RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560587.1

ZNF280D-215, Transcript of zinc finger protein 280D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ZNF280D, Length 1,441 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF280D-215ENST00000560587 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.82■■■■■ 7.33
ZNF280D-215ENST00000560587 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54.27■■■■■ 6.28
ZNF280D-215ENST00000560587 ABCC9O60706 1549 aa53.28■■■■■ 6.12
ZNF280D-215ENST00000560587 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.19■■■■■ 5.78
ZNF280D-215ENST00000560587 NACADO15069 1562 aa51.04■■■■■ 5.76
ZNF280D-215ENST00000560587 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.86■■■■■ 5.73
ZNF280D-215ENST00000560587 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.64■■■■■ 5.7
ZNF280D-215ENST00000560587 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.63■■■■■ 5.7
ZNF280D-215ENST00000560587 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.32■■■■■ 5.65
ZNF280D-215ENST00000560587 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.02■■■■■ 5.6
ZNF280D-215ENST00000560587 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.68■■■■■ 5.54
ZNF280D-215ENST00000560587 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.6■■■■■ 5.53
ZNF280D-215ENST00000560587 SCRIBQ14160 1630 aa49.46■■■■■ 5.51
ZNF280D-215ENST00000560587 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.13■■■■■ 5.46
ZNF280D-215ENST00000560587 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.05■■■■■ 5.44
ZNF280D-215ENST00000560587 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.34■■■■■ 5.33
ZNF280D-215ENST00000560587 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.22■■■■■ 5.31
ZNF280D-215ENST00000560587 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.92■■■■■ 5.26
ZNF280D-215ENST00000560587 SMARCA4P51532 1647 aa47.28■■■■■ 5.16
ZNF280D-215ENST00000560587 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.2■■■■■ 5.15
ZNF280D-215ENST00000560587 NCAPD3P42695 1498 aa47.06■■■■■ 5.12
ZNF280D-215ENST00000560587 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.05■■■■■ 5.12
ZNF280D-215ENST00000560587 SMARCA2P51531 1590 aa47.03■■■■■ 5.12
ZNF280D-215ENST00000560587 HMGXB3Q12766 1538 aa46.87■■■■■ 5.09
ZNF280D-215ENST00000560587 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.86■■■■■ 5.09
ZNF280D-215ENST00000560587 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.82■■■■■ 5.09
ZNF280D-215ENST00000560587 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.69■■■■■ 5.07
ZNF280D-215ENST00000560587 WIZO95785 1651 aa46.35■■■■■ 5.01
ZNF280D-215ENST00000560587 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.2■■■■■ 4.99
ZNF280D-215ENST00000560587 NESP48681 1621 aa46.02■■■■■ 4.96
ZNF280D-215ENST00000560587 ERCC6Q03468 1493 aa45.99■■■■■ 4.95
ZNF280D-215ENST00000560587 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.91■■■■■ 4.94
ZNF280D-215ENST00000560587 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.87■■■■■ 4.93
ZNF280D-215ENST00000560587 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.67■■■■■ 4.9
ZNF280D-215ENST00000560587 CUX2O14529 1486 aa45.59■■■■■ 4.89
ZNF280D-215ENST00000560587 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.58■■■■■ 4.89
ZNF280D-215ENST00000560587 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.52■■■■■ 4.88
ZNF280D-215ENST00000560587 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.44■■■■■ 4.87
ZNF280D-215ENST00000560587 CFTRP13569 1480 aa45.36■■■■■ 4.85
ZNF280D-215ENST00000560587 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.28■■■■■ 4.84
ZNF280D-215ENST00000560587 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.18■■■■■ 4.82
ZNF280D-215ENST00000560587 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.17■■■■■ 4.82
ZNF280D-215ENST00000560587 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.15■■■■■ 4.82
ZNF280D-215ENST00000560587 PRDM2Q13029 1718 aa45.08■■■■■ 4.81
ZNF280D-215ENST00000560587 WDR62O43379 1518 aa45.03■■■■■ 4.8
ZNF280D-215ENST00000560587 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.8■■■■■ 4.76
ZNF280D-215ENST00000560587 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.73■■■■■ 4.75
