RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562011.1

CTU2-203, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 2

Gene CTU2, Length 324 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-203ENST00000562011 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.1■■■■□ 3.37
CTU2-203ENST00000562011 ABCC9O60706 1549 aa32.55■■■□□ 2.8
CTU2-203ENST00000562011 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.4■■■□□ 2.78
CTU2-203ENST00000562011 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.87■■■□□ 2.53
CTU2-203ENST00000562011 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.65■■■□□ 2.5
CTU2-203ENST00000562011 NACADO15069 1562 aa30.62■■■□□ 2.49
CTU2-203ENST00000562011 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.54■■■□□ 2.48
CTU2-203ENST00000562011 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.31■■■□□ 2.44
CTU2-203ENST00000562011 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.3■■■□□ 2.44
CTU2-203ENST00000562011 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.13■■■□□ 2.41
CTU2-203ENST00000562011 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.07■■■□□ 2.4
CTU2-203ENST00000562011 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
CTU2-203ENST00000562011 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.75■■■□□ 2.35
CTU2-203ENST00000562011 SCRIBQ14160 1630 aa29.6■■■□□ 2.33
CTU2-203ENST00000562011 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.47■■■□□ 2.31
CTU2-203ENST00000562011 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.38■■■□□ 2.29
CTU2-203ENST00000562011 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
CTU2-203ENST00000562011 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.28■■■□□ 2.28
CTU2-203ENST00000562011 NCAPD3P42695 1498 aa28.28■■■□□ 2.12
CTU2-203ENST00000562011 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.22■■■□□ 2.11
CTU2-203ENST00000562011 SMARCA4P51532 1647 aa28.19■■■□□ 2.1
CTU2-203ENST00000562011 SMARCA2P51531 1590 aa28.09■■■□□ 2.09
CTU2-203ENST00000562011 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.09■■■□□ 2.09
CTU2-203ENST00000562011 HMGXB3Q12766 1538 aa28.07■■■□□ 2.08
CTU2-203ENST00000562011 ERCC6Q03468 1493 aa28.04■■■□□ 2.08
CTU2-203ENST00000562011 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
CTU2-203ENST00000562011 CUX2O14529 1486 aa27.98■■■□□ 2.07
CTU2-203ENST00000562011 NESP48681 1621 aa27.98■■■□□ 2.07
CTU2-203ENST00000562011 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
CTU2-203ENST00000562011 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.87■■■□□ 2.05
CTU2-203ENST00000562011 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.87■■■□□ 2.05
CTU2-203ENST00000562011 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
CTU2-203ENST00000562011 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.66■■■□□ 2.02
CTU2-203ENST00000562011 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.61■■■□□ 2.01
CTU2-203ENST00000562011 WIZO95785 1651 aa27.56■■■□□ 2
CTU2-203ENST00000562011 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.47■■□□□ 1.99
CTU2-203ENST00000562011 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.43■■□□□ 1.98
CTU2-203ENST00000562011 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.28■■□□□ 1.96
CTU2-203ENST00000562011 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
CTU2-203ENST00000562011 WDR62O43379 1518 aa27.22■■□□□ 1.95
CTU2-203ENST00000562011 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.16■■□□□ 1.94
CTU2-203ENST00000562011 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.14■■□□□ 1.94
CTU2-203ENST00000562011 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
CTU2-203ENST00000562011 CFTRP13569 1480 aa27.11■■□□□ 1.93
CTU2-203ENST00000562011 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
CTU2-203ENST00000562011 TRIM41Q8WV44 630 aa26.89■■□□□ 1.9
CTU2-203ENST00000562011 PRDM2Q13029 1718 aa26.87■■□□□ 1.89
CTU2-203ENST00000562011 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.85■■□□□ 1.89
