RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560622.5

USP3-AS1-207, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 508 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-207ENST00000560622 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.19■■■■■ 4.18
USP3-AS1-207ENST00000560622 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.05■■■■□ 3.52
USP3-AS1-207ENST00000560622 ABCC9O60706 1549 aa36.98■■■■□ 3.51
USP3-AS1-207ENST00000560622 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.18■■■■□ 3.22
USP3-AS1-207ENST00000560622 NACADO15069 1562 aa34.95■■■■□ 3.18
USP3-AS1-207ENST00000560622 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.84■■■■□ 3.17
USP3-AS1-207ENST00000560622 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.68■■■■□ 3.14
USP3-AS1-207ENST00000560622 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.5■■■■□ 3.11
USP3-AS1-207ENST00000560622 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.47■■■■□ 3.11
USP3-AS1-207ENST00000560622 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.36■■■■□ 3.09
USP3-AS1-207ENST00000560622 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.35■■■■□ 3.09
USP3-AS1-207ENST00000560622 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.15■■■■□ 3.06
USP3-AS1-207ENST00000560622 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.04■■■■□ 3.04
USP3-AS1-207ENST00000560622 SCRIBQ14160 1630 aa33.71■■■□□ 2.99
USP3-AS1-207ENST00000560622 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.7■■■□□ 2.99
USP3-AS1-207ENST00000560622 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.5■■■□□ 2.95
USP3-AS1-207ENST00000560622 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.39■■■□□ 2.94
USP3-AS1-207ENST00000560622 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.31■■■□□ 2.92
USP3-AS1-207ENST00000560622 NCAPD3P42695 1498 aa32.27■■■□□ 2.76
USP3-AS1-207ENST00000560622 SMARCA4P51532 1647 aa32.18■■■□□ 2.74
USP3-AS1-207ENST00000560622 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.17■■■□□ 2.74
USP3-AS1-207ENST00000560622 HMGXB3Q12766 1538 aa32.06■■■□□ 2.72
USP3-AS1-207ENST00000560622 SMARCA2P51531 1590 aa32.03■■■□□ 2.72
USP3-AS1-207ENST00000560622 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.93■■■□□ 2.7
USP3-AS1-207ENST00000560622 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.91■■■□□ 2.7
USP3-AS1-207ENST00000560622 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.9■■■□□ 2.7
USP3-AS1-207ENST00000560622 CUX2O14529 1486 aa31.89■■■□□ 2.7
USP3-AS1-207ENST00000560622 NESP48681 1621 aa31.83■■■□□ 2.69
USP3-AS1-207ENST00000560622 ERCC6Q03468 1493 aa31.81■■■□□ 2.68
USP3-AS1-207ENST00000560622 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.78■■■□□ 2.68
USP3-AS1-207ENST00000560622 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.77■■■□□ 2.68
USP3-AS1-207ENST00000560622 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.6■■■□□ 2.65
USP3-AS1-207ENST00000560622 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.56■■■□□ 2.64
USP3-AS1-207ENST00000560622 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.51■■■□□ 2.63
USP3-AS1-207ENST00000560622 WIZO95785 1651 aa31.42■■■□□ 2.62
USP3-AS1-207ENST00000560622 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.25■■■□□ 2.59
USP3-AS1-207ENST00000560622 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.22■■■□□ 2.59
USP3-AS1-207ENST00000560622 WDR62O43379 1518 aa31.08■■■□□ 2.57
USP3-AS1-207ENST00000560622 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.07■■■□□ 2.56
USP3-AS1-207ENST00000560622 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.04■■■□□ 2.56
USP3-AS1-207ENST00000560622 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 CFTRP13569 1480 aa30.92■■■□□ 2.54
USP3-AS1-207ENST00000560622 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.9■■■□□ 2.54
USP3-AS1-207ENST00000560622 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.89■■■□□ 2.54
USP3-AS1-207ENST00000560622 PRDM2Q13029 1718 aa30.78■■■□□ 2.52
USP3-AS1-207ENST00000560622 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.73■■■□□ 2.51
USP3-AS1-207ENST00000560622 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.59■■■□□ 2.49
USP3-AS1-207ENST00000560622 TRIM41Q8WV44 630 aa30.35■■■□□ 2.45
