RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561181.5

SMPD5-202, Transcript of sphingomyelin phosphodiesterase 5, humanhuman

TSL 5

Gene SMPD5, Length 1,279 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD5-202ENST00000561181 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.61■■■■■ 7.13
SMPD5-202ENST00000561181 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.38■■■■■ 6.14
SMPD5-202ENST00000561181 ABCC9O60706 1549 aa52.94■■■■■ 6.07
SMPD5-202ENST00000561181 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.63■■■■■ 5.7
SMPD5-202ENST00000561181 NACADO15069 1562 aa50.42■■■■■ 5.66
SMPD5-202ENST00000561181 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.09■■■■■ 5.61
SMPD5-202ENST00000561181 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.91■■■■■ 5.58
SMPD5-202ENST00000561181 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.57■■■■■ 5.53
SMPD5-202ENST00000561181 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.47■■■■■ 5.51
SMPD5-202ENST00000561181 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.38■■■■■ 5.5
SMPD5-202ENST00000561181 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.34■■■■■ 5.49
SMPD5-202ENST00000561181 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.25■■■■■ 5.47
SMPD5-202ENST00000561181 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.01■■■■■ 5.44
SMPD5-202ENST00000561181 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.65■■■■■ 5.38
SMPD5-202ENST00000561181 SCRIBQ14160 1630 aa48.5■■■■■ 5.36
SMPD5-202ENST00000561181 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.87■■■■■ 5.25
SMPD5-202ENST00000561181 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.83■■■■■ 5.25
SMPD5-202ENST00000561181 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.72■■■■■ 5.23
SMPD5-202ENST00000561181 NCAPD3P42695 1498 aa46.51■■■■■ 5.04
SMPD5-202ENST00000561181 SMARCA4P51532 1647 aa46.39■■■■■ 5.02
SMPD5-202ENST00000561181 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.37■■■■■ 5.01
SMPD5-202ENST00000561181 SMARCA2P51531 1590 aa46.34■■■■■ 5.01
SMPD5-202ENST00000561181 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.3■■■■■ 5
SMPD5-202ENST00000561181 HMGXB3Q12766 1538 aa46.19■■■■■ 4.99
SMPD5-202ENST00000561181 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.01■■■■■ 4.96
SMPD5-202ENST00000561181 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.95■■■■■ 4.95
SMPD5-202ENST00000561181 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.85■■■■■ 4.93
SMPD5-202ENST00000561181 ERCC6Q03468 1493 aa45.75■■■■■ 4.91
SMPD5-202ENST00000561181 CUX2O14529 1486 aa45.69■■■■■ 4.91
SMPD5-202ENST00000561181 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.58■■■■■ 4.89
SMPD5-202ENST00000561181 NESP48681 1621 aa45.47■■■■■ 4.87
SMPD5-202ENST00000561181 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.4■■■■■ 4.86
SMPD5-202ENST00000561181 WIZO95785 1651 aa45.3■■■■■ 4.84
SMPD5-202ENST00000561181 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.17■■■■■ 4.82
SMPD5-202ENST00000561181 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.11■■■■■ 4.81
SMPD5-202ENST00000561181 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.1■■■■■ 4.81
SMPD5-202ENST00000561181 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.07■■■■■ 4.8
SMPD5-202ENST00000561181 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.95■■■■■ 4.79
SMPD5-202ENST00000561181 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.85■■■■■ 4.77
SMPD5-202ENST00000561181 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.67■■■■■ 4.74
SMPD5-202ENST00000561181 CFTRP13569 1480 aa44.66■■■■■ 4.74
SMPD5-202ENST00000561181 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.58■■■■■ 4.73
SMPD5-202ENST00000561181 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.54■■■■■ 4.72
SMPD5-202ENST00000561181 WDR62O43379 1518 aa44.54■■■■■ 4.72
SMPD5-202ENST00000561181 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.31■■■■■ 4.68
SMPD5-202ENST00000561181 PRDM2Q13029 1718 aa44.23■■■■■ 4.67
SMPD5-202ENST00000561181 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.09■■■■■ 4.65