ZNF280D-215ENST00000560587 TOPBP1Q92547 1522 aa44.43■■■■■ 4.7
ZNF280D-215ENST00000560587 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.42■■■■■ 4.7
ZNF280D-215ENST00000560587 ABCC8Q09428 1581 aa44.41■■■■■ 4.7
ZNF280D-215ENST00000560587 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.38■■■■■ 4.69
ZNF280D-215ENST00000560587 IFT140Q96RY7 1462 aa44.22■■■■■ 4.67
ZNF280D-215ENST00000560587 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.03■■■■■ 4.64
ZNF280D-215ENST00000560587 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.02■■■■■ 4.64
ZNF280D-215ENST00000560587 CUX1P39880 1505 aa43.99■■■■■ 4.63
ZNF280D-215ENST00000560587 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.97■■■■■ 4.63
ZNF280D-215ENST00000560587 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.9■■■■■ 4.62
ZNF280D-215ENST00000560587 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.89■■■■■ 4.62
ZNF280D-215ENST00000560587 SOGA1O94964 1423 aa43.81■■■■■ 4.6
ZNF280D-215ENST00000560587 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.81■■■■■ 4.6
ZNF280D-215ENST00000560587 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.72■■■■■ 4.59
ZNF280D-215ENST00000560587 WDR97A6NE52 1622 aa43.65■■■■■ 4.58
ZNF280D-215ENST00000560587 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.61■■■■■ 4.57
ZNF280D-215ENST00000560587 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.59■■■■■ 4.57
ZNF280D-215ENST00000560587 OSCARQ8IYS5 282 aa43.58■■■■■ 4.57
ZNF280D-215ENST00000560587 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.57■■■■■ 4.56
ZNF280D-215ENST00000560587 TOP2BQ02880 1626 aa43.56■■■■■ 4.56
ZNF280D-215ENST00000560587 SYNJ1O43426 1573 aa43.52■■■■■ 4.56
ZNF280D-215ENST00000560587 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.45■■■■■ 4.55
ZNF280D-215ENST00000560587 CHD1O14646 1710 aa43.39■■■■■ 4.54
ZNF280D-215ENST00000560587 GRIN2BQ13224 1484 aa43.37■■■■■ 4.53
ZNF280D-215ENST00000560587 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.35■■■■■ 4.53
ZNF280D-215ENST00000560587 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.34■■■■■ 4.53
ZNF280D-215ENST00000560587 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.33■■■■■ 4.53
ZNF280D-215ENST00000560587 PBRM1Q86U86 1689 aa43.32■■■■■ 4.52
ZNF280D-215ENST00000560587 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.3■■■■■ 4.52
ZNF280D-215ENST00000560587 FBLN2P98095 1184 aa43.25■■■■■ 4.51
ZNF280D-215ENST00000560587 SYNJ2O15056 1496 aa43.13■■■■■ 4.49
ZNF280D-215ENST00000560587 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.09■■■■■ 4.49
ZNF280D-215ENST00000560587 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.98■■■■■ 4.47
ZNF280D-215ENST00000560587 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.98■■■■■ 4.47
ZNF280D-215ENST00000560587 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.98■■■■■ 4.47
ZNF280D-215ENST00000560587 ARHGEF11O15085 1522 aa42.95■■■■■ 4.47
ZNF280D-215ENST00000560587 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.95■■■■■ 4.47
ZNF280D-215ENST00000560587 ADAMTS12P58397 1594 aa42.94■■■■■ 4.47
ZNF280D-215ENST00000560587 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.89■■■■■ 4.46
ZNF280D-215ENST00000560587 TRIM41Q8WV44 630 aa42.88■■■■■ 4.46
ZNF280D-215ENST00000560587 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.82■■■■■ 4.45
ZNF280D-215ENST00000560587 GRIN2AQ12879 1464 aa42.82■■■■■ 4.44
ZNF280D-215ENST00000560587 KIF27Q86VH2 1401 aa42.72■■■■■ 4.43
ZNF280D-215ENST00000560587 NUP160Q12769 1436 aa42.63■■■■■ 4.41
ZNF280D-215ENST00000560587 CEP170Q5SW79 1584 aa42.62■■■■■ 4.41
ZNF280D-215ENST00000560587 ARAP1Q96P48 1450 aa42.57■■■■■ 4.41
ZNF280D-215ENST00000560587 CUL7Q14999 1698 aa42.53■■■■■ 4.4
ZNF280D-215ENST00000560587 IGF1RP08069 1367 aa42.52■■■■■ 4.4
ZNF280D-215ENST00000560587 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.49■■■■■ 4.39
ZNF280D-215ENST00000560587 SHROOM2Q13796 1616 aa42.37■■■■■ 4.37
ZNF280D-215ENST00000560587 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.33■■■■■ 4.37
ZNF280D-215ENST00000560587 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.28■■■■■ 4.36
ZNF280D-215ENST00000560587 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.25■■■■■ 4.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.5 ms