RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562041.1

CDIPT-203, Transcript of CDP-diacylglycerol--inositol 3-phosphatidyltransferase, humanhuman

TSL 3

Gene CDIPT, Length 1,129 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDIPT-203ENST00000562041 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.33■■■■■ 7.09
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CDIPT-203ENST00000562041 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.44■■■■■ 5.67
CDIPT-203ENST00000562041 NACADO15069 1562 aa50.17■■■■■ 5.62
CDIPT-203ENST00000562041 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.83■■■■■ 5.57
CDIPT-203ENST00000562041 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.59■■■■■ 5.53
CDIPT-203ENST00000562041 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.38■■■■■ 5.5
CDIPT-203ENST00000562041 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.25■■■■■ 5.48
CDIPT-203ENST00000562041 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.16■■■■■ 5.46
CDIPT-203ENST00000562041 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.13■■■■■ 5.46
CDIPT-203ENST00000562041 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.06■■■■■ 5.44
CDIPT-203ENST00000562041 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.94■■■■■ 5.43
CDIPT-203ENST00000562041 SCRIBQ14160 1630 aa48.43■■■■■ 5.34
CDIPT-203ENST00000562041 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.35■■■■■ 5.33
CDIPT-203ENST00000562041 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.74■■■■■ 5.23
CDIPT-203ENST00000562041 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.72■■■■■ 5.23
CDIPT-203ENST00000562041 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.53■■■■■ 5.2
CDIPT-203ENST00000562041 NCAPD3P42695 1498 aa46.26■■■■■ 5
CDIPT-203ENST00000562041 SMARCA4P51532 1647 aa46.25■■■■■ 4.99
CDIPT-203ENST00000562041 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.17■■■■■ 4.98
CDIPT-203ENST00000562041 SMARCA2P51531 1590 aa46.1■■■■■ 4.97
CDIPT-203ENST00000562041 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.06■■■■■ 4.96
CDIPT-203ENST00000562041 HMGXB3Q12766 1538 aa46■■■■■ 4.95
CDIPT-203ENST00000562041 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.8■■■■■ 4.92
CDIPT-203ENST00000562041 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.76■■■■■ 4.92
CDIPT-203ENST00000562041 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.71■■■■■ 4.91
CDIPT-203ENST00000562041 ERCC6Q03468 1493 aa45.57■■■■■ 4.89
CDIPT-203ENST00000562041 NESP48681 1621 aa45.43■■■■■ 4.86
CDIPT-203ENST00000562041 CUX2O14529 1486 aa45.41■■■■■ 4.86
CDIPT-203ENST00000562041 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.23■■■■■ 4.83
CDIPT-203ENST00000562041 WIZO95785 1651 aa45.21■■■■■ 4.83
CDIPT-203ENST00000562041 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.98■■■■■ 4.79
CDIPT-203ENST00000562041 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.95■■■■■ 4.79
CDIPT-203ENST00000562041 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.94■■■■■ 4.78
CDIPT-203ENST00000562041 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.91■■■■■ 4.78
CDIPT-203ENST00000562041 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.86■■■■■ 4.77
CDIPT-203ENST00000562041 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.84■■■■■ 4.77
CDIPT-203ENST00000562041 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.66■■■■■ 4.74
CDIPT-203ENST00000562041 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.52■■■■■ 4.72
CDIPT-203ENST00000562041 CFTRP13569 1480 aa44.43■■■■■ 4.7
CDIPT-203ENST00000562041 WDR62O43379 1518 aa44.42■■■■■ 4.7
CDIPT-203ENST00000562041 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.41■■■■■ 4.7
CDIPT-203ENST00000562041 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.37■■■■■ 4.69
CDIPT-203ENST00000562041 PRDM2Q13029 1718 aa44.16■■■■■ 4.66
CDIPT-203ENST00000562041 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.1■■■■■ 4.65
CDIPT-203ENST00000562041 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.99■■■■■ 4.63
CDIPT-203ENST00000562041 TOPBP1Q92547 1522 aa43.58■■■■■ 4.57