SMPD5-202ENST00000561181 ABCC8Q09428 1581 aa43.84■■■■■ 4.61
SMPD5-202ENST00000561181 TOPBP1Q92547 1522 aa43.73■■■■■ 4.59
SMPD5-202ENST00000561181 IFT140Q96RY7 1462 aa43.71■■■■■ 4.59
SMPD5-202ENST00000561181 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.63■■■■■ 4.58
SMPD5-202ENST00000561181 OSCARQ8IYS5 282 aa43.58■■■■■ 4.57
SMPD5-202ENST00000561181 TRIM41Q8WV44 630 aa43.55■■■■■ 4.56
SMPD5-202ENST00000561181 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.46■■■■■ 4.55
SMPD5-202ENST00000561181 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.33■■■■■ 4.53
SMPD5-202ENST00000561181 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.3■■■■■ 4.52
SMPD5-202ENST00000561181 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.3■■■■■ 4.52
SMPD5-202ENST00000561181 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.27■■■■■ 4.52
SMPD5-202ENST00000561181 SOGA1O94964 1423 aa43.15■■■■■ 4.5
SMPD5-202ENST00000561181 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.14■■■■■ 4.5
SMPD5-202ENST00000561181 CUX1P39880 1505 aa43.07■■■■■ 4.49
SMPD5-202ENST00000561181 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.07■■■■■ 4.49
SMPD5-202ENST00000561181 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.07■■■■■ 4.49
SMPD5-202ENST00000561181 WDR97A6NE52 1622 aa43.05■■■■■ 4.48
SMPD5-202ENST00000561181 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43■■■■■ 4.47
SMPD5-202ENST00000561181 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43■■■■■ 4.47
SMPD5-202ENST00000561181 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43■■■■■ 4.47
SMPD5-202ENST00000561181 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.95■■■■■ 4.47
SMPD5-202ENST00000561181 CHD1O14646 1710 aa42.89■■■■■ 4.46
SMPD5-202ENST00000561181 ARHGEF11O15085 1522 aa42.87■■■■■ 4.45
SMPD5-202ENST00000561181 FBLN2P98095 1184 aa42.82■■■■■ 4.45
SMPD5-202ENST00000561181 GRIN2BQ13224 1484 aa42.76■■■■■ 4.44
SMPD5-202ENST00000561181 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.75■■■■■ 4.43
SMPD5-202ENST00000561181 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.73■■■■■ 4.43
SMPD5-202ENST00000561181 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.68■■■■■ 4.42
SMPD5-202ENST00000561181 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.65■■■■■ 4.42
SMPD5-202ENST00000561181 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.64■■■■■ 4.42
SMPD5-202ENST00000561181 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.62■■■■■ 4.41
SMPD5-202ENST00000561181 SYNJ2O15056 1496 aa42.57■■■■■ 4.41
SMPD5-202ENST00000561181 TOP2BQ02880 1626 aa42.55■■■■■ 4.4
SMPD5-202ENST00000561181 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.53■■■■■ 4.4
SMPD5-202ENST00000561181 PBRM1Q86U86 1689 aa42.52■■■■■ 4.4
SMPD5-202ENST00000561181 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.52■■■■■ 4.4
SMPD5-202ENST00000561181 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.52■■■■■ 4.4
SMPD5-202ENST00000561181 SYNJ1O43426 1573 aa42.51■■■■■ 4.4
SMPD5-202ENST00000561181 ARAP1Q96P48 1450 aa42.43■■■■■ 4.38
SMPD5-202ENST00000561181 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.43■■■■■ 4.38
SMPD5-202ENST00000561181 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.18■■■■■ 4.34
SMPD5-202ENST00000561181 GRIN2AQ12879 1464 aa42.17■■■■■ 4.34
SMPD5-202ENST00000561181 ADAMTS12P58397 1594 aa42.16■■■■■ 4.34
SMPD5-202ENST00000561181 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.15■■■■■ 4.34
SMPD5-202ENST00000561181 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.05■■■■■ 4.32
SMPD5-202ENST00000561181 NUP160Q12769 1436 aa42.04■■■■■ 4.32
SMPD5-202ENST00000561181 CEP170Q5SW79 1584 aa41.93■■■■■ 4.3
SMPD5-202ENST00000561181 KIF27Q86VH2 1401 aa41.79■■■■■ 4.28
SMPD5-202ENST00000561181 SHROOM2Q13796 1616 aa41.78■■■■■ 4.28
SMPD5-202ENST00000561181 IGF1RP08069 1367 aa41.69■■■■■ 4.26
SMPD5-202ENST00000561181 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.67■■■■■ 4.26
SMPD5-202ENST00000561181 JPH4Q96JJ6 628 aa41.64■■■■■ 4.26
SMPD5-202ENST00000561181 CUL7Q14999 1698 aa41.62■■■■■ 4.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.2 ms