RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562810.5

LMAN1L-205, Transcript of lectin, mannose binding 1 like, humanhuman

TSL 4

Gene LMAN1L, Length 555 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1L-205ENST00000562810 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.74■■■■■ 5.87
LMAN1L-205ENST00000562810 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.32■■■■■ 5
LMAN1L-205ENST00000562810 ABCC9O60706 1549 aa45.31■■■■■ 4.84
LMAN1L-205ENST00000562810 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.65■■■■■ 4.58
LMAN1L-205ENST00000562810 NACADO15069 1562 aa43.51■■■■■ 4.56
LMAN1L-205ENST00000562810 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.18■■■■■ 4.5
LMAN1L-205ENST00000562810 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.17■■■■■ 4.5
LMAN1L-205ENST00000562810 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.08■■■■■ 4.49
LMAN1L-205ENST00000562810 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.89■■■■■ 4.46
LMAN1L-205ENST00000562810 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.65■■■■■ 4.42
LMAN1L-205ENST00000562810 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.2■■■■■ 4.35
LMAN1L-205ENST00000562810 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.17■■■■■ 4.34
LMAN1L-205ENST00000562810 SCRIBQ14160 1630 aa42.09■■■■■ 4.33
LMAN1L-205ENST00000562810 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.95■■■■■ 4.31
LMAN1L-205ENST00000562810 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.59■■■■■ 4.25
LMAN1L-205ENST00000562810 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.17■■■■■ 4.18
LMAN1L-205ENST00000562810 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.05■■■■■ 4.16
LMAN1L-205ENST00000562810 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.79■■■■■ 4.12
LMAN1L-205ENST00000562810 SMARCA4P51532 1647 aa40.27■■■■■ 4.04
LMAN1L-205ENST00000562810 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.22■■■■■ 4.03
LMAN1L-205ENST00000562810 SMARCA2P51531 1590 aa40.1■■■■■ 4.01
LMAN1L-205ENST00000562810 NCAPD3P42695 1498 aa40.05■■■■■ 4
LMAN1L-205ENST00000562810 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.02■■■■■ 4
LMAN1L-205ENST00000562810 HMGXB3Q12766 1538 aa39.96■■■■□ 3.99
LMAN1L-205ENST00000562810 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.89■■■■□ 3.98
LMAN1L-205ENST00000562810 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.81■■■■□ 3.96
LMAN1L-205ENST00000562810 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.76■■■■□ 3.96
LMAN1L-205ENST00000562810 WIZO95785 1651 aa39.43■■■■□ 3.9
LMAN1L-205ENST00000562810 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.24■■■■□ 3.87
LMAN1L-205ENST00000562810 ERCC6Q03468 1493 aa39.19■■■■□ 3.86
LMAN1L-205ENST00000562810 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.16■■■■□ 3.86
LMAN1L-205ENST00000562810 NESP48681 1621 aa39.1■■■■□ 3.85
LMAN1L-205ENST00000562810 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.06■■■■□ 3.84
LMAN1L-205ENST00000562810 CUX2O14529 1486 aa38.89■■■■□ 3.82
LMAN1L-205ENST00000562810 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.85■■■■□ 3.81
LMAN1L-205ENST00000562810 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.84■■■■□ 3.81
LMAN1L-205ENST00000562810 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.8■■■■□ 3.8
LMAN1L-205ENST00000562810 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.72■■■■□ 3.79
LMAN1L-205ENST00000562810 CFTRP13569 1480 aa38.6■■■■□ 3.77
LMAN1L-205ENST00000562810 PRDM2Q13029 1718 aa38.52■■■■□ 3.76
LMAN1L-205ENST00000562810 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.49■■■■□ 3.75
LMAN1L-205ENST00000562810 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.47■■■■□ 3.75
LMAN1L-205ENST00000562810 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.47■■■■□ 3.75
LMAN1L-205ENST00000562810 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.45■■■■□ 3.75
LMAN1L-205ENST00000562810 WDR62O43379 1518 aa38.37■■■■□ 3.73
LMAN1L-205ENST00000562810 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.04■■■■□ 3.68
LMAN1L-205ENST00000562810 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.98■■■■□ 3.67
