RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561494.5

POLR3E-204, Transcript of RNA polymerase III subunit E, humanhuman

TSL 3

Gene POLR3E, Length 575 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3E-204ENST00000561494 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.29■■■■■ 5.96
POLR3E-204ENST00000561494 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.36■■■■■ 5.01
POLR3E-204ENST00000561494 ABCC9O60706 1549 aa45.43■■■■■ 4.86
POLR3E-204ENST00000561494 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.75■■■■■ 4.59
POLR3E-204ENST00000561494 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.69■■■■■ 4.58
POLR3E-204ENST00000561494 NACADO15069 1562 aa43.67■■■■■ 4.58
POLR3E-204ENST00000561494 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.52■■■■■ 4.56
POLR3E-204ENST00000561494 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.47■■■■■ 4.55
POLR3E-204ENST00000561494 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.27■■■■■ 4.52
POLR3E-204ENST00000561494 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.6■■■■■ 4.41
POLR3E-204ENST00000561494 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.55■■■■■ 4.4
POLR3E-204ENST00000561494 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.39■■■■■ 4.38
POLR3E-204ENST00000561494 SCRIBQ14160 1630 aa42.31■■■■■ 4.36
POLR3E-204ENST00000561494 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.95■■■■■ 4.31
POLR3E-204ENST00000561494 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.83■■■■■ 4.29
POLR3E-204ENST00000561494 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.25■■■■■ 4.19
POLR3E-204ENST00000561494 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.07■■■■■ 4.17
POLR3E-204ENST00000561494 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.83■■■■■ 4.13
POLR3E-204ENST00000561494 SMARCA4P51532 1647 aa40.5■■■■■ 4.07
POLR3E-204ENST00000561494 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.49■■■■■ 4.07
POLR3E-204ENST00000561494 NCAPD3P42695 1498 aa40.38■■■■■ 4.05
POLR3E-204ENST00000561494 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.37■■■■■ 4.05
POLR3E-204ENST00000561494 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.29■■■■■ 4.04
POLR3E-204ENST00000561494 SMARCA2P51531 1590 aa40.27■■■■■ 4.04
POLR3E-204ENST00000561494 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.14■■■■■ 4.02
POLR3E-204ENST00000561494 HMGXB3Q12766 1538 aa40.07■■■■■ 4.01
POLR3E-204ENST00000561494 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.98■■■■□ 3.99
POLR3E-204ENST00000561494 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.89■■■■□ 3.98
POLR3E-204ENST00000561494 WIZO95785 1651 aa39.8■■■■□ 3.96
POLR3E-204ENST00000561494 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.39■■■■□ 3.9
POLR3E-204ENST00000561494 NESP48681 1621 aa39.33■■■■□ 3.89
POLR3E-204ENST00000561494 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.21■■■■□ 3.87
POLR3E-204ENST00000561494 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.21■■■■□ 3.87
POLR3E-204ENST00000561494 ERCC6Q03468 1493 aa39.14■■■■□ 3.86
POLR3E-204ENST00000561494 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.02■■■■□ 3.84
POLR3E-204ENST00000561494 CCDC88BA6NC98 1476 aa39■■■■□ 3.83
POLR3E-204ENST00000561494 CFTRP13569 1480 aa38.94■■■■□ 3.82
POLR3E-204ENST00000561494 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.9■■■■□ 3.82
POLR3E-204ENST00000561494 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.76■■■■□ 3.8
POLR3E-204ENST00000561494 CUX2O14529 1486 aa38.75■■■■□ 3.79
POLR3E-204ENST00000561494 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.69■■■■□ 3.78
POLR3E-204ENST00000561494 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.65■■■■□ 3.78
POLR3E-204ENST00000561494 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.61■■■■□ 3.77
POLR3E-204ENST00000561494 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.56■■■■□ 3.76
POLR3E-204ENST00000561494 PRDM2Q13029 1718 aa38.45■■■■□ 3.75
POLR3E-204ENST00000561494 WDR62O43379 1518 aa38.41■■■■□ 3.74
POLR3E-204ENST00000561494 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.3■■■■□ 3.72
POLR3E-204ENST00000561494 ABCC8Q09428 1581 aa38.1■■■■□ 3.69
