RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561862.5

NTHL1-203, Transcript of nth like DNA glycosylase 1, humanhuman

TSL 2

Gene NTHL1, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTHL1-203ENST00000561862 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57■■■■■ 6.72
NTHL1-203ENST00000561862 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.83■■■■■ 5.73
NTHL1-203ENST00000561862 ABCC9O60706 1549 aa49.71■■■■■ 5.55
NTHL1-203ENST00000561862 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.81■■■■■ 5.24
NTHL1-203ENST00000561862 NACADO15069 1562 aa47.72■■■■■ 5.23
NTHL1-203ENST00000561862 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.55■■■■■ 5.2
NTHL1-203ENST00000561862 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.48■■■■■ 5.19
NTHL1-203ENST00000561862 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.39■■■■■ 5.18
NTHL1-203ENST00000561862 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.15■■■■■ 5.14
NTHL1-203ENST00000561862 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.91■■■■■ 5.1
NTHL1-203ENST00000561862 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.39■■■■■ 5.02
NTHL1-203ENST00000561862 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.36■■■■■ 5.01
NTHL1-203ENST00000561862 SCRIBQ14160 1630 aa46.34■■■■■ 5.01
NTHL1-203ENST00000561862 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.84■■■■■ 4.93
NTHL1-203ENST00000561862 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.64■■■■■ 4.9
NTHL1-203ENST00000561862 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.16■■■■■ 4.82
NTHL1-203ENST00000561862 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.02■■■■■ 4.8
NTHL1-203ENST00000561862 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.66■■■■■ 4.74
NTHL1-203ENST00000561862 SMARCA4P51532 1647 aa44.31■■■■■ 4.68
NTHL1-203ENST00000561862 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.21■■■■■ 4.67
NTHL1-203ENST00000561862 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.02■■■■■ 4.64
NTHL1-203ENST00000561862 SMARCA2P51531 1590 aa43.98■■■■■ 4.63
NTHL1-203ENST00000561862 NCAPD3P42695 1498 aa43.98■■■■■ 4.63
NTHL1-203ENST00000561862 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.94■■■■■ 4.62
NTHL1-203ENST00000561862 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.85■■■■■ 4.61
NTHL1-203ENST00000561862 HMGXB3Q12766 1538 aa43.83■■■■■ 4.61
NTHL1-203ENST00000561862 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.66■■■■■ 4.58
NTHL1-203ENST00000561862 WIZO95785 1651 aa43.53■■■■■ 4.56
NTHL1-203ENST00000561862 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.36■■■■■ 4.53
NTHL1-203ENST00000561862 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.02■■■■■ 4.48
NTHL1-203ENST00000561862 NESP48681 1621 aa43.01■■■■■ 4.48
NTHL1-203ENST00000561862 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.91■■■■■ 4.46
NTHL1-203ENST00000561862 ERCC6Q03468 1493 aa42.84■■■■■ 4.45
NTHL1-203ENST00000561862 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.67■■■■■ 4.42
NTHL1-203ENST00000561862 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.61■■■■■ 4.41
NTHL1-203ENST00000561862 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.54■■■■■ 4.4
NTHL1-203ENST00000561862 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.46■■■■■ 4.39
NTHL1-203ENST00000561862 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.45■■■■■ 4.39
NTHL1-203ENST00000561862 CFTRP13569 1480 aa42.43■■■■■ 4.38
NTHL1-203ENST00000561862 CUX2O14529 1486 aa42.43■■■■■ 4.38
NTHL1-203ENST00000561862 PRDM2Q13029 1718 aa42.33■■■■■ 4.37
NTHL1-203ENST00000561862 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.23■■■■■ 4.35
NTHL1-203ENST00000561862 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.2■■■■■ 4.35
NTHL1-203ENST00000561862 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.16■■■■■ 4.34
NTHL1-203ENST00000561862 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.14■■■■■ 4.34
NTHL1-203ENST00000561862 WDR62O43379 1518 aa42.05■■■■■ 4.32
NTHL1-203ENST00000561862 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.85■■■■■ 4.29
