RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561256.5

USP3-AS1-210, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene USP3-AS1, Length 562 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-210ENST00000561256 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.63■■■■■ 4.57
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USP3-AS1-210ENST00000561256 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39.26■■■■□ 3.88
USP3-AS1-210ENST00000561256 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.52■■■■□ 3.6
USP3-AS1-210ENST00000561256 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.28■■■■□ 3.56
USP3-AS1-210ENST00000561256 NACADO15069 1562 aa37.19■■■■□ 3.54
USP3-AS1-210ENST00000561256 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37■■■■□ 3.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.78■■■■□ 3.48
USP3-AS1-210ENST00000561256 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.63■■■■□ 3.45
USP3-AS1-210ENST00000561256 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.57■■■■□ 3.44
USP3-AS1-210ENST00000561256 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.4■■■■□ 3.42
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.11■■■■□ 3.37
USP3-AS1-210ENST00000561256 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa36.01■■■■□ 3.36
USP3-AS1-210ENST00000561256 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.91■■■■□ 3.34
USP3-AS1-210ENST00000561256 SCRIBQ14160 1630 aa35.79■■■■□ 3.32
USP3-AS1-210ENST00000561256 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.7■■■■□ 3.31
USP3-AS1-210ENST00000561256 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.65■■■■□ 3.3
USP3-AS1-210ENST00000561256 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.55■■■■□ 3.28
USP3-AS1-210ENST00000561256 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.44■■■■□ 3.1
USP3-AS1-210ENST00000561256 NCAPD3P42695 1498 aa34.33■■■■□ 3.09
USP3-AS1-210ENST00000561256 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.2■■■■□ 3.06
USP3-AS1-210ENST00000561256 ERCC6Q03468 1493 aa34.19■■■■□ 3.06
USP3-AS1-210ENST00000561256 CUX2O14529 1486 aa34.18■■■■□ 3.06
USP3-AS1-210ENST00000561256 SMARCA2P51531 1590 aa34.1■■■■□ 3.05
USP3-AS1-210ENST00000561256 SMARCA4P51532 1647 aa34.09■■■■□ 3.05
USP3-AS1-210ENST00000561256 HMGXB3Q12766 1538 aa34.05■■■■□ 3.04
USP3-AS1-210ENST00000561256 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.89■■■■□ 3.02
USP3-AS1-210ENST00000561256 NESP48681 1621 aa33.88■■■■□ 3.01
USP3-AS1-210ENST00000561256 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.87■■■■□ 3.01
USP3-AS1-210ENST00000561256 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.75■■■□□ 2.99
USP3-AS1-210ENST00000561256 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.61■■■□□ 2.97
USP3-AS1-210ENST00000561256 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.6■■■□□ 2.97
USP3-AS1-210ENST00000561256 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.59■■■□□ 2.97
USP3-AS1-210ENST00000561256 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.44■■■□□ 2.94
USP3-AS1-210ENST00000561256 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.43■■■□□ 2.94
USP3-AS1-210ENST00000561256 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.29■■■□□ 2.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 WIZO95785 1651 aa33.2■■■□□ 2.91
USP3-AS1-210ENST00000561256 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.16■■■□□ 2.9
USP3-AS1-210ENST00000561256 WDR62O43379 1518 aa33.07■■■□□ 2.89
USP3-AS1-210ENST00000561256 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.99■■■□□ 2.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.92■■■□□ 2.86
USP3-AS1-210ENST00000561256 TRIM41Q8WV44 630 aa32.88■■■□□ 2.85
USP3-AS1-210ENST00000561256 CFTRP13569 1480 aa32.84■■■□□ 2.85
USP3-AS1-210ENST00000561256 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.82■■■□□ 2.84
USP3-AS1-210ENST00000561256 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.77■■■□□ 2.84
USP3-AS1-210ENST00000561256 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.65■■■□□ 2.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 OSCARQ8IYS5 282 aa32.59■■■□□ 2.81
USP3-AS1-210ENST00000561256 PRDM2Q13029 1718 aa32.49■■■□□ 2.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.4■■■□□ 2.78