POLR3E-204ENST00000561494 TOPBP1Q92547 1522 aa38.07■■■■□ 3.68
POLR3E-204ENST00000561494 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.98■■■■□ 3.67
POLR3E-204ENST00000561494 IFT140Q96RY7 1462 aa37.84■■■■□ 3.65
POLR3E-204ENST00000561494 CUX1P39880 1505 aa37.78■■■■□ 3.64
POLR3E-204ENST00000561494 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.75■■■■□ 3.63
POLR3E-204ENST00000561494 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.68■■■■□ 3.62
POLR3E-204ENST00000561494 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.66■■■■□ 3.62
POLR3E-204ENST00000561494 SOGA1O94964 1423 aa37.65■■■■□ 3.62
POLR3E-204ENST00000561494 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.64■■■■□ 3.62
POLR3E-204ENST00000561494 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.62■■■■□ 3.61
POLR3E-204ENST00000561494 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.6■■■■□ 3.61
POLR3E-204ENST00000561494 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.57■■■■□ 3.6
POLR3E-204ENST00000561494 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.48■■■■□ 3.599e-7■■■□□ 16.8
POLR3E-204ENST00000561494 TOP2BQ02880 1626 aa37.43■■■■□ 3.58
POLR3E-204ENST00000561494 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.43■■■■□ 3.58
POLR3E-204ENST00000561494 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.42■■■■□ 3.58
POLR3E-204ENST00000561494 SYNJ1O43426 1573 aa37.41■■■■□ 3.58
POLR3E-204ENST00000561494 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.4■■■■□ 3.58
POLR3E-204ENST00000561494 WDR97A6NE52 1622 aa37.31■■■■□ 3.56
POLR3E-204ENST00000561494 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.31■■■■□ 3.56
POLR3E-204ENST00000561494 OSCARQ8IYS5 282 aa37.27■■■■□ 3.56
POLR3E-204ENST00000561494 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.18■■■■□ 3.54
POLR3E-204ENST00000561494 GRIN2BQ13224 1484 aa37.17■■■■□ 3.54
POLR3E-204ENST00000561494 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.08■■■■□ 3.53
POLR3E-204ENST00000561494 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.07■■■■□ 3.53
POLR3E-204ENST00000561494 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.05■■■■□ 3.52
POLR3E-204ENST00000561494 FBLN2P98095 1184 aa37.04■■■■□ 3.52
POLR3E-204ENST00000561494 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.97■■■■□ 3.51
POLR3E-204ENST00000561494 PBRM1Q86U86 1689 aa36.95■■■■□ 3.51
POLR3E-204ENST00000561494 CHD1O14646 1710 aa36.91■■■■□ 3.5
POLR3E-204ENST00000561494 SYNJ2O15056 1496 aa36.91■■■■□ 3.5
POLR3E-204ENST00000561494 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.85■■■■□ 3.49
POLR3E-204ENST00000561494 KIF27Q86VH2 1401 aa36.8■■■■□ 3.48
POLR3E-204ENST00000561494 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.76■■■■□ 3.48
POLR3E-204ENST00000561494 TRIM41Q8WV44 630 aa36.76■■■■□ 3.48
POLR3E-204ENST00000561494 IGF1RP08069 1367 aa36.72■■■■□ 3.47
POLR3E-204ENST00000561494 ADAMTS12P58397 1594 aa36.71■■■■□ 3.47
POLR3E-204ENST00000561494 GRIN2AQ12879 1464 aa36.67■■■■□ 3.46
POLR3E-204ENST00000561494 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.6■■■■□ 3.45
POLR3E-204ENST00000561494 NUP160Q12769 1436 aa36.54■■■■□ 3.44
POLR3E-204ENST00000561494 ARHGEF11O15085 1522 aa36.53■■■■□ 3.44
POLR3E-204ENST00000561494 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.5■■■■□ 3.43
POLR3E-204ENST00000561494 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.5■■■■□ 3.43
POLR3E-204ENST00000561494 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.5■■■■□ 3.43
POLR3E-204ENST00000561494 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.48■■■■□ 3.43
POLR3E-204ENST00000561494 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.47■■■■□ 3.43
POLR3E-204ENST00000561494 CUL7Q14999 1698 aa36.45■■■■□ 3.42
POLR3E-204ENST00000561494 CEP170Q5SW79 1584 aa36.44■■■■□ 3.42
POLR3E-204ENST00000561494 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.36■■■■□ 3.41
POLR3E-204ENST00000561494 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.3■■■■□ 3.4
POLR3E-204ENST00000561494 JPH4Q96JJ6 628 aa36.26■■■■□ 3.4
POLR3E-204ENST00000561494 ARAP1Q96P48 1450 aa36.24■■■■□ 3.39
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