NTHL1-203ENST00000561862 TOPBP1Q92547 1522 aa41.58■■■■■ 4.25
NTHL1-203ENST00000561862 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.54■■■■■ 4.24
NTHL1-203ENST00000561862 ABCC8Q09428 1581 aa41.52■■■■■ 4.24
NTHL1-203ENST00000561862 IFT140Q96RY7 1462 aa41.3■■■■■ 4.2
NTHL1-203ENST00000561862 CUX1P39880 1505 aa41.23■■■■■ 4.19
NTHL1-203ENST00000561862 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.2■■■■■ 4.19
NTHL1-203ENST00000561862 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.17■■■■■ 4.18
NTHL1-203ENST00000561862 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.15■■■■■ 4.18
NTHL1-203ENST00000561862 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.14■■■■■ 4.18
NTHL1-203ENST00000561862 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.1■■■■■ 4.17
NTHL1-203ENST00000561862 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.06■■■■■ 4.16
NTHL1-203ENST00000561862 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.02■■■■■ 4.16
NTHL1-203ENST00000561862 SOGA1O94964 1423 aa40.98■■■■■ 4.15
NTHL1-203ENST00000561862 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.92■■■■■ 4.14
NTHL1-203ENST00000561862 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.89■■■■■ 4.14
NTHL1-203ENST00000561862 WDR97A6NE52 1622 aa40.89■■■■■ 4.14
NTHL1-203ENST00000561862 SYNJ1O43426 1573 aa40.88■■■■■ 4.13
NTHL1-203ENST00000561862 TOP2BQ02880 1626 aa40.88■■■■■ 4.13
NTHL1-203ENST00000561862 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.87■■■■■ 4.13
NTHL1-203ENST00000561862 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.76■■■■■ 4.12
NTHL1-203ENST00000561862 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.68■■■■■ 4.1
NTHL1-203ENST00000561862 CHD1O14646 1710 aa40.62■■■■■ 4.09
NTHL1-203ENST00000561862 PBRM1Q86U86 1689 aa40.62■■■■■ 4.09
NTHL1-203ENST00000561862 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.6■■■■■ 4.09
NTHL1-203ENST00000561862 OSCARQ8IYS5 282 aa40.57■■■■■ 4.09
NTHL1-203ENST00000561862 GRIN2BQ13224 1484 aa40.54■■■■■ 4.08
NTHL1-203ENST00000561862 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.54■■■■■ 4.08
NTHL1-203ENST00000561862 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.53■■■■■ 4.08
NTHL1-203ENST00000561862 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.46■■■■■ 4.07
NTHL1-203ENST00000561862 FBLN2P98095 1184 aa40.34■■■■■ 4.05
NTHL1-203ENST00000561862 SYNJ2O15056 1496 aa40.3■■■■■ 4.04
NTHL1-203ENST00000561862 ADAMTS12P58397 1594 aa40.22■■■■■ 4.03
NTHL1-203ENST00000561862 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.21■■■■■ 4.03
NTHL1-203ENST00000561862 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.21■■■■■ 4.03
NTHL1-203ENST00000561862 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.09■■■■■ 4.01
NTHL1-203ENST00000561862 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.09■■■■■ 4.01
NTHL1-203ENST00000561862 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.09■■■■■ 4.01
NTHL1-203ENST00000561862 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.09■■■■■ 4.01
NTHL1-203ENST00000561862 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.05■■■■■ 4
NTHL1-203ENST00000561862 GRIN2AQ12879 1464 aa40.05■■■■■ 4
NTHL1-203ENST00000561862 ARHGEF11O15085 1522 aa40.02■■■■■ 4
NTHL1-203ENST00000561862 KIF27Q86VH2 1401 aa40.02■■■■■ 4
NTHL1-203ENST00000561862 CEP170Q5SW79 1584 aa39.9■■■■□ 3.98
NTHL1-203ENST00000561862 CUL7Q14999 1698 aa39.89■■■■□ 3.98
NTHL1-203ENST00000561862 NUP160Q12769 1436 aa39.86■■■■□ 3.97
NTHL1-203ENST00000561862 IGF1RP08069 1367 aa39.84■■■■□ 3.97
NTHL1-203ENST00000561862 TRIM41Q8WV44 630 aa39.79■■■■□ 3.96
NTHL1-203ENST00000561862 ARAP1Q96P48 1450 aa39.69■■■■□ 3.94
NTHL1-203ENST00000561862 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.68■■■■□ 3.94
NTHL1-203ENST00000561862 SHROOM2Q13796 1616 aa39.65■■■■□ 3.94
NTHL1-203ENST00000561862 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.62■■■■□ 3.93
NTHL1-203ENST00000561862 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.55■■■■□ 3.92
NTHL1-203ENST00000561862 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.54■■■■□ 3.92
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