USP3-AS1-210ENST00000561256 IFT140Q96RY7 1462 aa32.33■■■□□ 2.77
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.29■■■□□ 2.76
USP3-AS1-210ENST00000561256 TOPBP1Q92547 1522 aa32.26■■■□□ 2.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 ABCC8Q09428 1581 aa32.18■■■□□ 2.74
USP3-AS1-210ENST00000561256 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.18■■■□□ 2.74
USP3-AS1-210ENST00000561256 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.18■■■□□ 2.74
USP3-AS1-210ENST00000561256 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.18■■■□□ 2.74
USP3-AS1-210ENST00000561256 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.11■■■□□ 2.73
USP3-AS1-210ENST00000561256 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.11■■■□□ 2.73
USP3-AS1-210ENST00000561256 ARHGEF11O15085 1522 aa32.06■■■□□ 2.72
USP3-AS1-210ENST00000561256 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.97■■■□□ 2.71
USP3-AS1-210ENST00000561256 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.97■■■□□ 2.71
USP3-AS1-210ENST00000561256 CHD1O14646 1710 aa31.92■■■□□ 2.7
USP3-AS1-210ENST00000561256 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.91■■■□□ 2.7
USP3-AS1-210ENST00000561256 FBLN2P98095 1184 aa31.86■■■□□ 2.69
USP3-AS1-210ENST00000561256 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.86■■■□□ 2.69
USP3-AS1-210ENST00000561256 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.8■■■□□ 2.68
USP3-AS1-210ENST00000561256 SOGA1O94964 1423 aa31.77■■■□□ 2.68
USP3-AS1-210ENST00000561256 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.74■■■□□ 2.67
USP3-AS1-210ENST00000561256 ARAP1Q96P48 1450 aa31.72■■■□□ 2.67
USP3-AS1-210ENST00000561256 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.68■■■□□ 2.66
USP3-AS1-210ENST00000561256 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.65■■■□□ 2.66
USP3-AS1-210ENST00000561256 WDR97A6NE52 1622 aa31.64■■■□□ 2.66
USP3-AS1-210ENST00000561256 TRHP20396 242 aaPredicted RBP31.61■■■□□ 2.65
USP3-AS1-210ENST00000561256 CUX1P39880 1505 aa31.6■■■□□ 2.65
USP3-AS1-210ENST00000561256 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.57■■■□□ 2.64
USP3-AS1-210ENST00000561256 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.55■■■□□ 2.64
USP3-AS1-210ENST00000561256 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.53■■■□□ 2.64
USP3-AS1-210ENST00000561256 GRIN2BQ13224 1484 aa31.52■■■□□ 2.64
USP3-AS1-210ENST00000561256 SYNJ1O43426 1573 aa31.52■■■□□ 2.64
USP3-AS1-210ENST00000561256 SYNJ2O15056 1496 aa31.46■■■□□ 2.63
USP3-AS1-210ENST00000561256 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.38■■■□□ 2.61
USP3-AS1-210ENST00000561256 PBRM1Q86U86 1689 aa31.38■■■□□ 2.61
USP3-AS1-210ENST00000561256 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.29■■■□□ 2.6
USP3-AS1-210ENST00000561256 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.27■■■□□ 2.6
USP3-AS1-210ENST00000561256 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.23■■■□□ 2.59
USP3-AS1-210ENST00000561256 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.14■■■□□ 2.58
USP3-AS1-210ENST00000561256 GRIN2AQ12879 1464 aa31.12■■■□□ 2.57
USP3-AS1-210ENST00000561256 ADAMTS12P58397 1594 aa31.07■■■□□ 2.56
USP3-AS1-210ENST00000561256 TOP2BQ02880 1626 aa31.02■■■□□ 2.56
USP3-AS1-210ENST00000561256 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.02■■■□□ 2.56
USP3-AS1-210ENST00000561256 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.02■■■□□ 2.56
USP3-AS1-210ENST00000561256 NUP160Q12769 1436 aa31.01■■■□□ 2.55
USP3-AS1-210ENST00000561256 CEP170Q5SW79 1584 aa31■■■□□ 2.55
USP3-AS1-210ENST00000561256 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.98■■■□□ 2.55
USP3-AS1-210ENST00000561256 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.91■■■□□ 2.54
USP3-AS1-210ENST00000561256 SHROOM2Q13796 1616 aa30.9■■■□□ 2.54
USP3-AS1-210ENST00000561256 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP30.89■■■□□ 2.54
USP3-AS1-210ENST00000561256 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.75■■■□□ 2.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 JPH4Q96JJ6 628 aa30.71■■■□□ 2.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.63■■■□□ 2.49
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