LMAN1L-205ENST00000562810 ABCC8Q09428 1581 aa37.89■■■■□ 3.66
LMAN1L-205ENST00000562810 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.81■■■■□ 3.64
LMAN1L-205ENST00000562810 TOPBP1Q92547 1522 aa37.81■■■■□ 3.64
LMAN1L-205ENST00000562810 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.79■■■■□ 3.64
LMAN1L-205ENST00000562810 IFT140Q96RY7 1462 aa37.67■■■■□ 3.62
LMAN1L-205ENST00000562810 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.46■■■■□ 3.59
LMAN1L-205ENST00000562810 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.44■■■■□ 3.58
LMAN1L-205ENST00000562810 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.42■■■■□ 3.58
LMAN1L-205ENST00000562810 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.41■■■■□ 3.58
LMAN1L-205ENST00000562810 CUX1P39880 1505 aa37.4■■■■□ 3.58
LMAN1L-205ENST00000562810 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.34■■■■□ 3.57
LMAN1L-205ENST00000562810 WDR97A6NE52 1622 aa37.29■■■■□ 3.56
LMAN1L-205ENST00000562810 SOGA1O94964 1423 aa37.27■■■■□ 3.56
LMAN1L-205ENST00000562810 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.22■■■■□ 3.55
LMAN1L-205ENST00000562810 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.14■■■■□ 3.54
LMAN1L-205ENST00000562810 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.14■■■■□ 3.54
LMAN1L-205ENST00000562810 TOP2BQ02880 1626 aa37.1■■■■□ 3.53
LMAN1L-205ENST00000562810 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.09■■■■□ 3.53
LMAN1L-205ENST00000562810 OSCARQ8IYS5 282 aa37.08■■■■□ 3.53
LMAN1L-205ENST00000562810 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.03■■■■□ 3.52
LMAN1L-205ENST00000562810 SYNJ1O43426 1573 aa37.01■■■■□ 3.52
LMAN1L-205ENST00000562810 CHD1O14646 1710 aa37■■■■□ 3.51
LMAN1L-205ENST00000562810 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.99■■■■□ 3.51
LMAN1L-205ENST00000562810 PBRM1Q86U86 1689 aa36.96■■■■□ 3.51
LMAN1L-205ENST00000562810 GRIN2BQ13224 1484 aa36.94■■■■□ 3.5
LMAN1L-205ENST00000562810 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.92■■■■□ 3.5
LMAN1L-205ENST00000562810 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.9■■■■□ 3.5
LMAN1L-205ENST00000562810 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.9■■■■□ 3.5
LMAN1L-205ENST00000562810 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.88■■■■□ 3.49
LMAN1L-205ENST00000562810 FBLN2P98095 1184 aa36.76■■■■□ 3.48
LMAN1L-205ENST00000562810 SYNJ2O15056 1496 aa36.74■■■■□ 3.47
LMAN1L-205ENST00000562810 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.65■■■■□ 3.46
LMAN1L-205ENST00000562810 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.63■■■■□ 3.45
LMAN1L-205ENST00000562810 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.63■■■■□ 3.45
LMAN1L-205ENST00000562810 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.63■■■■□ 3.45
LMAN1L-205ENST00000562810 ADAMTS12P58397 1594 aa36.59■■■■□ 3.45
LMAN1L-205ENST00000562810 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.59■■■■□ 3.45
LMAN1L-205ENST00000562810 ARHGEF11O15085 1522 aa36.58■■■■□ 3.45
LMAN1L-205ENST00000562810 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.54■■■■□ 3.44
LMAN1L-205ENST00000562810 GRIN2AQ12879 1464 aa36.46■■■■□ 3.43
LMAN1L-205ENST00000562810 TRIM41Q8WV44 630 aa36.46■■■■□ 3.43
LMAN1L-205ENST00000562810 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.45■■■■□ 3.43
LMAN1L-205ENST00000562810 KIF27Q86VH2 1401 aa36.36■■■■□ 3.41
LMAN1L-205ENST00000562810 CUL7Q14999 1698 aa36.29■■■■□ 3.4
LMAN1L-205ENST00000562810 CEP170Q5SW79 1584 aa36.27■■■■□ 3.4
LMAN1L-205ENST00000562810 NUP160Q12769 1436 aa36.27■■■■□ 3.4
LMAN1L-205ENST00000562810 ARAP1Q96P48 1450 aa36.23■■■■□ 3.39
LMAN1L-205ENST00000562810 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.11■■■■□ 3.37
LMAN1L-205ENST00000562810 SHROOM2Q13796 1616 aa36.11■■■■□ 3.37
LMAN1L-205ENST00000562810 IGF1RP08069 1367 aa36.1■■■■□ 3.37
LMAN1L-205ENST00000562810 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.07■■■■□ 3.36
LMAN1L-205ENST00000562810 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.94■■■■□ 3.34
LMAN1L-205ENST00000562810 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.9■■■■□ 3.34
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