563336 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa19.41■□□□□ 0.7
PRSS54-203ENST00000563336 SYNJ1O43426 1573 aa19.4■□□□□ 0.7
PRSS54-203ENST00000563336 PBRM1Q86U86 1689 aa19.4■□□□□ 0.7
PRSS54-203ENST00000563336 CYB5RLQ6IPT4 315 aa19.37■□□□□ 0.69
PRSS54-203ENST00000563336 ARAP1Q96P48 1450 aa19.36■□□□□ 0.69
PRSS54-203ENST00000563336 ERICH3Q5RHP9 1530 aa19.26■□□□□ 0.67
PRSS54-203ENST00000563336 GRIN2AQ12879 1464 aa19.26■□□□□ 0.67
PRSS54-203ENST00000563336 ADAMTS12P58397 1594 aa19.24■□□□□ 0.67
PRSS54-203ENST00000563336 FHAD1B1AJZ9 1412 aa19.24■□□□□ 0.67
PRSS54-203ENST00000563336 NUP160Q12769 1436 aa19.22■□□□□ 0.67
PRSS54-203ENST00000563336 CEP170Q5SW79 1584 aa19.15■□□□□ 0.66
PRSS54-203ENST00000563336 SHROOM2Q13796 1616 aa19.12■□□□□ 0.65
PRSS54-203ENST00000563336 TRHP20396 242 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
PRSS54-203ENST00000563336 ERCC6L2Q5T890 1561 aa19.06■□□□□ 0.64
PRSS54-203ENST00000563336 IGF1RP08069 1367 aa19.05■□□□□ 0.64
PRSS54-203ENST00000563336 KIF27Q86VH2 1401 aa19.04■□□□□ 0.64
PRSS54-203ENST00000563336 JPH4Q96JJ6 628 aa19.01■□□□□ 0.63
PRSS54-203ENST00000563336 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.2 ms