RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563028.1

KIFC3-213, Transcript of kinesin family member C3, humanhuman

TSL 4

Gene KIFC3, Length 681 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFC3-213ENST00000563028 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.68■■■■■ 6.82
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KIFC3-213ENST00000563028 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.71■■■■■ 5.39
KIFC3-213ENST00000563028 NACADO15069 1562 aa48.52■■■■■ 5.36
KIFC3-213ENST00000563028 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.51■■■■■ 5.36
KIFC3-213ENST00000563028 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.05■■■■■ 5.28
KIFC3-213ENST00000563028 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.93■■■■■ 5.26
KIFC3-213ENST00000563028 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.66■■■■■ 5.22
KIFC3-213ENST00000563028 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.58■■■■■ 5.21
KIFC3-213ENST00000563028 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.54■■■■■ 5.2
KIFC3-213ENST00000563028 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.25■■■■■ 5.15
KIFC3-213ENST00000563028 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.23■■■■■ 5.15
KIFC3-213ENST00000563028 SCRIBQ14160 1630 aa46.97■■■■■ 5.11
KIFC3-213ENST00000563028 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.67■■■■■ 5.06
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KIFC3-213ENST00000563028 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46■■■■■ 4.95
KIFC3-213ENST00000563028 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.8■■■■■ 4.92
KIFC3-213ENST00000563028 SMARCA4P51532 1647 aa44.85■■■■■ 4.77
KIFC3-213ENST00000563028 NCAPD3P42695 1498 aa44.8■■■■■ 4.76
KIFC3-213ENST00000563028 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.76■■■■■ 4.76
KIFC3-213ENST00000563028 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.73■■■■■ 4.75
KIFC3-213ENST00000563028 SMARCA2P51531 1590 aa44.66■■■■■ 4.74
KIFC3-213ENST00000563028 HMGXB3Q12766 1538 aa44.5■■■■■ 4.71
KIFC3-213ENST00000563028 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.46■■■■■ 4.71
KIFC3-213ENST00000563028 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.39■■■■■ 4.7
KIFC3-213ENST00000563028 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.36■■■■■ 4.69
KIFC3-213ENST00000563028 WIZO95785 1651 aa43.95■■■■■ 4.63
KIFC3-213ENST00000563028 ERCC6Q03468 1493 aa43.92■■■■■ 4.62
KIFC3-213ENST00000563028 NESP48681 1621 aa43.91■■■■■ 4.62
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KIFC3-213ENST00000563028 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.68■■■■■ 4.58
KIFC3-213ENST00000563028 CUX2O14529 1486 aa43.6■■■■■ 4.57
KIFC3-213ENST00000563028 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.49■■■■■ 4.55
KIFC3-213ENST00000563028 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.44■■■■■ 4.54
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KIFC3-213ENST00000563028 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.33■■■■■ 4.53
KIFC3-213ENST00000563028 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.3■■■■■ 4.52
KIFC3-213ENST00000563028 CFTRP13569 1480 aa43.11■■■■■ 4.49
KIFC3-213ENST00000563028 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.01■■■■■ 4.48
KIFC3-213ENST00000563028 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.99■■■■■ 4.47
KIFC3-213ENST00000563028 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.98■■■■■ 4.47
KIFC3-213ENST00000563028 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.96■■■■■ 4.47
KIFC3-213ENST00000563028 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.91■■■■■ 4.46
KIFC3-213ENST00000563028 WDR62O43379 1518 aa42.87■■■■■ 4.45
KIFC3-213ENST00000563028 PRDM2Q13029 1718 aa42.67■■■■■ 4.42
KIFC3-213ENST00000563028 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.58■■■■■ 4.41
KIFC3-213ENST00000563028 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.36■■■■■ 4.37
KIFC3-213ENST00000563028 TOPBP1Q92547 1522 aa42.24■■■■■ 4.35
KIFC3-213ENST00000563028 ABCC8Q09428 1581 aa42.19■■■■■ 4.34
KIFC3-213ENST00000563028 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.13■■■■■ 4.33
KIFC3-213ENST00000563028 IFT140Q96RY7 1462 aa42.1■■■■■ 4.33
KIFC3-213ENST00000563028 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.97■■■■■ 4.31
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KIFC3-213ENST00000563028 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.7■■■■■ 4.27
KIFC3-213ENST00000563028 SOGA1O94964 1423 aa41.69■■■■■ 4.27
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KIFC3-213ENST00000563028 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.53■■■■■ 4.24
KIFC3-213ENST00000563028 WDR97A6NE52 1622 aa41.4■■■■■ 4.22
KIFC3-213ENST00000563028 FBLN2P98095 1184 aa41.32■■■■■ 4.21
KIFC3-213ENST00000563028 TRIM41Q8WV44 630 aa41.32■■■■■ 4.21
KIFC3-213ENST00000563028 CHD1O14646 1710 aa41.31■■■■■ 4.2
KIFC3-213ENST00000563028 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.29■■■■■ 4.2
KIFC3-213ENST00000563028 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.27■■■■■ 4.2
KIFC3-213ENST00000563028 GRIN2BQ13224 1484 aa41.24■■■■■ 4.19
KIFC3-213ENST00000563028 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.23■■■■■ 4.19
KIFC3-213ENST00000563028 TOP2BQ02880 1626 aa41.22■■■■■ 4.19
KIFC3-213ENST00000563028 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.21■■■■■ 4.19
KIFC3-213ENST00000563028 SYNJ1O43426 1573 aa41.2■■■■■ 4.19
KIFC3-213ENST00000563028 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.18■■■■■ 4.18
KIFC3-213ENST00000563028 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.17■■■■■ 4.18
KIFC3-213ENST00000563028 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.11■■■■■ 4.17
KIFC3-213ENST00000563028 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.11■■■■■ 4.17
KIFC3-213ENST00000563028 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.11■■■■■ 4.17
KIFC3-213ENST00000563028 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.11■■■■■ 4.17
KIFC3-213ENST00000563028 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.1■■■■■ 4.17
KIFC3-213ENST00000563028 PBRM1Q86U86 1689 aa41.09■■■■■ 4.17
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KIFC3-213ENST00000563028 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.77■■■■■ 4.12
KIFC3-213ENST00000563028 ADAMTS12P58397 1594 aa40.75■■■■■ 4.11
KIFC3-213ENST00000563028 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.72■■■■■ 4.11
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KIFC3-213ENST00000563028 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.69■■■■■ 4.1
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KIFC3-213ENST00000563028 NUP160Q12769 1436 aa40.54■■■■■ 4.08
KIFC3-213ENST00000563028 CEP170Q5SW79 1584 aa40.52■■■■■ 4.08
KIFC3-213ENST00000563028 KIF27Q86VH2 1401 aa40.47■■■■■ 4.07
KIFC3-213ENST00000563028 IGF1RP08069 1367 aa40.37■■■■■ 4.05
KIFC3-213ENST00000563028 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.29■■■■■ 4.04
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KIFC3-213ENST00000563028 CUL7Q14999 1698 aa40.24■■■■■ 4.03
KIFC3-213ENST00000563028 JPH4Q96JJ6 628 aa40.18■■■■■ 4.02
KIFC3-213ENST00000563028 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.16■■■■■ 4.02
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