CTU2-203ENST00000562011 OSCARQ8IYS5 282 aa26.71■■□□□ 1.87
CTU2-203ENST00000562011 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
CTU2-203ENST00000562011 TOPBP1Q92547 1522 aa26.63■■□□□ 1.85
CTU2-203ENST00000562011 IFT140Q96RY7 1462 aa26.6■■□□□ 1.85
CTU2-203ENST00000562011 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.51■■□□□ 1.83
CTU2-203ENST00000562011 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
CTU2-203ENST00000562011 ABCC8Q09428 1581 aa26.47■■□□□ 1.83
CTU2-203ENST00000562011 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.45■■□□□ 1.82
CTU2-203ENST00000562011 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.45■■□□□ 1.82
CTU2-203ENST00000562011 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.45■■□□□ 1.82
CTU2-203ENST00000562011 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
CTU2-203ENST00000562011 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.4■■□□□ 1.82
CTU2-203ENST00000562011 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
CTU2-203ENST00000562011 CHD1O14646 1710 aa26.34■■□□□ 1.81
CTU2-203ENST00000562011 ARHGEF11O15085 1522 aa26.33■■□□□ 1.81
CTU2-203ENST00000562011 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.3■■□□□ 1.8
CTU2-203ENST00000562011 SOGA1O94964 1423 aa26.22■■□□□ 1.79
CTU2-203ENST00000562011 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
CTU2-203ENST00000562011 FBLN2P98095 1184 aa26.21■■□□□ 1.79
CTU2-203ENST00000562011 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.19■■□□□ 1.78
CTU2-203ENST00000562011 CUX1P39880 1505 aa26.18■■□□□ 1.78
CTU2-203ENST00000562011 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.14■■□□□ 1.78
CTU2-203ENST00000562011 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.1■■□□□ 1.77
CTU2-203ENST00000562011 ARAP1Q96P48 1450 aa26.08■■□□□ 1.77
CTU2-203ENST00000562011 WDR97A6NE52 1622 aa26.03■■□□□ 1.76
CTU2-203ENST00000562011 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
CTU2-203ENST00000562011 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.98■■□□□ 1.75
CTU2-203ENST00000562011 GRIN2BQ13224 1484 aa25.98■■□□□ 1.75
CTU2-203ENST00000562011 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
CTU2-203ENST00000562011 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
CTU2-203ENST00000562011 PBRM1Q86U86 1689 aa25.94■■□□□ 1.74
CTU2-203ENST00000562011 SYNJ1O43426 1573 aa25.91■■□□□ 1.74
CTU2-203ENST00000562011 SYNJ2O15056 1496 aa25.91■■□□□ 1.74
CTU2-203ENST00000562011 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.9■■□□□ 1.74
CTU2-203ENST00000562011 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
CTU2-203ENST00000562011 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.85■■□□□ 1.73
CTU2-203ENST00000562011 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.85■■□□□ 1.73
CTU2-203ENST00000562011 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.72■■□□□ 1.71
CTU2-203ENST00000562011 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.71■■□□□ 1.71
CTU2-203ENST00000562011 TOP2BQ02880 1626 aa25.7■■□□□ 1.71
CTU2-203ENST00000562011 GRIN2AQ12879 1464 aa25.66■■□□□ 1.7
CTU2-203ENST00000562011 ADAMTS12P58397 1594 aa25.66■■□□□ 1.7
CTU2-203ENST00000562011 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.65■■□□□ 1.7
CTU2-203ENST00000562011 CEP170Q5SW79 1584 aa25.62■■□□□ 1.69
CTU2-203ENST00000562011 NUP160Q12769 1436 aa25.57■■□□□ 1.68
CTU2-203ENST00000562011 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.54■■□□□ 1.68
CTU2-203ENST00000562011 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.51■■□□□ 1.67
CTU2-203ENST00000562011 SHROOM2Q13796 1616 aa25.49■■□□□ 1.67
CTU2-203ENST00000562011 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
CTU2-203ENST00000562011 JPH4Q96JJ6 628 aa25.31■■□□□ 1.64
CTU2-203ENST00000562011 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.31■■□□□ 1.64
CTU2-203ENST00000562011 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.23■■□□□ 1.63
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