CDIPT-203ENST00000562041 ABCC8Q09428 1581 aa43.52■■■■■ 4.56
CDIPT-203ENST00000562041 IFT140Q96RY7 1462 aa43.51■■■■■ 4.56
CDIPT-203ENST00000562041 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.47■■■■■ 4.55
CDIPT-203ENST00000562041 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.38■■■■■ 4.53
CDIPT-203ENST00000562041 OSCARQ8IYS5 282 aa43.31■■■■■ 4.52
CDIPT-203ENST00000562041 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.23■■■■■ 4.51
CDIPT-203ENST00000562041 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.19■■■■■ 4.51
CDIPT-203ENST00000562041 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.14■■■■■ 4.5
CDIPT-203ENST00000562041 TRIM41Q8WV44 630 aa43.1■■■■■ 4.49
CDIPT-203ENST00000562041 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.03■■■■■ 4.48
CDIPT-203ENST00000562041 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43■■■■■ 4.47
CDIPT-203ENST00000562041 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.95■■■■■ 4.47
CDIPT-203ENST00000562041 CUX1P39880 1505 aa42.94■■■■■ 4.46
CDIPT-203ENST00000562041 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.93■■■■■ 4.46
CDIPT-203ENST00000562041 SOGA1O94964 1423 aa42.92■■■■■ 4.46
CDIPT-203ENST00000562041 CHD1O14646 1710 aa42.88■■■■■ 4.45
CDIPT-203ENST00000562041 WDR97A6NE52 1622 aa42.82■■■■■ 4.45
CDIPT-203ENST00000562041 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.81■■■■■ 4.44
CDIPT-203ENST00000562041 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.81■■■■■ 4.44
CDIPT-203ENST00000562041 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.81■■■■■ 4.44
CDIPT-203ENST00000562041 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.78■■■■■ 4.44
CDIPT-203ENST00000562041 ARHGEF11O15085 1522 aa42.68■■■■■ 4.42
CDIPT-203ENST00000562041 FBLN2P98095 1184 aa42.63■■■■■ 4.41
CDIPT-203ENST00000562041 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.62■■■■■ 4.41
CDIPT-203ENST00000562041 GRIN2BQ13224 1484 aa42.55■■■■■ 4.4
CDIPT-203ENST00000562041 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.55■■■■■ 4.4
CDIPT-203ENST00000562041 PBRM1Q86U86 1689 aa42.49■■■■■ 4.39
CDIPT-203ENST00000562041 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.46■■■■■ 4.39
CDIPT-203ENST00000562041 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.44■■■■■ 4.38
CDIPT-203ENST00000562041 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.41■■■■■ 4.38
CDIPT-203ENST00000562041 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.39■■■■■ 4.38
CDIPT-203ENST00000562041 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.39■■■■■ 4.38
CDIPT-203ENST00000562041 SYNJ2O15056 1496 aa42.37■■■■■ 4.37
CDIPT-203ENST00000562041 SYNJ1O43426 1573 aa42.36■■■■■ 4.37
CDIPT-203ENST00000562041 TOP2BQ02880 1626 aa42.36■■■■■ 4.37
CDIPT-203ENST00000562041 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.35■■■■■ 4.37
CDIPT-203ENST00000562041 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.32■■■■■ 4.37
CDIPT-203ENST00000562041 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.27■■■■■ 4.36
CDIPT-203ENST00000562041 ARAP1Q96P48 1450 aa42.27■■■■■ 4.36
CDIPT-203ENST00000562041 ADAMTS12P58397 1594 aa42.07■■■■■ 4.33
CDIPT-203ENST00000562041 GRIN2AQ12879 1464 aa42.01■■■■■ 4.32
CDIPT-203ENST00000562041 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.95■■■■■ 4.31
CDIPT-203ENST00000562041 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.91■■■■■ 4.3
CDIPT-203ENST00000562041 CEP170Q5SW79 1584 aa41.86■■■■■ 4.29
CDIPT-203ENST00000562041 NUP160Q12769 1436 aa41.85■■■■■ 4.29
CDIPT-203ENST00000562041 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.7■■■■■ 4.27
CDIPT-203ENST00000562041 SHROOM2Q13796 1616 aa41.68■■■■■ 4.26
CDIPT-203ENST00000562041 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.67■■■■■ 4.26
CDIPT-203ENST00000562041 KIF27Q86VH2 1401 aa41.51■■■■■ 4.24
CDIPT-203ENST00000562041 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.47■■■■■ 4.23
CDIPT-203ENST00000562041 CUL7Q14999 1698 aa41.45■■■■■ 4.23
CDIPT-203ENST00000562041 IGF1RP08069 1367 aa41.4■■■■■ 4.22
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