USP3-AS1-207ENST00000560622 TOPBP1Q92547 1522 aa30.35■■■□□ 2.45
USP3-AS1-207ENST00000560622 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
USP3-AS1-207ENST00000560622 IFT140Q96RY7 1462 aa30.29■■■□□ 2.44
USP3-AS1-207ENST00000560622 OSCARQ8IYS5 282 aa30.28■■■□□ 2.44
USP3-AS1-207ENST00000560622 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.24■■■□□ 2.43
USP3-AS1-207ENST00000560622 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.43
USP3-AS1-207ENST00000560622 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
USP3-AS1-207ENST00000560622 ABCC8Q09428 1581 aa30.16■■■□□ 2.42
USP3-AS1-207ENST00000560622 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.14■■■□□ 2.41
USP3-AS1-207ENST00000560622 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.14■■■□□ 2.41
USP3-AS1-207ENST00000560622 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.14■■■□□ 2.41
USP3-AS1-207ENST00000560622 CHD1O14646 1710 aa30.05■■■□□ 2.4
USP3-AS1-207ENST00000560622 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
USP3-AS1-207ENST00000560622 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30■■■□□ 2.39
USP3-AS1-207ENST00000560622 ARHGEF11O15085 1522 aa29.97■■■□□ 2.39
USP3-AS1-207ENST00000560622 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.93■■■□□ 2.38
USP3-AS1-207ENST00000560622 CUX1P39880 1505 aa29.85■■■□□ 2.37
USP3-AS1-207ENST00000560622 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.82■■■□□ 2.36
USP3-AS1-207ENST00000560622 SOGA1O94964 1423 aa29.8■■■□□ 2.36
USP3-AS1-207ENST00000560622 WDR97A6NE52 1622 aa29.78■■■□□ 2.36
USP3-AS1-207ENST00000560622 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
USP3-AS1-207ENST00000560622 ARAP1Q96P48 1450 aa29.71■■■□□ 2.35
USP3-AS1-207ENST00000560622 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.7■■■□□ 2.35
USP3-AS1-207ENST00000560622 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.67■■■□□ 2.34
USP3-AS1-207ENST00000560622 PBRM1Q86U86 1689 aa29.62■■■□□ 2.33
USP3-AS1-207ENST00000560622 FBLN2P98095 1184 aa29.61■■■□□ 2.33
USP3-AS1-207ENST00000560622 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
USP3-AS1-207ENST00000560622 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.59■■■□□ 2.33
USP3-AS1-207ENST00000560622 GRIN2BQ13224 1484 aa29.57■■■□□ 2.32
USP3-AS1-207ENST00000560622 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.54■■■□□ 2.32
USP3-AS1-207ENST00000560622 SYNJ1O43426 1573 aa29.52■■■□□ 2.32
USP3-AS1-207ENST00000560622 SYNJ2O15056 1496 aa29.5■■■□□ 2.31
USP3-AS1-207ENST00000560622 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.5■■■□□ 2.31
USP3-AS1-207ENST00000560622 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.47■■■□□ 2.31
USP3-AS1-207ENST00000560622 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
USP3-AS1-207ENST00000560622 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
USP3-AS1-207ENST00000560622 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.4■■■□□ 2.3
USP3-AS1-207ENST00000560622 TOP2BQ02880 1626 aa29.34■■■□□ 2.29
USP3-AS1-207ENST00000560622 ADAMTS12P58397 1594 aa29.29■■■□□ 2.28
USP3-AS1-207ENST00000560622 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.25■■■□□ 2.27
USP3-AS1-207ENST00000560622 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.24■■■□□ 2.27
USP3-AS1-207ENST00000560622 GRIN2AQ12879 1464 aa29.23■■■□□ 2.27
USP3-AS1-207ENST00000560622 CEP170Q5SW79 1584 aa29.22■■■□□ 2.27
USP3-AS1-207ENST00000560622 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
USP3-AS1-207ENST00000560622 NUP160Q12769 1436 aa29.17■■■□□ 2.26
USP3-AS1-207ENST00000560622 SHROOM2Q13796 1616 aa29.15■■■□□ 2.26
USP3-AS1-207ENST00000560622 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.1■■■□□ 2.25
USP3-AS1-207ENST00000560622 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.08■■■□□ 2.25
USP3-AS1-207ENST00000560622 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.89■■■□□ 2.21
USP3-AS1-207ENST00000560622 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.84■■■□□ 2.21
USP3-AS1-207ENST00000560622 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
USP3-AS1-207ENST00000560622 JPH4Q96JJ6 628 aa28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.6 ms